La principale différence entre motif et domaine est que le motif n'est pas indépendamment stable alors que le domaine est indépendamment stable.
Les protéines sont d'importantes macromolécules biologiques présentes dans notre corps. D'autre part, le code génétique d'un gène décidera de la séquence d'acides aminés d'une protéine. De plus, les protéines ont des structures primaires, secondaires et tertiaires. La structure primaire est la séquence d'acides aminés de la chaîne polypeptidique. Lorsque les chaînes polypeptidiques se replient les unes avec les autres, elles forment la structure secondaire de la protéine. Les hélices alpha, les feuillets bêta et les structures super-secondaires appartiennent aux structures secondaires. Certains groupements d'éléments super-secondaires sont appelés motifs protéiques. La structure tertiaire d'une protéine fait référence à sa structure tridimensionnelle qui décide de la fonction de la protéine. Le domaine est une section repliée d'une molécule de protéine, qui est globulaire et a une fonction discrète. C'est la structure fonctionnelle et tridimensionnelle fondamentale de la protéine.
Qu'est-ce que Motif ?
Motif est un certain regroupement des éléments super secondaires des protéines telles que les hélices alpha et les structures bêta. Ce sont des types de motifs présents dans différentes protéines. Les motifs décrivent les modèles de pliage des éléments structurels secondaires et leurs interactions. Ces modèles de pliage se stabilisent par des liaisons similaires qui sont présentes dans les structures tertiaires. Cependant, ils ne sont pas aussi complexes que les structures tertiaires.
Figure 01: Motif
Ce sont de simples combinaisons de structures secondaires de protéines. Motif n'est pas stable en soi. De plus, les motifs expliquent la structure d'une protéine mais ne prédisent pas la fonction d'une protéine. Des exemples de motifs protéiques sont un motif bêta-alpha-bêta, un motif clé grecque, un tonneau bêta, un motif bêta-méandre, etc.
Qu'est-ce qu'un domaine ?
Domain est une unité fondamentale, fonctionnelle et tridimensionnelle d'une protéine. Il remplit une fonction particulière. Une même protéine peut avoir plusieurs domaines distincts. Chaque domaine est une unité indépendante. C'est une structure globulaire. Il est responsable d'une fonction ou d'une interaction spécifique. Les domaines peuvent être utilisés pour émettre des hypothèses sur la fonction d'une protéine non caractérisée. Lors de l'analyse d'une protéine, il est essentiel de prendre en compte puisque les domaines sont les unités fonctionnelles de la protéine.
Figure 02: Trois domaines différents de pyruvate kinase
Les domaines sont des structures très stables et compactes. Ils se distinguent facilement des autres régions. La pyruvate kinase a trois domaines distincts, comme le montre la figure 02. La longueur du domaine peut varier et la longueur moyenne est de 100 acides aminés. Chaque domaine contient un noyau hydrophobe construit à partir d'unités structurelles secondaires. Plusieurs domaines forment collectivement la structure tertiaire d'une protéine.
Quelles sont les similitudes entre le motif et le domaine ?
- Motif et domaine sont des unités présentes dans les molécules de protéines elles-mêmes.
- Ils sont utiles pour classer les familles de protéines.
Quelle est la différence entre motif et domaine ?
Motif est un certain regroupement des éléments super secondaires des protéines telles que les hélices alpha et les structures bêta, tandis que le domaine est l'unité fonctionnelle d'une protéine. De plus, le motif est une structure secondaire tandis que le domaine est responsable de la structure tertiaire de la protéine. De plus, le domaine est une unité indépendante, contrairement à un motif. De plus, le domaine décrit la fonction d'une protéine alors que le motif ne l'est pas. Ce sont les principales différences entre motif et domaine. L'infographie ci-dessous présente la différence entre motif et domaine sous forme de tableau.
Résumé – Motif vs Domaine
Motif est un arrangement de structures secondaires de la molécule de protéine. Il n'est généralement pas stable par lui-même, contrairement à un domaine. Le domaine est une structure indépendamment stable d'une protéine. Par conséquent, il peut s'agir d'une partie ou d'une molécule de protéine entière. C'est une unité fonctionnelle fondamentale tridimensionnelle de la protéine. De plus, il a une fonction et c'est une unité indépendante. Motif peut faire partie du domaine. Mais le domaine ne peut pas faire partie d'un motif. C'est la différence entre motif et domaine.
