Différence clé - Protéomique vs Transcriptomique
La technologie omique est une tendance actuelle, où les différentes biomolécules d'un organisme sont considérées comme une collection entière en ce qui concerne ses propriétés et ses fonctions. La technologie omique a un large éventail d'applications. Les différentes omiques d'un échantillon biologique comprennent la génomique, la protéomique, la transcriptomique et la métabolomique. La protéomique implique l'étude complète de toutes les protéines d'un organisme vivant. Il est défini comme l'ensemble de toutes les protéines exprimées dans un organisme, ses propriétés structurelles et fonctionnelles. L'ensemble complet des protéines forme donc le protéome. La transcriptomique est l'étude complète de toutes les molécules d'ARN messager (ARNm) présentes dans un organisme vivant. Ainsi, la transcriptomique traite des gènes qui sont activement exprimés dans un organisme vivant. L'ensemble total d'ARNm dans un organisme vivant est appelé transcriptome. le différence clé entre la protéomique et la transcriptomique est basée sur le type de biomolécule. En protéomique, l'ensemble total des protéines exprimées dans un organisme vivant est étudié alors qu'en transcriptomique, l'ARNm total d'un organisme vivant est étudié.
Qu'est-ce que la protéomique ?
Le terme protéomique a été inventé en 1995 et a été initialement défini comme le complément protéique total dans une cellule, un tissu ou un organisme. Avec l'avancement des études protéomiques, il a ensuite été modifié pour être considéré comme un terme générique dans lequel de nombreux domaines d'étude ont été inclus. Actuellement, sous le thème protéomique, la structure, l'orientation, les fonctions, ses interactions, ses modifications, ses applications et l'importance des protéines sont étudiées. Par conséquent, de nombreuses recherches sont actuellement menées dans le domaine de la protéomique.
Les premières études protéomiques ont été réalisées pour identifier la teneur en protéines d'Escherichia coli. La cartographie de la teneur totale en protéines a été réalisée à l'aide de gels bidimensionnels (2D). Suite au succès de cela, les scientifiques sont passés à la caractérisation de la teneur totale en protéines chez des animaux tels que les cobayes et les souris. À l'heure actuelle, la cartographie des protéines humaines se fait par électrophorèse sur gel 2D.
Applications de la protéomique
L'étude de la protéomique présente de nombreux avantages, car les protéines sont les molécules gouvernantes de la majeure partie de l'activité en raison de la propriété catalytique des protéines. Ainsi, l'étude des protéines entières peut fournir des informations sur l'état de santé d'un organisme. Certaines applications sont;
- Annotation du génome: en étudiant la teneur en protéines d'un organisme, les génomes exacts responsables du composé protéique actif peuvent être déterminés. Dans ce scénario, les résultats de toute la génomique, la transcriptomique et la protéomique sont importants.
- Identification de la maladie / Diagnostic: la protéomique est utilisée dans l'identification de l'état pathologique, en comparant les personnes en bonne santé et les malades
- Réaliser l'expression des protéines étudiées au cours de l'expérimentation.
- Modifications protéiques et études d'interaction: Afin d'utiliser des protéines en conditions in vitro ou et in vivo, décider des conditions de stockage de ces protéines extraites et étudier le comportement de la protéine in vitro, in vivo et in – méthodes silico.
Figure 01: Protéomique
Il existe différentes techniques impliquées dans la protéomique
- Extraction de la protéine totale et séparation des protéines par électrophorèse sur gel 2D. Les protéines peuvent également être séparées par chromatographie liquide à haute performance (HPLC).
- Séquençage des protéines extraites à l'aide de méthodes telles que la méthode de séquençage d'Edmund ou la spectrométrie de masse.
- Une fois les séquences identifiées, les propriétés structurelles et fonctionnelles de la teneur en protéines sont analysées à l'aide de logiciels informatiques et d'outils bioinformatiques.
Qu'est-ce que la transcriptomique ?
Le terme transcriptome a été inventé récemment. La transcriptomique est l'étude du contenu total en ARNm d'un organisme. L'ARNm total est l'ADN exprimé dans un organisme vivant ou une cellule. La collection complète d'ARNm est appelée transcriptome.
Les étapes vers l'analyse du transcriptome comprennent,
- Extraction de l'ARN, séparation de l'ARNm par chromatographie sur colonne de gel avec billes poly DT.
- Le séquençage de l'ARNm est terminé.
La technologie des microréseaux est un moyen courant d'identifier le transcriptome d'un organisme. La technique des puces à ADN implique une plaque de sonde avec les brins complémentaires du transcriptome. Lors de l'hybridation, l'ARNm présent dans l'organisme ou les cellules peut être caractérisé.
Figure 02: Techniques transcriptomiques
La transcriptomique est désormais largement utilisée dans le domaine médical. Le diagnostic et le profilage des maladies sont les principaux domaines dans lesquels la transcriptomique est utilisée. En analysant un transcriptome d'un organisme, l'ARNm étranger peut être identifié, et s'il y a des infections, il peut être identifié. L'ARN non codant peut être séparé à l'aide de technologies transcriptomiques. De plus, l'expression de gènes sous différents stress environnementaux peut être surveillée.
Quelles sont les similitudes entre la protéomique et la transcriptomique ?
- Les deux font partie du concept de technologie omique.
- Les deux sont utilisés dans le diagnostic des maladies et la caractérisation des maladies d'un organisme.
- Les deux domaines d'étude impliquaient l'extraction de la biomolécule, la séparation de la biomolécule et les étapes de séquençage.
Quelle est la différence entre la protéomique et la transcriptomique ?
Protemics vs Transcriptomics |
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| La protéomique implique l'étude complète de toutes les protéines d'un organisme vivant. | La transcriptomique est l'étude complète de toutes les molécules d'ARN messager (ARNm) présentes dans un organisme vivant. |
| Type de molécule biologique étudiée | |
| Les protéines sont étudiées en protéomique. | les ARNm sont étudiés en transcriptomique. |
| Facteurs étudiés | |
| La structure, la fonction, les interactions, les modifications et les applications des protéines sont étudiées en protéomique. | La structure des séquences, les interactions avec l'environnement et les applications de l'ARNm sont étudiées en transcriptomique. |
Résumé – Protéomique vs Transcriptomique
Les omiques jouent un rôle important dans le domaine des sciences de la vie. La protéomique fait référence à l'étude du protéome qui forme les collections complètes de protéines dans une cellule ou un organisme. La transcriptomique fait référence à l'étude du transcriptome qui est l'ensemble complet d'ADN exprimé sous forme d'ARNm. Les deux domaines d'étude, la protéomique et la transcriptomique, ont été dérivés après l'introduction de la génomique et sont actuellement largement utilisés dans les diagnostics médicaux et dans la caractérisation et le criblage d'organismes. C'est la différence entre la protéomique et la transcriptomique.
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