La principale différence entre le thiocyanate de guanidine et le chlorhydrate de guanidine est que le thiocyanate de guanidine est un dénaturant de protéines plus puissant qui est plus couramment utilisé dans l'isolement d'ARN, tandis que le chlorhydrate de guanidine est un dénaturant de protéines plus faible qui est moins couramment utilisé dans l'isolement d'ARN.
La dénaturation est le processus par lequel les protéines perdent leur structure quaternaire, leur structure tertiaire et leur structure secondaire normalement présente à l'état natif. Cela peut être fait par l'application de certaines contraintes externes ou de composés tels qu'un acide ou une base forte, un sel inorganique concentré, un solvant organique (alcool, chloroforme), une agitation, un rayonnement ou de la chaleur. Le thiocyanate de guanidine et le chlorhydrate de guanidine sont deux types différents de dénaturants de protéines.
Qu'est-ce que le thiocyanate de guanidine ?
Le thiocyanate de guanidine (GTC) est un agent de dénaturation des protéines plus puissant qui est plus couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN. Il est également connu sous le nom d'isothiocyanate de guanidinium (GITC). Étant un agent chaotropique, c'est un composé chimique couramment utilisé comme dénaturant général des protéines. Un agent chaotropique est une molécule dans une solution aqueuse qui peut perturber le réseau de liaisons hydrogène entre les molécules d'eau. Cela a un effet sur la stabilité de l'état natif d'autres molécules dans la solution, telles que les macromolécules comme les protéines et les acides nucléiques en affaiblissant l'effet hydrophobe. Les agents chaotropiques comme le thiocyanate de guanidine réduisent la quantité d'ordre dans la structure des protéines formées par les molécules d'eau à la fois en vrac et dans les coquilles d'hydratation autour des acides aminés hydrophobes. Cela peut entraîner une dénaturation des protéines.
Le thiocyanate de guanidine peut être utilisé pour désactiver des virus tels que la grippe qui causent des maladies comme la grippe espagnole en 1918. Par conséquent, il peut être utilisé dans des installations médicales ou hospitalières. De plus, le thiocyanate de guanidine est également utilisé pour lyser les cellules et les particules virales dans les extractions d'ARN et d'ADN. Ici, la fonction du thiocyanate de guanidine est de faciliter l'action de lyse et d'empêcher l'activité des enzymes RNase et des enzymes DNase par dénaturation. Ces enzymes endommageraient autrement l'extrait (ARN ou ADN).
Qu'est-ce que le chlorhydrate de guanidine ?
Le chlorhydrate de guanidine (GdnHCl) est un dénaturant protéique plus faible qui est moins couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN. Il est également connu sous le nom de chlorure de guanidinium (GdmCl). C'est le sel chlorhydrate de la guanidine. Le chlorhydrate de guanidine est chaotropique et l'un des dénaturants utilisés dans les études physico-chimiques du repliement des protéines.
Figure 01: Chlorhydrate de guanidine
Le chlorhydrate de guanidine a également la capacité de diminuer l'activité enzymatique et d'augmenter la solubilité des molécules hydrophobes. Normalement, à des concentrations plus élevées de chlorhydrate de guanidine, les protéines perdent leur structure ordonnée. Les protéines ont tendance à s'enrouler au hasard à cette concentration de chlorhydrate de guanidine. En milieu médical ou hospitalier, le chlorhydrate de guanidine est indiqué pour la réduction des symptômes de faiblesse musculaire et de fatigabilité facile associés à la maladie du syndrome d'Eaton-Lambert. En outre, les effets secondaires de l'utilisation du chlorhydrate de guanidine peuvent inclure le périst altisme, la diarrhée et la suppression mortelle de la moelle osseuse.
Quelles sont les similitudes entre le thiocyanate de guanidine et le chlorhydrate de guanidine ?
- Le thiocyanate de guanidine et le chlorhydrate de guanidine sont deux types différents de dénaturants de protéines.
- Les deux dénaturants ont de la guanidine dans leur structure.
- Ce sont des agents chaotropes.
- Les deux dénaturants peuvent être utilisés pour l'isolement de l'ARN.
- Ils sont tous deux utilisés dans les installations médicales ou hospitalières.
Quelle est la différence entre le thiocyanate de guanidine et le chlorhydrate de guanidine ?
Le thiocyanate de guanidine est un agent dénaturant des protéines plus puissant qui est plus couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN, tandis que le chlorhydrate de guanidine est un dénaturant des protéines plus faible qui est moins couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN. C'est donc la principale différence entre le thiocyanate de guanidine et le chlorhydrate de guanidine. De plus, la formule chimique du thiocyanate de guanidine est C2H6N4S, tandis que la formule chimique de chlorhydrate de guanidine est CH5N3HCl.
L'infographie ci-dessous présente les différences entre le thiocyanate de guanidine et le chlorhydrate de guanidine sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Thiocyanate de Guanidine vs Chlorhydrate de Guanidine
Le thiocyanate de guanidine et le chlorhydrate de guanidine sont deux types différents de dénaturants de protéines. Les deux dénaturants sont des chaotropes. Le thiocyanate de guanidine est un agent dénaturant des protéines plus puissant qui est plus couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN, tandis que le chlorhydrate de guanidine est un dénaturant des protéines plus faible qui est moins couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN. Donc, ceci résume la différence entre le thiocyanate de guanidine et le chlorhydrate de guanidine.
