La principale différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance dépend de la méthode utilisée pour développer l'arbre phylogénétique. La parcimonie maximale se concentre sur la minimisation des états totaux des caractères lors de la construction de l'arbre phylogénétique, tandis que le maximum de vraisemblance est une approche statistique dans le dessin de l'arbre phylogénétique en fonction de la vraisemblance entre les données génétiques.
La phylogénie est la nouvelle approche de la classification et de la nomenclature des organismes. La phylogénie repose sur des données génétiques et des relations évolutives. Les données génétiques sont le résultat du séquençage de l'ADN. En phylogénie, la classification des organismes a lieu sur la base de l'ancêtre commun. La parcimonie maximale et la probabilité maximale d'une relation phylogénétique augmentent la précision et la fiabilité d'un arbre phylogénétique.
Qu'est-ce que la parcimonie maximale ?
Dans la technique de parcimonie maximale, la minimisation de l'ensemble des changements d'état du caractère a lieu lors de l'analyse phylogénétique. La phylogénétique est une branche de la biologie qui traite de l'étude des relations évolutives. Un arbre phylogénétique est un arbre qui montre les relations évolutives basées sur un ancêtre commun. Ainsi, lors du dessin d'un arbre phylogénétique en utilisant le concept de parcimonie maximale, la quantité d'évolution parallèle est minimisée. Par conséquent, une parcimonie maximale générera l'arbre beaucoup plus rapidement que les autres méthodes. C'est parce que seules les principales caractéristiques distinctives sont considérées avec un maximum de parcimonie.
Figure 01: parcimonie maximale
Lorsque vous dessinez un arbre parcimonieux maximum, l'arbre est toujours l'arbre le plus court possible avec le nombre minimum de taxons. Cependant, la fiabilité d'un arbre parcimonieux maximum est très élevée. La cohérence statistique et la précision de la relation phylogénétique basée sur la parcimonie maximale varieront. De plus, il existe des algorithmes complexes qui analysent la parcimonie maximale d'une relation phylogénétique.
Qu'est-ce que le maximum de vraisemblance ?
Le maximum de vraisemblance est l'une des méthodes statistiques les plus utilisées pour analyser les relations phylogénétiques. La méthode analysera la phylogénie sur la base du modèle de probabilité. De plus, cette méthode tient compte à la fois de la moyenne et de la variance. Ainsi, en phylogénie, le maximum de vraisemblance est obtenu sur les données génétiques données d'un organisme particulier.
Figure 02: Maximum de vraisemblance
Il y a à la fois des avantages et des inconvénients à utiliser la méthode statistique du maximum de vraisemblance. La méthode est très appropriée lors de l'analyse d'un ensemble de données simple contenant des informations génétiques. Lorsque le degré de variance entre les données génétiques est plus faible, les scores de maximum de vraisemblance sont fiables. Les résultats générés par le maximum de vraisemblance confirment en outre les scores de parcimonie maximum d'une relation phylogénétique particulière. Par conséquent, l'analyse du maximum de vraisemblance agit comme un test de confirmation.
Par rapport aux avantages mentionnés ci-dessus, cette méthode est un processus lent et intense. De plus, en l'absence d'un seul ensemble de données, la sortie d'erreur est élevée. Ainsi, cela rend également la reproductibilité des résultats plus difficile par l'estimation du maximum de vraisemblance.
Quelles sont les similitudes entre la parcimonie maximale et la vraisemblance maximale ?
- La parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance sont deux approches qui jouent un rôle important en phylogénie.
- Les deux techniques décrivent la relation d'un organisme à son ancêtre sur la base des données génétiques disponibles.
- Les arbres phylogénétiques peuvent être interprétés en utilisant à la fois la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance.
- Dans les deux techniques, les données génétiques reposent sur le séquençage de l'ADN ou le séquençage de l'ARN.
- Les deux méthodes sont importantes pour générer des arbres phylogénétiques.
Quelle est la différence entre parcimonie maximale et vraisemblance maximale ?
La parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance sont deux approches différentes dans l'interprétation d'un arbre phylogénétique. La parcimonie maximale croit en l'analyse de quelques caractéristiques et en minimisant les changements de caractère d'un organisme à l'autre. En revanche, la méthode du maximum de vraisemblance prend en compte à la fois la moyenne et la variance et obtient le maximum de vraisemblance sur les données génétiques données d'un organisme particulier. C'est donc la principale différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance.
De plus, la fiabilité de la parcimonie maximale seule n'est pas suffisante pour tirer une conclusion. Mais, la méthode du maximum de vraisemblance agit comme un test de confirmation des résultats de la parcimonie maximale. Ainsi, les conclusions doivent être tirées en utilisant à la fois le maximum de parcimonie et le maximum de vraisemblance.
L'infographie ci-dessous résume la différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance.
Résumé - Parcimonie maximale vs probabilité maximale
La phylogénie joue un rôle important dans la dérivation des relations évolutives en construisant des arbres phylogénétiques. La parcimonie maximale est la technique de construction d'un arbre avec le nombre minimum de changement d'état de caractère. En revanche, la vraisemblance maximale d'un arbre phylogénétique repose sur l'utilisation de la similarité maximale entre les données génétiques. Les données des deux analyses proviennent des données de séquence d'ADN ou d'ARN. La fiabilité et la précision sont élevées lorsque la construction de l'arbre a lieu en utilisant les deux techniques. Ainsi, cela résume la différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance.
