Différence clé - RNASE A vs RNASE H
Les ribonucléases sont des nucléases qui dégradent spécifiquement l'ARN en unités plus petites. Ils peuvent être divisés en deux catégories; endoribonucléases et exoribonucléases. L'endoribonucléase est une endonucléase qui peut dégrader l'ARN simple brin ou double brin. Il clive les liaisons phosphodiester au sein d'une chaîne polynucléotidique d'ARN. Les exemples sont la RNase A, la RNase III, la RNase T1, la RNase P et la RNase H. L'exoribonucléase est une exonucléase qui dégrade l'ARN en supprimant les nucléotides terminaux de l'extrémité 5 ou 3 de la molécule d'ARN. Les exemples sont la RNase R, la RNase II, la RNase D et la RNase PH.le différence clé entre RNASE A et RNASE H est que la RNase A est une ribonucléase pancréatique qui dégrade spécifiquement l'ARN simple brin en composants plus petits, tandis que la RNase H est une enzyme non spécifique qui clive l'ARN dans l'hybride ARN-ADN en unités plus petites via le mécanisme hydrolytique.
Qu'est-ce que la RNASE A ?
La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui clive spécifiquement les résidus cytosine et uracile non appariés à l'extrémité 3' de l'ARN simple brin. La RNase H fonctionne à une concentration de sel plus élevée (concentration de NaCl de 0,3 M ou plus). La réaction hydrolytique est en deux étapes. Il forme un produit phosphorylé en 3' via un intermédiaire monophosphate cyclique en 2', 3'. Bien qu'il soit spécifique à l'ARN simple brin à une concentration de sel plus élevée, il peut également dégrader l'ARN double brin et l'ARN dans l'hybride ARN-ADN à une concentration de NaCl inférieure (inférieure à 0,3 M de NaCl).
Bruce Merrifield a été le premier à synthétiser cette enzyme. La RNase A est une enzyme très populaire dans la recherche moléculaire. La RNase A pancréatique bovine est un exemple de RNase A. Et c'est l'une des enzymes les plus résistantes utilisées en laboratoire. Cette enzyme n'a pas besoin de cofacteur pour son activité. C'est une enzyme hautement thermostable. La RNase A est la première enzyme et la troisième protéine pour lesquelles une séquence d'acides aminés correcte a été détectée. Cette enzyme est très petite avec 124 acides aminés et une masse moléculaire de 12600da. Et il a quatre résidus histidine (His 12 et His 119 qui interviennent dans la réaction catalytique).
Figure 01: La RNase A
RNase A peut être isolée en faisant bouillir un échantillon brut. Lorsqu'elles bout, toutes les autres enzymes dégradent la RNase A restante. La RNase A est une enzyme étonnamment stable. Cette enzyme inhibe avec la protéine inhibitrice de la ribonucléase, les complexes de métaux lourds et de vanadate d'uridine.
Qu'est-ce que la RNase H ?
La RNase H est une enzyme ribonucléase non spécifique qui peut dégrader l'ARN dans l'hybride ARN-ADN par réaction hydrolytique. La RNase H clive la liaison 3'-OP de l'ARN dans un hybride ARN-ADN. En fin de compte, il produit des produits à terminaison phosphate 3'OH et 5'. Dans la réplication de l'ADN, il joue un rôle central en éliminant l'amorce d'ARN après la formation de nouveaux brins d'ADN. Dans des conditions de laboratoire, il dégrade spécifiquement l'ARN dans l'hybride ARN-ADN mais pas l'ADN et l'ARN non hybride. Et cette enzyme est généralement utilisée pour détruire la matrice d'ARN après la formation du premier brin d'ADN complémentaire pendant la synthèse de l'ADNc.
Figure 02: RNase H
RNase H est également utilisé dans les tests de protection contre les nucléases. Il peut également être incorporé à l'élimination de la queue poly A de l'ARNm. La RNase H a la capacité de détruire l'ARN non codant à l'intérieur et à l'extérieur de la cellule. Les ions métalliques sont nécessaires comme cofacteurs pour cette activité protéique. Un chélateur (EDTA) peut être utilisé pour inhiber l'enzyme RNase H.
Quelles sont les similitudes entre la RNASE A et la RNASE H ?
- Les deux sont de nature protéique.
- Les deux sont des endoribonucléases
- Les deux peuvent dégrader l'ARN.
- Les deux effectuent des réactions hydrolytiques.
- Les laboratoires moléculaires utilisent les deux.
Quelle est la différence entre la RNASE A et la RNASE H ?
RNASE A vs RNASE H |
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| RNase A est une ribonucléase pancréatique qui clive spécifiquement l'extrémité 3' des résidus cytosine et uracile non appariés de l'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée. | RNase H est une enzyme ribonucléase non spécifique qui peut dégrader l'ARN dans l'hybride ARN-ADN par réaction hydrolytique. |
| Nature du clivage de l'ARN | |
| La RNase A clive spécifiquement l'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée. | La RNase H clive l'ARN dans l'hybride ARN-ADN. |
| Besoin de cofacteurs pour l'activité | |
| RNase A n'a pas besoin de cofacteurs pour son activité. | La RNase H a besoin d'ions métalliques comme cofacteurs pour son activité. |
| Inhibiteurs de l'activité protéique | |
| La protéine inhibitrice de la ribonucléase, les complexes de métaux lourds et de vanadate d'uridine inhibent l'activité de la RNAse A. | Un chélateur (EDTA) inhibe l'activité de la RNase H. |
| Élimination des amorces d'ARN dans la réplication de l'ADN | |
| La RNase A n'est pas utilisée pour l'élimination des amorces d'ARN dans la réplication de l'ADN. | La RNase H est utilisée pour l'élimination des amorces d'ARN dans la réplication de l'ADN |
| DNA Template Removal in Complementary DNA (C-DNA) Synthesis | |
| La RNase A n'est pas utilisée pour l'élimination de la matrice d'ARN lors de la synthèse d'ADN complémentaire (ADN-C). | La RNase H est utilisée pour l'élimination de la matrice d'ARN lors de la synthèse d'ADN complémentaire (ADN-C). |
| Retrait de Poly-A-Tail dans l'ARNm Hybridé à Oligo (dt) | |
| La RNase A n'est pas utilisée pour éliminer la "queue poly-A" dans l'ARNm hybride à l'oligo (dt). | La RNase H est utilisée pour éliminer la "queue poly-A" dans l'ARNm hybride à l'oligo (dt) |
Résumé - RNASE A vs RNASE H
Les ribonucléases sont des enzymes nucléases qui ont la capacité de cliver l'ARN en unités plus petites. Ils sont de deux types; endoribonucléases et exoribonucléases. L'endoribonucléase est une endonucléase qui a la capacité de dégrader l'ARN simple brin ou double brin. Et il clive la liaison phosphodiester dans une chaîne polynucléotidique d'ARN. La RNase A et la RNase H sont deux endoribonucléases. La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui clive spécifiquement les résidus de cytosine et d'uracile non appariés à l'extrémité 3 'de l'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée. La RNase H est une enzyme ribonucléase non spécifique qui peut dégrader l'ARN dans l'hybride ARN-ADN par réaction hydrolytique. C'est la différence entre la RNase A et la RNase H.
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