La principale différence entre l'électrophorèse sur gel 1D et 2D réside dans les propriétés utilisées pour la séparation des protéines par électrophorèse sur gel. L'électrophorèse sur gel 1D ne sépare les protéines qu'en fonction de leur poids moléculaire, tandis que l'électrophorèse sur gel 2D sépare les protéines en fonction de leur point isoélectrique et de leur poids moléculaire.
La séparation des protéines par électrophorèse sur gel est une technique importante pour caractériser les protéines. Les protéines ont des propriétés variables; par conséquent, la séparation est plus complexe que la séparation de l'ADN par électrophorèse sur gel d'agarose.
Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel 1D ?
1D L'électrophorèse sur gel, également connue sous le nom d'électrophorèse sur gel à une dimension, est une méthode de séparation des protéines basée sur le poids moléculaire. La séparation des protéines se fait principalement par électrophorèse sur gel de polyacrylamide. Basé sur le concept de l'électrophorèse sur gel, les molécules se séparent en fonction de leur poids moléculaire et de leur charge.
Par conséquent, pour donner une charge uniforme aux protéines, un traitement au dodécylsulfate de sodium (SDS) est effectué avant l'électrophorèse sur gel. Le SDS dénature les protéines et fournit une charge négative uniforme sur la protéine; lors de l'application du champ électrique, les protéines migrent vers la borne positive en fonction de leur poids moléculaire. Ainsi, en séparation, une seule propriété est considérée. C'est pourquoi cette méthode est appelée électrophorèse sur gel 1D.
Figure 01: Électrophorèse sur gel 1D
Au cours de l'électrophorèse sur gel 1D, les protéines sont séparées en fonction de leur poids moléculaire. À cet égard, les molécules de poids inférieur migrent plus rapidement dans le gel par rapport aux protéines de poids moléculaire élevé. Ainsi, les protéines de poids élevé restent à proximité des puits.
Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel 2D ?
L'électrophorèse sur gel 2D ou l'électrophorèse sur gel bidimensionnelle sépare les protéines en fonction de deux propriétés. Les deux propriétés sont le point isoélectrique de la protéine et le poids moléculaire. Cette méthode de séparation des protéines augmente la résolution de la séparation des protéines. Le point isoélectrique de la protéine dépend du pH auquel la protéine est neutre.
Figure 02: Électrophorèse sur gel 2D
Ainsi, dans l'électrophorèse sur gel 2D, la protéine est autorisée à fonctionner sur un gradient de pH fixe dans la première dimension. Dans la deuxième dimension, les protéines sont séparées par électrophorèse verticale ou horizontale sur gel de polyacrylamide. Ainsi, les protéines se séparent selon leur poids moléculaire dans la seconde dimension.
De plus, cette méthode d'électrophorèse sur gel augmente la résolution de la séparation des protéines. Par conséquent, les protéines séparées sont plus pures. Cependant, le coût de la technique est beaucoup plus élevé que l'électrophorèse sur gel unidimensionnelle.
Quelles sont les similitudes entre l'électrophorèse sur gel 1D et 2D ?
- Les deux techniques séparent les protéines.
- Par conséquent, ils sont importants pour caractériser les protéines.
Quelle est la différence entre l'électrophorèse sur gel 1D et 2D ?
La principale différence entre l'électrophorèse sur gel 1D et 2D est que l'électrophorèse sur gel 1D sépare les protéines en fonction uniquement du poids moléculaire, tandis que l'électrophorèse sur gel 2D sépare les protéines en fonction du point isoélectrique et du poids moléculaire. En raison de cette différence fondamentale entre l'électrophorèse sur gel 1D et 2D, la résolution de la séparation des protéines et le coût des deux techniques varient également. L'électrophorèse sur gel 2D montre une résolution élevée par rapport à l'électrophorèse sur gel 1D. Cependant, l'électrophorèse sur gel 2D est plus coûteuse que l'électrophorèse sur gel 1D.
L'infographie ci-dessous résume la différence entre l'électrophorèse sur gel 1D et 2D.
Résumé - Électrophorèse sur gel 1D vs 2D
La séparation des protéines dépend de nombreux facteurs. L'électrophorèse sur gel 1D sépare les protéines uniquement en fonction du poids moléculaire. Cependant, l'électrophorèse sur gel bidimensionnelle ou 2D augmente la résolution de la séparation des protéines. De plus, l'électrophorèse sur gel 2D sépare les protéines en fonction du point isoélectrique et du poids moléculaire. Par conséquent, ces données sont importantes pour le traitement en aval des protéines et dans le domaine de la protéomique. Voici donc le résumé de la différence entre l'électrophorèse sur gel 1D et 2D.
