Différence clé - ADNc vs bibliothèque génomique
Il existe deux principaux types de bibliothèques d'ADN construites par des scientifiques à l'aide de techniques de génie génétique. Ce sont la bibliothèque d'ADNc et la bibliothèque génomique. le différence clé entre l'ADNc et la bibliothèque génomique est que la bibliothèque d'ADNc contient l'ADN complémentaire cloné de l'ARNm total d'un organisme tandis que la bibliothèque d'ADN génomique contient les fragments clonés du génome entier d'un organisme. La bibliothèque d'ADN génomique est plus grande que la bibliothèque d'ADNc.
Qu'est-ce qu'une bibliothèque génomique ?
Une banque d'ADN génomique est une collection de clones portant les fragments d'ADN génomique total d'un organisme. Il contient l'intégralité de l'ADN génomique de cet organisme, y compris les séquences codantes et non codantes. La construction d'une banque génomique est réalisée par la technologie de l'ADN recombinant suivi du clonage (génie génétique). Il y a différentes étapes impliquées dans la construction, comme le montre la figure 01. Le processus commence par l'isolement de l'ADN génomique. En utilisant un protocole d'extraction d'ADN approprié, l'ADN génomique total d'un organisme doit être isolé. Ensuite, l'ADN doit être converti en tailles gérables ou en fragments spécifiques par des endonucléases de restriction (enzymes coupant l'ADN). L'ADN fragmenté doit être inséré dans des vecteurs à l'aide d'ADN ligases (enzymes de liaison à l'ADN). Un vecteur est un organisme autoréplicatif. Les plasmides et les bactériophages sont des vecteurs couramment utilisés dans la technologie de l'ADN recombinant. Ces vecteurs ligaturés sont connus sous le nom de molécules d'ADN recombinant car ils portent à la fois des séquences d'ADN propres et insérées. Des vecteurs recombinants sont ajoutés à une bactérie hôte et amenés à absorber les vecteurs recombinants à l'intérieur de la cellule bactérienne. Les bactéries avec des vecteurs recombinants (plasmides) doivent être cultivées dans un milieu de culture. Lors de la multiplication bactérienne, l'ADN bactérien, associé à des plasmides recombinants, réplique leurs génomes et produit des clones. Ces clones contiennent le génome entier de l'organisme source. Par conséquent, on l'appelle une bibliothèque génomique. Les plasmides peuvent facilement être séparés de l'ADN chromosomique bactérien pour construire la bibliothèque génomique de cet organisme. Si un organisme particulier contient des gènes intéressés, il est facile de le détecter dans la bibliothèque génomique par hybridation à l'aide de sondes moléculaires (marqueurs).
Les bibliothèques génomiques sont importantes pour étudier la structure et la fonction génomiques, les gènes spécifiques, la localisation des gènes, la cartographie des gènes, les mutations, le séquençage des gènes, l'identification de nouveaux gènes thérapeutiques, etc.
Figure_1: Construction d'une bibliothèque génomique
Qu'est-ce qu'une bibliothèque d'ADNc ?
Une bibliothèque d'ADNc est une collection de clones d'ADN complémentaires (ADNc) synthétisés à partir de l'ARNm total d'un organisme. La procédure de construction comporte différentes étapes. La purification de l'ARNm total d'un organisme est la première étape impliquée. Les ARNm isolés sont convertis en brins d'ADNc par un processus appelé transcription inverse. La transcription inverse est facilitée par une enzyme appelée transcriptase inverse. Il utilise une petite amorce 3 'et initie la synthèse du premier brin d'ADNc complémentaire du brin d'ARNm de la matrice. L'ADNc double brin résultant est converti en fragments plus petits à l'aide d'endonucléases de restriction et inséré dans des vecteurs appropriés. Ces molécules recombinantes construites sont ensuite ajoutées dans un organisme hôte et cultivées dans un milieu de culture pour produire des clones. La collection de clones contenant des fragments d'ADNc d'un organisme est connue sous le nom de bibliothèque d'ADNc. L'ARNm mature entièrement tranché ne contient pas d'introns ni de régions régulatrices. Par conséquent, les fragments non codants ne sont pas présents dans les bibliothèques d'ADNc contrairement à une bibliothèque génomique.
Les bibliothèques d'ADNc sont importantes pour l'analyse des régions codantes, des fonctions des gènes, de l'expression des gènes, etc.
Figure_2: Construction d'une bibliothèque d'ADNc
Quelle est la différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique ?
ADNc vs bibliothèque génomique |
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| la banque d'ADNc est une collection de clones portant l'ADN complémentaire de l'ARNm d'un organisme | La bibliothèque génomique est une collection de clones portant l'ADN génomique total d'un organisme. |
| Séquences codantes vs non codantes | |
| la bibliothèque d'ADNc ne contient que les séquences codantes; il ne contient pas d'introns. | La bibliothèque génomique comprend l'intégralité de l'ADN génomique, y compris l'ADN non codant (introns et régulateurs). |
| Taille | |
| La bibliothèque d'ADNc est petite. | La bibliothèque génomique est grande. |
| Matériel de départ | |
| Le matériel de départ est l'ARNm | Le matériel de départ est l'ADN. |
| Implication de la transcription inversée. | |
| La transcription inverse se produit lors de la synthèse du premier brin d'ADNc. | La transcription inverse ne se produit pas. |
Résumé – ADNc et bibliothèque génomique
La banque génomique représente une population de clones portant l'ADN génomique total fragmenté d'un organisme. La banque d'ADNc représente la population de clones portant l'ADN complémentaire de l'ARNm total d'un organisme. Un clone d'ADNc ne contient que les séquences trouvées dans l'ARNm tandis que le clone génomique contient les séquences du génome entier. C'est la différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique.
