shRNA vs siRNA
Au cours du processus d'interférence ARN (ARNi), l'expression d'un gène cible est renversée avec une spécificité et une sélectivité élevées. L'ARNi est un processus naturel, et il implique de petits ARN interférents (siRNA) et des ARN en épingle à cheveux courts (shRNA) et des shARN bifonctionnels. Actuellement, l'ARNi est largement utilisé comme outil de traitement personnalisé du cancer. Les applications de l'ARNi sont essentiellement réalisées avec les molécules d'ARNsi double brin synthétisées chimiquement et à base de vecteurs. Bien que ces deux molécules aient des résultats fonctionnels similaires, elles diffèrent par leur structure; ainsi, les mécanismes d'action moléculaires, les voies de l'ARN et les effets hors cible de ces deux molécules diffèrent également.
shARN
shRNA est une séquence de petite molécule d'ARN qui effectue un virage en épingle à cheveux serré qui peut être utilisé pour faire taire l'expression d'un gène cible pendant l'ARNi. L'expression du shRNA est réalisée par un vecteur, qui peut être soit un virus, soit une bactérie, soit par délivrance de plasmides. Ils sont synthétisés dans le noyau des cellules et transportés vers le cytoplasme pour d'autres processus. Ces molécules ont des voies de maturation similaires des miARN; ainsi, la synthèse de miARN a fourni les bases pour la compréhension de la synthèse de shARN. L'ARN polymérase II ou III peut transcrire le shRNA via les promoteurs de l'ARN polymérase II ou III. L'avantage de l'utilisation des shARN est qu'ils ont un taux de dégradation et de renouvellement relativement faible. L'inconvénient est qu'il nécessite un vecteur d'expression, ce qui peut entraîner des problèmes de sécurité.
siARN
siRNAs sont des molécules d'ARN double brin composées de 20 à 25 paires de bases de longueur. Ceux-ci sont utilisés pour la suppression de gènes en faisant taire tout gène avec une séquence de nucléotides complémentaire dans la voie de l'ARNi. L'inactivation du gène par transfection d'ARNsi échoue souvent en raison de l'effet transitoire; surtout dans les cellules à division rapide et la suppression ne dure pas plus longtemps. Pour surmonter ce problème, le siRNA est modifié en introduisant une structure en épingle à cheveux courte. Cette molécule modifiée est alors connue sous le nom de shRNA. Le shRNA doit être converti en siRNA par un Dicer afin de poursuivre sa fonction normale.
Quelle est la différence entre le shRNA et le siRNA ?
• Contrairement au siRNA, le shRNA a une structure en épingle à cheveux supplémentaire. shRNA est une version modifiée de siRNA.
• le shRNA nécessite un vecteur d'expression, contrairement au siRNA.
• Le shRNA peut être utilisé pour l'inactivation à long terme, tandis que le siARN ne peut être utilisé que pour l'inactivation à court terme des gènes.
• Contrairement à la suppression génique de l'ARNsi, la suppression de l'ARNsh dure longtemps et, si elle est insérée via un vecteur viral approprié, elle peut produire des effets permanents de silençage génique.
• Dicer est nécessaire pour reconvertir le shRNA en molécule de siRNA afin d'exécuter ses fonctions normales.
