La principale différence entre l'amorce et le promoteur est que l'amorce est une courte séquence d'ADN synthétisée dans le commerce qui est utilisée dans la PCR pour l'amplification d'une séquence d'ADN cible, tandis que le promoteur est une séquence d'ADN spécifique qui fournit un site de liaison initial sécurisé pour l'ARN. la polymérase et les facteurs de transcription afin d'initier la transcription.
L'amorce et le promoteur sont deux types de séquences d'ADN. L'amorce est un petit fragment d'ADN nécessaire à la réaction en chaîne par polymérase (PCR). Il possède de courtes séquences nucléotidiques complémentaires de l'extrémité flanquante du brin d'ADN. Il existe deux types d'amorces, et elles fonctionnent comme points de départ pour la synthèse de nouveaux brins d'ADN. En revanche, un promoteur est une séquence d'ADN spécifique située en amont du site d'initiation de la transcription d'un gène. Il interagit directement avec les composants du mécanisme de transcription tels que l'ARN polymérase et les facteurs de transcription afin de contrôler la transcription de l'ADN. Par conséquent, l'ARN polymérase et d'autres facteurs de transcription se lient à la séquence promotrice et initient la transcription.
Qu'est-ce qu'un abécédaire ?
Les amorces sont de courtes séquences d'ADN conçues pour l'amplification de séquences d'ADN cibles. Structurellement, ils possèdent de courtes séquences nucléotidiques complémentaires des extrémités flanquantes des doubles brins d'ADN. Ils ont généralement une longueur d'environ 20 nucléotides. Au cours de la PCR, la Taq polymérase catalyse l'ajout de nucléotides dans la séquence nucléotidique préexistante. Par conséquent, les amorces servent de points de départ pour la synthèse de nouveaux brins. La polymérase Taq ne fonctionne que dans la direction 5 'à 3'. Par conséquent, la synthèse d'ADN a également lieu dans la même direction 5 'vers 3'. L'ADN étant double brin, deux types d'amorces sont nécessaires en PCR. Ils sont connus sous le nom d'amorce directe et d'amorce inverse, en fonction de la direction de l'allongement de l'amorce lors de la synthèse de l'ADN.
Figure 01: Amorces
L'amorce directe s'annele avec le brin d'ADN antisens et initie la synthèse du brin + du gène dans la direction 5' à 3'. Il a une courte séquence nucléotidique qui est complémentaire de l'extrémité flanquante 3 'du brin antisens. L'amorce inverse s'annele avec le brin sens et initie la synthèse d'un brin complémentaire du brin codant, qui est - un brin du gène dans la direction 5'vers 3'. Ainsi, l'amorce inverse est conçue de manière complémentaire à l'extrémité 3 'du brin codant. Les amorces inverses et directes sont importantes pour la production de millions à des milliards de copies de régions particulières d'ADN qui sont ciblées ou intéressées.
Qu'est-ce qu'un Promoteur ?
Le promoteur est une séquence d'ADN située en amont ou à l'extrémité 5′ du site d'initiation de la transcription d'un gène. Il fournit un site de liaison pour l'ARN polymérase et certains éléments de régulation afin d'initier la transcription du gène. C'est une séquence régulatrice nécessaire pour activer ou désactiver un gène. Il existe une séquence nucléotidique spécifique dans le promoteur. Il peut avoir 100 à 1000 paires de bases. Le promoteur montre la direction de la transcription. De plus, il indique le brin sens qui doit être transcrit.
Figure 02: Promoteur d'un gène
Il existe trois types d'éléments promoteurs: le promoteur central, le promoteur proximal et le promoteur distal. Le promoteur central est la partie minimale du promoteur nécessaire pour initier la transcription. Il est situé le plus proche du codon d'initiation. La boîte TATA est une région conservée présente dans de nombreux promoteurs eucaryotes. Il se trouve 25 à 35 paires de bases en amont du site d'initiation de la transcription. Le promoteur proximal se trouve plus en amont du promoteur central. Généralement, il est situé à 250 paires de bases en amont du codon d'initiation et contient des éléments régulateurs primaires. Le promoteur distal se trouve en amont du promoteur proximal et contient des éléments régulateurs supplémentaires. Les promoteurs bactériens ont deux éléments à séquence courte dans leurs promoteurs. TATAAT est la séquence consensus située à -10 du promoteur bactérien tandis que TTGACA est la séquence consensus à -35. Ils sont connus sous le nom d'élément -10 et d'élément -35.
Quelles sont les similitudes entre l'amorce et le promoteur ?
- L'amorce et le promoteur sont deux types de séquences d'ADN.
- Ils sont constitués de séquences nucléotidiques.
- L'amorce et le promoteur sont importants pour l'expression des gènes.
Quelle est la différence entre l'amorce et le promoteur ?
Primer est une courte séquence de nucléotides conçue pour l'amplification de l'ADN cible. En revanche, le promoteur est une séquence d'ADN régulatrice spécifique trouvée en amont du site d'initiation de la transcription d'un gène. C'est donc la principale différence entre l'amorce et le promoteur. Les amorces ont une longueur d'environ 20 paires de bases tandis que le promoteur peut avoir 100 à 1000 paires de bases. Sur le plan fonctionnel, les amorces servent de séquences de départ pour la synthèse du nouveau brin tandis que les promoteurs contrôlent la transcription des gènes en fournissant des sites de liaison pour l'ARN polymérase et d'autres facteurs de transcription.
De plus, un promoteur est défini comme la direction de la transcription et indique le brin sens d'un gène. Structurellement, l'amorce est une courte séquence d'ADN simple brin tandis que le promoteur est une longue séquence d'ADN double brin.
L'info-graphique ci-dessous présente plus de comparaisons liées à la différence entre l'amorce et le promoteur.
Résumé - Primer vs Promoteur
Les amorces sont de courtes séquences nucléotidiques complémentaires des extrémités flanquantes du double brin d'ADN cible. Deux types d'amorces sont utilisées en PCR. Ils servent de séquences de départ pour la synthèse de nouveaux brins. Les amorces sont conçues commercialement et ce sont des séquences thermostables. D'autre part, le promoteur est une séquence régulatrice d'un gène située en amont du site d'initiation de la transcription. Les promoteurs contrôlent la transcription des gènes. Ils fournissent des sites de liaison pour l'ARN polymérase et des facteurs de transcription pour initier la transcription. Voici donc le résumé de la différence entre l'amorce et le promoteur.
