Transposon vs Retrotransposon
Les transposons et les rétrotransposons sont des composants génétiques de l'ADN, et il existe des différences majeures entre eux. Le pourcentage de présence de ces matériels génétiques varie selon les espèces et leurs fonctions déterminent le destin de l'organisme avec des mutations et d'autres changements phénotypiquement importants. Les transposons et les rétrotransposons sont des gènes ou des collections de certains gènes situés dans les brins d'ADN, et les altérations de leurs emplacements ont été les principales causes de ces conséquences. Cependant, cet article entend discuter brièvement des fonctions de ces gènes et présente une comparaison entre transposons et rétrotransposons.
Qu'est-ce que Transposon ?
Les transposons sont des fragments ou des segments intéressants d'ADN capables de modifier l'emplacement du brin d'ADN sous la forme d'un mécanisme de couper-coller. En raison de cette nature mobile des transposons, ceux-ci sont connus sous le nom de gènes sauteurs. Les transposons sont de deux types principaux appelés transposons de classe I et transposons de classe II. Habituellement, le type de classe II est appelé transposons et le type de classe I est appelé rétrotransposons. Les processus de découpage et de collage de segments d'ADN mobiles sont régulés par l'enzyme transposase. L'enzyme se lie aux deux extrémités du transposon et coupe les liaisons phosphodiester du brin d'ADN, isole le transposon, le déplace vers le site cible et se lie au nouvel emplacement. Cependant, ce processus est intéressant à comprendre, car certains transposons ne peuvent se déplacer vers certains endroits qu'en raison de l'incompatibilité des séquences de bases avec le site cible. Les gènes dont une extrémité d'un seul brin a la même séquence de bases que l'autre extrémité de l'autre simple brin sont des transposons à bords collants, car ceux-ci peuvent se lier aux sites du brin d'ADN cible avec la même séquence de bases que dans les extrémités collantes. Cependant, cette mobilité des gènes peut provoquer des modifications du génotype ainsi que du phénotype de l'organisme. Les scientifiques ont inventé les transposons et les aliments et organismes génétiquement modifiés selon les personnalisations préférées ont alors été mis à disposition. Cultures agricoles très productives, antibiotiques aux vertus médicinales, animaux d'élevage font partie des produits avantageusement développés après l'invention des transposons par Barbara McClintock dans les années 1940.
Qu'est-ce que le rétrotransposon ?
Les rétrotransposons sont les transposons de classe I, et ceux-ci se déplacent à travers le génome par le mécanisme du copier-coller. Le mécanisme de la mobilité des rétrotransposons implique quelques étapes majeures telles que la copie du segment de gène du brin d'ADN dans l'ARN, le transfert de la copie de l'ARN vers le site cible, la transcription de la séquence d'ARN en ADN à l'aide de la transcriptase inverse et l'insertion. du gène dans le nouvel emplacement du brin d'ADN du génome. Les deux extrémités de ces rétrotransposons ont généralement de longues répétitions terminales avec environ 1000 paires de bases, et celles-ci sont utilisées comme caractéristiques d'identification de ces gènes. Ces gènes sont facilement amplifiés à l'intérieur du génome, et le pourcentage de rétrotransposons dans le génome humain est d'environ 50 %. Ceux-ci pourraient être assez dangereux car les virus responsables du SIDA, du VIH et du virus de la leucémie à cellules T ont les rétrotransposons dans leurs génomes d'ARN. En fait, ces virus peuvent lier les rétrotransposons dans n'importe quel site des brins d'ADN humain grâce à l'utilisation de la transcriptase inverse et de l'intégrase. L'enzyme intégrase fonctionne de la même manière que la transposase dans les transposons de classe II.
Quelle est la différence entre Transposon et Retrotransposon ?
• Les transposons sont des gènes sauteurs de classe II tandis que les rétrotransposons appartiennent à la catégorie de classe I.
• Les transposons fonctionnent avec l'enzyme transposase tandis que les rétrotransposons fonctionnent avec l'utilisation de deux enzymes principales appelées transcriptase inverse et intégrase.
• Les extrémités terminales sont beaucoup plus longues dans les rétrotransposons que dans les transposons.
• Les transposons sont coupés à partir de l'origine et collés à la cible; à l'inverse, les rétrotransposons sont copiés de l'origine dans l'ARN et transcrits au niveau de la cible.
• Le déplacement des rétrotransposons implique l'ARN mais pas les transposons.
