La principale différence entre CRISPR et CRISPR Cas9 est que CRISPR (répétition palindromique courte régulièrement espacée en cluster) est un mécanisme de défense immunitaire procaryote naturel, tandis que CRISPR cas9 est une nucléase Cas9 guidée par l'ARN qui fait partie de l'adaptative CRISPR. système immunitaire.
CRISPR est un système immunitaire de défense antiviral trouvé dans les bactéries et les archées. C'est une famille de séquences d'ADN présentes dans le génome bactérien. Il s'agit de séquences espaceuses dérivées de fragments d'ADN de bactériophages qui les ont précédemment infectés. Lors d'infections virales ultérieures, les bactéries utilisent ces séquences pour détruire l'ADN viral. Les séquences CRISPR ont de courtes répétitions palindromiques et des séquences d'espacement. De plus, les séquences d'espacement répétées CRISPR ont souvent des gènes associés qui codent pour les protéines Cas. Cas9 est une endonucléase guidée par l'ARN. Avec les séquences CRISPR, la protéine Cas9 agit comme un système immunitaire adaptatif chez les bactéries contre les bactériophages.
Qu'est-ce que CRISPR ?
CRISPR signifie Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. C'est un groupe de séquences d'ADN présentes dans le génome bactérien. Il fonctionne comme un mécanisme de défense naturel chez les bactéries et a été identifié pour la première fois chez E. coli. Chez les bactéries, il agit comme une protection immunitaire adaptative, notamment contre les bactériophages. Par conséquent, il s'agit d'un mécanisme spécifique à la séquence.
Figure 01: CRISPR
Le système CRISPR contient plusieurs séquences répétées d'ADN à segments courts. Ces répétitions sont palindromiques, ayant la même séquence de base lors de la lecture de 5' à 3' tandis que l'autre donne la même séquence lors de la lecture de 3' à 5'. De plus, les répétitions sont identiques. Ils sont situés entre de courtes séquences d'ADN "espaceurs" qui ne sont pas identiques. Mais ces séquences d'ADN d'espacement sont similaires ou correspondent à l'ADN de bactériophage étranger. Les gènes associés à CRISPR sont appelés gènes associés à CRISPR ou gènes Cas. Les gènes Cas codent pour les protéines Cas qui sont des hélicases ou des nucléases. Les hélicases déroulent l'ADN tandis que les nucléases coupent l'ADN. Dans l'ensemble, lorsque l'on considère le CRISPR, il s'agit d'un système immunitaire de bactéries qui agit contre les bactériophages (bactéries infectant les virus).
Qu'est-ce que CRISPR Cas9 ?
Cas9 ou protéine associée CRISPR 9 est une endonucléase bactérienne guidée par l'ARN. C'est donc une enzyme qui reconnaît et coupe l'ADN cible (en particulier l'ADN du bactériophage) complémentaire de l'ARN guide. Il effectue un clivage spécifique au brin. La protéine Cas9 est codée par un gène associé à CRISPR. CRISPR cas9 est le système de nucléase CRISPR-Cas9 guidé par l'ARN qui peut être utilisé comme plate-forme de ciblage et d'édition d'ADN programmable par ARN pour l'édition du génome, la perturbation de la transcription, la modulation épigénétique et l'imagerie du génome. Ce système CRISPR cas9 est très populaire dans les systèmes d'édition du génome actuels.
Figure 02: CRISPR Cas9
À l'heure actuelle, le système CRISPR/Cas9 est utilisé pour altérer ou modifier le génome des mammifères par répression ou activation de la transcription. Les cellules de mammifères peuvent répondre aux cassures d'ADN médiées par CRISPR/Cas9 en adoptant un mécanisme de réparation. Cela peut être fait en utilisant la méthode de jonction d'extrémité non homologue (NHEJ) ou la réparation dirigée par homologie (HDR). Ces deux mécanismes de réparation ont lieu en introduisant des cassures double brin. Cela se traduit par l'édition de gènes de mammifères. NHEJ peut conduire à l'ablation de mutations géniques et peut être utilisé pour créer une perte d'effets de fonction. Le HDR peut être utilisé pour introduire des mutations ponctuelles spécifiques ou introduire des segments d'ADN de longueur variable. À l'heure actuelle, le système CRISPR/Cas est utilisé dans les domaines des applications thérapeutiques, biomédicales, agricoles et de la recherche.
Quelles sont les similitudes entre CRISPR et CRISPR Cas9 ?
- Cas9 fait partie du système CRISPR Cas.
- Crisper cas9 system est un système immunitaire naturellement présent dans les bactéries.
Quelle est la différence entre CRISPR et CRISPR Cas9 ?
CRISPR est un groupe de séquences d'ADN trouvées dans le génome bactérien qui fonctionne comme un système de défense naturel contre les bactériophages. Il se compose de courtes répétitions palindromiques régulièrement espacées, d'espaceurs et de gènes associés. En revanche, cas9 est une protéine 9 associée à CRISPR, qui est une enzyme endonucléase guidée par l'ARN. Il reconnaît et clive les doubles brins d'ADN des virus. En fait, il fait partie du système de défense CRISPR. C'est donc la principale différence entre CRISPR et CRISPR cas9.
Résumé - CRISPR vs CRISPR Cas9
CRISPR Cas system est un système de défense microbien. CRISPR est un groupe de séquences d'ADN composé de courtes répétitions palindromiques, de séquences d'espacement et de gènes associés. Cas9 est une protéine Cas qui est une endonucléase guidée par l'ARN. CRISPR et la protéine Cas9 forment un système immunitaire qui agit contre les infections bactériophages chez les bactéries. La protéine Cas9 est capable de cliver l'ADN viral étranger et de le perturber. Le CrRNA guide cas9 pour reconnaître l'ADN viral. Par conséquent, le système CRISPR cas9 est un système immunitaire naturel présent dans les bactéries contre les virus. Voici donc le résumé de la différence entre CRISPR et CRISPR cas9.
