La principale différence entre SF1 et SF2 est leur capacité à dérouler les acides nucléiques. Alors que SF1 ne déroule que l'ADN, SF2 déroule à la fois l'ADN et l'ARN.
L'hélicase est l'une des enzymes clés qui participent au processus de réplication de l'ADN ainsi qu'aux processus de réparation de l'ADN. Le rôle principal de l'hélicase est de participer au processus de déroulement afin de faciliter la séparation des molécules d'ADN double brin. L'activité de l'enzyme est essentielle pendant la phase d'initiation de la réplication de l'ADN. Les hélicases sont divisées en Super Famille 1 et Super Famille 2 principalement en fonction de leurs différences structurelles. Au sein de chaque super famille, il existe des types d'hélicases plus diversifiés.
Qu'est-ce que SF1 ?
L'hélicase Super Family 1 est un type d'hélicase qui comprend une structure hexamérique à côté de la protéine centrale interne, qui représente l'activité de l'hélicase. L'hélicase SF1 est l'une des plus grandes classes d'hélicases et peut être classée en hélicases SF1A et hélicases SF1B. Des protéines telles que PcrA, Rep et UvrD, appartiennent à la classe des hélicases SF1A. En comparaison, des protéines comme RecA et Dda appartiennent à la classe des hélicases SF1B. Les fonctions des hélicases SF1 varient considérablement. Certaines des fonctions vitales des hélicases SF1 comprennent la réplication de l'ADN, la recombinaison de l'ADN, le traitement des fragments d'Okazaki, la formation des télomères et la réparation par excision des nucléotides des dommages à l'ADN. Chez certaines espèces bactériennes, les hélicases de type SF1 participent également à l'aide au transfert horizontal de gènes par conjugaison. De plus, dans les virus, les hélicases SF1 contribuent à la réplication virale.
Figure 01: Action Hélicase
Il existe de nombreux motifs différents associés à la structure des hélicases SF1. Ils contiennent au moins 7 motifs conservés parmi tous les différents types d'hélicases SF1 (Q, I, Ia, II, III, IV, V et VI). La structure de l'hélicase SF1 est un cristal, où les motifs sont regroupés. Il existe une poche de liaison ATP caractéristique entre les motifs et le site de liaison à l'ADN. Les domaines non conservés sont distribués pour maintenir l'intégrité structurelle de la molécule d'hélicase. Ces domaines peuvent varier entre les hélicases SF1A et les hélicases SF1B.
Qu'est-ce que SF2 ?
L'hélicase de la super famille 2 est l'un des groupes les plus diversifiés de superfamilles d'hélicases. Il existe de nombreux types d'hélicases SF2 telles que les hélicases de type RecQ, les hélicases de type RecG, les hélicases Rad3/XPD et NS3. Certaines enzymes de restriction, telles que les enzymes de restriction de type I, entrent également dans cette catégorie. La fonction générale des hélicases SF2 est le déroulement de l'ADN double brin. Cependant, certains types d'hélicases SF2 n'ont pas la capacité d'agir complètement comme des enzymes hélicases. Les hélicases SF2 sont également largement utilisées dans le traitement de l'ARN. La famille DEAD-box des hélicases SF2 participe au traitement de l'ARN, y compris la transcription, l'épissage, le traitement de la traduction et l'assemblage du complexe ARN-protéine.
Figure 02: Hélicase
La structure de l'hélicase SF2 contient également des motifs conservés. Cependant, certains domaines diffèrent légèrement de celui de l'hélicase SF1. Ils contiennent également un domaine de liaison à l'ATP en dehors du domaine de liaison à l'ADN.
Quelles sont les similitudes entre SF1 et SF2 ?
- SF1 et SF2 montrent une activité d'hélicase.
- De plus, les deux participent à la réplication et à la recombinaison de l'ADN.
- SF1 et SF2 sont composés de motifs conservés.
- Les deux ont un domaine de liaison à l'ATP et un domaine de liaison à l'ADN.
- Ces formes sont des protéines multi-domaines.
- De plus, si des mutations ont lieu dans l'un ou l'autre type, cela entraînera des effets délétères.
- SF1 et SF2 sont tous deux cruciaux pour assurer la continuité du cycle cellulaire.
- SF1 et SF2 se retrouvent aussi bien chez les procaryotes que chez les eucaryotes.
Quelle est la différence entre SF1 et SF2 ?
SF1 et SF2 sont deux super familles d'hélicases. Ils montrent une grande diversité. le différence clé entre SF1 et SF2 est que SF1 est principalement impliqué dans le déroulement de l'ADN, tandis que SF2 participe également au traitement de l'ARN lors de la transcription et de la traduction. Lors de la comparaison des différents motifs de la protéine, SF1 et SF2 diffèrent principalement en fonction du motif III et du motif IV. Même si elles ont une similitude structurelle, les hélicases SF1 forment des structures hexamères toroïdales tandis que SF2 ne forme pas ces arrangements structurels.
Une autre différence entre SF1 et SF2 est que les hélicases SF1 préfèrent davantage les nucléotides d'adénine, tandis que les hélicases SF2 préfèrent les cinq nucléotides pour cibler le déroulement. Lorsque l'on compare la direction de déroulement, les hélicases SF1 ne transloquent que dans la direction 5 'à 3', tandis que les hélicases SF2 ont la capacité de transloquer avec les acides nucléiques dans les deux sens.
L'infographie ci-dessous présente les différences entre SF1 et SF2 sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé – SF1 contre SF2
Les hélicases sont un groupe très important et diversifié d'enzymes qui participent à la réplication de l'ADN. Cependant, en raison de sa grande diversité, les enzymes sont classées en superfamilles. SF1 et SF2 sont les deux plus grandes super familles d'hélicases. Alors que SF1 est principalement associé au traitement lié à l'ADN, SF2 est associé à la fois au traitement de l'ADN et de l'ARN. C'est donc la principale différence entre SF1 et SF2. De plus, SF1 et SF2 diffèrent également dans leur disposition structurelle car SF2 ne forme pas de structures hexamères. Des mutations dans les hélicases SF1 et SF2 entraîneront le développement d'un cancer suite à une dérégulation du cycle cellulaire et d'autres mécanismes vitaux tels que la réparation de l'ADN.
