La principale différence entre NGS et WGS est que le séquençage de nouvelle génération (NGS) est une technologie de séquençage de deuxième génération massivement parallèle qui est à haut débit, à faible coût et rapide, tandis que le séquençage du génome entier (WGS) est une méthode complète d'analyse de l'intégralité de l'ADN génomique d'une cellule en une seule fois en utilisant des techniques de séquençage telles que le séquençage Sanger, l'approche shotgun ou le séquençage NGS à haut débit.
Au cours des dernières décennies, la compréhension du génome des humains et d'autres animaux a considérablement augmenté grâce à la découverte de techniques de séquençage rapide et d'outils bioinformatiques. Les techniques de séquençage conventionnelles telles que le séquençage de Sanger avaient leurs limites, ce qui a nécessité le développement de nouvelles méthodes de séquençage rapide telles que le séquençage de nouvelle génération (NGS) et le séquençage des nanopores. La technique de séquençage du génome entier (WGS) est une approche récente qui est déjà utilisée dans de nombreux projets de recherche génomique, tels que le projet 100 000 génomique de Genomic England, Royaume-Uni. Ainsi, NGS et WGS sont deux méthodes de séquençage qui sont actuellement intégrées dans de nombreux projets génomiques.
Qu'est-ce que NGS ?
NGS (séquençage de nouvelle génération) est une technologie de séquençage massivement parallèle de deuxième génération qui est à haut débit, à faible coût et rapide. Il n'existe pas de définition précise du séquençage de nouvelle génération. Mais on peut clairement le distinguer des techniques classiques de séquençage capillaire. Le séquençage de nouvelle génération permet le séquençage d'une molécule d'ADN d'une taille totale supérieure à 1 million de paires de bases en une seule expérience. Il offre une vitesse sans précédent et des options à haut débit, telles que le séquençage de l'ADN de plusieurs individus en même temps. Ceci est réalisé en miniaturisant le volume des réactions de séquençage individuelles. De plus, cela limite également la taille des instruments et minimise le coût des réactifs par réaction.
Figure 01: Plates-formes NGS
NGS est une méthode de séquençage à lecture courte qui a déjà révolutionné le domaine de la recherche biologique. En outre, le NGS est appliqué dans divers domaines tels que le séquençage de novo du génome, le séquençage du génome entier, l'analyse du transcriptome, le séquençage des petits ARN et des micro-ARN, le reséquençage ciblé et le séquençage de l'exome entier.
Qu'est-ce que le WGS ?
WGS (séquençage du génome entier) est une méthode complète d'analyse de l'intégralité de l'ADN génomique d'une cellule en une seule fois en utilisant des techniques de séquençage telles que le séquençage Sanger, l'approche shotgun ou le séquençage NGS à haut débit. Il est également connu sous le nom de séquençage complet du génome ou séquençage complet du génome. Le séquençage du génome entier implique le séquençage de tout l'ADN chromosomique d'un organisme ainsi que l'ADN dans les mitochondries, et pour les plantes, l'ADN dans le chloroplaste en une seule fois. WGS permet aux scientifiques de lire la séquence exacte de toutes les lettres qui composent l'ensemble complet de l'ADN. Le WGS utilisant la plate-forme NGS devrait révolutionner la configuration clinique.
Figure 02: Séquencement WGS vs Shotgun hiérarchique
Le séquençage du génome entier a été introduit dans les soins cliniques en 2014. De plus, l'application du WGS implique le séquençage des gènes au niveau du SNP pour identifier les variantes fonctionnelles dans les études d'association, l'intervention thérapeutique en médecine personnalisée, la biologie évolutive, l'analyse génomique comparative, les études de mutations et de réarrangements, les études d'association de variantes rares et la prédiction de la sensibilité aux maladies et de la réponse aux médicaments.
Quelles sont les similitudes entre NGS et WGS ?
- NGS et WGS sont deux techniques de séquençage.
- Les deux techniques séquencent l'ADN ou l'ARN.
- Ces techniques sont nouvelles et fiables.
- Ils sont tous deux utilisés pour diagnostiquer des maladies et découvrir des médicaments.
Quelle est la différence entre NGS et WGS ?
NGS est une technologie de séquençage massivement parallèle de deuxième génération qui est à haut débit, à faible coût et rapide, tandis que WGS est une méthode complète d'analyse de l'intégralité de l'ADN génomique d'une cellule en une seule fois en utilisant des techniques de séquençage telles que comme le séquençage Sanger, l'approche shotgun ou le séquençage NGS à haut débit. C'est donc la principale différence entre NGS et WGS. De plus, NGS se compose uniquement de méthodes de séquençage de deuxième génération, tandis que WGS se compose de méthodes de séquençage de première, deuxième et troisième générations.
Le tableau suivant présente les différences entre NGS et WGS sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - NGS contre WGS
Au cours des dernières décennies, différentes techniques de séquençage ont été régulièrement appliquées dans la recherche moléculaire contemporaine. Et même ce sont des outils très puissants pour de nombreuses applications cliniques. NGS et WGS sont deux méthodes de séquençage qui sont actuellement intégrées dans de nombreux projets génomiques. NGS est une technologie de séquençage de deuxième génération qui est à haut débit, à faible coût et rapide. D'autre part, WGS est une méthode d'analyse de l'ADN génomique complet ou de l'ADN génomique complet d'une cellule en une seule fois en utilisant des techniques de séquençage telles que le séquençage Sanger, l'approche shotgun ou le séquençage NGS à haut débit. Voici donc le résumé de la différence entre NGS et WGS.
