La principale différence entre les éléments transposables de classe I et de classe II est que les éléments transposables de classe I sont des rétrotransposons, tandis que les éléments transposables de classe II sont des transposons d'ADN.
Un élément transposable est une séquence d'ADN qui peut changer de position dans le génome. Parfois, cela crée et inverse des mutations. Il peut également modifier l'identité génétique et la taille du génome de la cellule. Ce processus aboutit souvent à la duplication du même matériel génétique. L'élément transposable a été découvert pour la première fois par Barbara McClintock, et elle a remporté le prix Nobel pour sa découverte en 1983. Les éléments transposables peuvent être classés en deux classes en fonction de leur mécanisme de transposition: les éléments transposables de classe I et de classe II.
Que sont les éléments transposables de classe I ?
Les éléments transposables de classe I sont des rétrotransposons. Le rétrotransposon est un type de composant génétique qui se copie et se colle dans différents emplacements génomiques en reconvertissant l'ARN en ADN par un processus appelé transcription inverse. Ce processus est catalysé par l'enzyme transcriptase inverse. Le rétrotransposon utilise normalement un intermédiaire de transposition d'ARN. Les éléments transposables de classe I sont généralement copiés en deux étapes. Tout d'abord, ils sont transcrits de l'ADN à l'ARN. Ensuite, l'ARN produit est ensuite rétrotranscrit en ADN. Plus tard, cet ADN copié est réinséré dans le génome à une nouvelle position. Les caractéristiques des rétrotransposons sont très similaires à celles des rétrovirus tels que le VIH.
Figure 01: Élément transposable de classe I
Les rétrotransposons peuvent être divisés en trois types.
- Rétrotransposons avec de longues répétitions terminales (LTR), qui codent pour la transcriptase inverse,
- Rétrotransposons avec de longs éléments nucléaires intercalés (LINE) qui codent pour la transcriptase inverse mais manquent de LTR et sont transcrits par l'ARN polymérase II,
- Rétrotransposons avec de courts éléments nucléaires intercalés (SINE) qui ne codent pas pour la transcriptase inverse et sont transcrits par l'ARN polymérase III.
De plus, en raison d'un mécanisme similaire avec les rétrotransposons, les rétrovirus peuvent également être considérés comme des éléments transposables.
Que sont les éléments transposables de classe II ?
Les éléments transposables de classe II sont des transposons d'ADN. Les éléments transposables de classe II ont un mécanisme de transposition par copier-coller qui n'implique pas d'ARN intermédiaire. La transposition est catalysée par plusieurs enzymes transposases. Ces enzymes peuvent se lier spécifiquement ou non spécifiquement à l'ADN. La transposase effectue une coupe échelonnée sur le site cible de l'ADN qui produit des extrémités collantes. Ensuite, ceux-ci découpent les ligatures de transposon d'ADN dans d'autres sites cibles.
Figure 02: Éléments transposables de classe II
Habituellement, l'ADN polymérase comble les lacunes résultantes des extrémités collantes, et l'ADN ligase ferme le squelette sucre-phosphate. De plus, cette transposition entraîne une duplication du site cible. Les sites d'insertion des transposons d'ADN peuvent être identifiés par de courtes répétitions directes suivies de répétitions inversées. Mais tous les transposons d'ADN ne présentent pas un mécanisme de transposition par copier-coller. Par exemple, certains transposons montrent une transposition réplicative dans laquelle les transposons se répliquent vers un nouveau site cible.
Similitudes entre les éléments transposables de classe I et de classe II
- Les éléments transposables de classe I et de classe II sont des éléments génétiques mobiles ou des gènes sauteurs.
- Les deux peuvent changer de position dans le génome.
- Ils sont constitués de séquences d'ADN.
- Ce sont des éléments génétiques égoïstes.
- Ils sont très importants dans la fonction génomique et l'évolution.
Différence entre les éléments transposables de classe I et de classe II
Les éléments transposables de classe I sont des rétrotransposons, tandis que les éléments transposables de classe II sont des transposons d'ADN. C'est donc la principale différence entre les éléments transposables de classe I et de classe II. De plus, les éléments transposables de classe I utilisent des intermédiaires d'ARN dans le mécanisme de transposition. D'autre part, les éléments transposables de classe II utilisent des intermédiaires d'ADN dans le mécanisme de transposition.
L'infographie suivante compile les différences entre les éléments transposables de classe I et de classe II sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Éléments transposables de classe I vs classe II
Les éléments transposables sont appelés éléments génétiques mobiles ou gènes sauteurs. Ce sont des séquences d'ADN. Les éléments transposables sont classés en deux classes en fonction de leur mécanisme de transposition en tant qu'éléments transposables de classe I et de classe II. Les éléments transposables de classe I sont des rétrotransposons, tandis que les éléments transposables de classe II sont des transposons d'ADN. C'est donc la principale différence entre les éléments transposables de classe I et de classe II.
