La principale différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et sur gel de polyacrylamide est que l'électrophorèse sur gel d'agarose utilise des gels d'agarose versés horizontalement pour séparer des fragments d'ADN relativement plus gros, tandis que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide utilise des gels de polyacrylamide versés verticalement pour séparer des fragments d'acide nucléique plus courts.
L'électrophorèse est un type de technique qui utilise un champ électrique appliqué à travers une matrice de gel pour séparer des biomolécules telles que l'ADN, l'ARN et les protéines. Cette séparation de biomolécules telles que l'ADN, l'ARN et les protéines par électrophorèse est basée sur la charge et la taille. Les échantillons sont chargés dans les puits du gel. Plus tard, le champ électrique est appliqué à travers le gel. Le champ provoque le déplacement des molécules chargées négativement vers l'électrode positive. La matrice de gel agit comme un tamis moléculaire à travers lequel les plus petites molécules passent ou se déplacent rapidement tandis que les molécules plus grosses se déplacent lentement. Cela permet la séparation des molécules en fonction de la charge et de la taille. Par conséquent, l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide sont deux types de techniques d'électrophorèse sur gel qui aident principalement à séparer les molécules en fonction de leur taille et de leur charge.
Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel d'agarose ?
L'électrophorèse sur gel d'agarose est une technique qui utilise des gels d'agarose pour séparer les biomolécules telles que l'ADN et l'ARN. C'est une technique utilisée pour séparer les acides nucléiques principalement par taille. Le principal composé appelé agarose utilisé dans cette technique est un polysaccharide. Il provient des algues. L'agarose peut être dissous dans un tampon bouillant, puis versé dans un plateau maintenu horizontalement. Dans le plateau, il se solidifie lorsqu'il refroidit pour former une dalle. Les gels d'agarose sont versés avec un peigne en place pour créer des puits dans lesquels les acides nucléiques tels que l'ADN ou l'ARN sont chargés une fois le gel solidifié.
Figure 01: Électrophorèse sur gel d'agarose
Le gel est ensuite immergé dans un tampon approprié, et un courant est appliqué à travers le gel. L'ADN a une charge négative uniforme qui est indépendante de la composition de la séquence de la molécule. Par conséquent, les molécules d'ADN vont migrer de la cathode (-) vers l'anode (+). La vitesse de migration dépend directement de la taille de la molécule. Les plus grosses macromolécules ont le plus de mal à naviguer dans le gel. D'autre part, les macromolécules plus petites glissent rapidement et assez facilement à travers le gel.
Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide ?
L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide (PAGE) est une technique qui utilise des gels de polyacrylamide pour séparer les biomolécules. C'est une technique largement utilisée pour séparer les macromolécules biologiques, généralement des protéines et des acides nucléiques, en fonction de leur mobilité électrophorétique. L'hydratation de l'acrylonitrile entraîne la formation de molécules d'acrylamide par la nitrile hydratase. L'acrylamide est soluble dans l'eau et, lors de l'ajout d'initiateurs de radicaux libres, l'acrylamide polymérise, entraînant la formation d'un gel de polyacrylamide. Normalement, des concentrations accrues d'acrylamide entraînent une diminution de la taille des pores dans le gel. Les gels de polyacrylamide sont coulés verticalement, contrairement aux gels d'agarose.
Figure 02: Électrophorèse sur gel de polyacrylamide
Dans l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide, les molécules peuvent fonctionner dans leur état natif, préservant la structure d'ordre supérieur des molécules. Cette méthode est appelée PAGE native. Alternativement, un dénaturant chimique peut également être ajouté pour supprimer la structure d'ordre supérieur et transformer la molécule en une molécule non structurée dont la mobilité ne dépend que de sa longueur. Ce type est appelé SDS-PAGE.
Quelles sont les similitudes entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide ?
- L'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide sont deux types de techniques d'électrophorèse sur gel.
- En fait, ce sont des techniques de biologie moléculaire.
- Les deux techniques sont utilisées pour détecter des macromolécules biologiques comme l'ADN et les protéines.
- Ces techniques sont réalisées par des techniciens qualifiés ou des chercheurs.
- Dans les deux techniques, la séparation des macromolécules est basée sur la charge et la taille.
- Les deux techniques permettent la séparation d'acides nucléiques comme l'ADN et l'ARN.
Quelle est la différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide ?
L'électrophorèse sur gel d'agarose est une technique qui utilise des gels d'agarose versés horizontalement pour séparer les biomolécules, tandis que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide est une technique qui utilise des gels de polyacrylamide versés verticalement pour séparer les biomolécules. C'est la principale différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide. De plus, l'électrophorèse sur gel d'agarose est utilisée pour la séparation de l'ADN et de l'ARN, tandis que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide est utilisée pour la séparation des acides nucléiques tels que l'ADN, l'ARN ou les protéines.
Le tableau suivant résume la différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide.
Résumé - Électrophorèse sur gel d'agarose vs polyacrylamide
L'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide sont deux types de techniques d'électrophorèse sur gel utilisées dans les laboratoires de biologie moléculaire. L'électrophorèse sur gel d'agarose utilise un gel d'agarose pour séparer les biomolécules. L'agarose n'est généralement pas toxique pour l'homme, tandis que le polyacrylamide est toxique pour l'homme. De plus, l'électrophorèse sur gel d'agarose montre une faible résolution tandis que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide montre une plus grande résolution. L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide utilise un gel de polyacrylamide pour séparer les biomolécules. Ceci résume la différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide
