La principale différence entre l'hélice-boucle-hélice et l'hélice-tour-hélice est que l'hélice-boucle-hélice médie la dimérisation des protéines tandis que l'hélice-tour-hélice régule l'expression des gènes par la liaison à l'ADN.
Un motif protéique est une courte séquence conservée associée à des fonctions distinctes de l'ADN. Il est principalement associé à un site structurel particulier avec une fonction chimique ou biologique unique. Ces motifs contiennent de petites régions de structures tridimensionnelles d'acides aminés avec différentes molécules de protéines. Habituellement, les motifs individuels ne contiennent que quelques éléments. Hélice-boucle-hélice et hélice-tourner-hélice contiennent trois éléments. Leurs motifs structuraux protéiques comprennent des boucles de longueurs variables et de structures non spécifiées.
Qu'est-ce que Helix-Loop-Helix ?
Une hélice-boucle-hélice (HLH) est un motif structurel protéique qui définit l'une des plus grandes familles de facteurs de transcription dimérisants. Ces facteurs de transcription contiennent des résidus d'acides aminés pour faciliter le mécanisme de liaison à l'ADN, et ils sont dimères. Le motif structurel de la protéine contient deux hélices α, et elles sont reliées par une boucle. Une hélice apparaît plus petite des deux hélices, et la flexibilité de la boucle permet la dimérisation par tassement et pliage contre une autre hélice. L'hélice qui semble plus grande contient généralement des régions de liaison à l'ADN. Les protéines HLH se lient à une séquence consensus appelée E-box. Une séquence consensus est un ordre calculé contenant des résidus de nucléotides ou d'acides aminés. La boîte électronique est un élément répondant à l'ADN chez certains eucaryotes qui agit comme un site de liaison aux protéines et régule l'expression des gènes.
Figure 01: Motif hélice-boucle-hélice
Les facteurs de transcription HLH sont essentiels au développement et à l'activité cellulaire. Les protéines HLH appartiennent principalement à six groupes, qui sont indiqués par les lettres A à F. Les facteurs de transcription inclus dans chaque groupe sont:
Groupe A: MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD et Neurogenins, groupe B: MAX, C-Myc, N-Myc et TCF4
Groupe C: AhR, BMAL-1-CLOCK, HIF, NPAS1, NPAS3 et MOP5
Groupe D; EMC
Groupe E: HEY1 et HEY2
Groupe F: EBF1
Étant donné que la plupart des facteurs de transcription de HLH sont hétérodimériques, la dimérisation les régule souvent.
Qu'est-ce que Helix-Turn-Helix ?
Helix-turn-helix (HTH) est un motif structurel protéique capable de se lier à l'ADN. Chaque monomère est organisé avec deux hélices α et est relié par un court brin d'acides aminés. Cela se lie à une rainure dans l'hélice d'ADN. Les motifs HTH régulent généralement l'expression des gènes. La reconnaissance de HTH et la liaison à l'ADN sont réalisées par deux hélices α. Une hélice occupe l'extrémité N-terminale tandis que l'autre est à l'extrémité C-terminale. Dans la plupart des scénarios, l'hélice effectue la reconnaissance de l'ADN. Par conséquent, il est connu sous le nom d'hélice de reconnaissance. La liaison au sillon de l'ADN se fait par une série d'interactions de Van der Waals et de liaisons hydrogène avec des bases exposées. L'autre hélice α stabilise l'interaction entre la protéine et l'ADN et ne joue pas un rôle majeur dans la reconnaissance. Cependant, l'hélice de reconnaissance et l'hélice restante ont une orientation similaire.
Figure 02: Hélice-tournant-hélice de la famille TetR
Le HTH est classé selon la structure et les arrangements spatiaux des hélices. Les principaux types sont les HTH dihélicoïdaux, trihélicoïdaux, tétrahélicoïdaux et ailés. Le type di-hélicoïdal est le type le plus simple avec deux hélices et un domaine protéique repliable indépendant. Le type trihélicoïdal se trouve dans l'activateur transcriptionnel Myb. Le type tétra-hélicoïdal a une hélice C-terminale supplémentaire. Enfin, le HTH ailé est formé d'un faisceau à 3 hélices et d'une feuille bêta à 3 ou 4 brins.
Quelles sont les similitudes entre Helix-Loop-Helix et Helix-Turn-Helix ?
- Helix-loop-helix et helix-turn-helix sont des motifs structuraux de protéines.
- Les deux contiennent un dénominateur commun dans les facteurs de transcription basaux et spécifiques.
- Ils sont présents chez les eucaryotes.
Quelle est la différence entre Helix-Loop-Helix et Helix-Turn-Helix ?
Helix-loop-helix médie la dimérisation des protéines, tandis que helix-turn-helix régule l'expression des gènes par la liaison à l'ADN. C'est donc la principale différence entre hélice-boucle-hélice et hélice-tournant-hélice. En outre, HLH contient certains proto-oncogènes et gènes impliqués dans la différenciation codant pour des facteurs de transcription, tandis que HTH contient de nombreux gènes homéotiques qui codent pour des facteurs de transcription. De plus, l'hélice-boucle-hélice est principalement constituée d'hélices alpha reliées par une boucle, tandis que l'hélice-tour-hélice est principalement constituée de boucles reliées par un court support d'acides aminés formant un sillon.
L'infographie ci-dessous présente les différences entre hélice-boucle-hélice et hélice-tournant-hélice sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Helix-Loop-Helix vs Helix-Turn-Helix
Un motif protéique est une courte séquence conservée associée à des fonctions distinctes de l'ADN. Hélice-boucle-hélice et hélice-tour-hélice sont deux types de motifs structuraux protéiques. le différence clé entre hélice-boucle-hélice et hélice-tour-hélice est que l'hélice-boucle-hélice médie la dimérisation des protéines, tandis que l'hélice-tour-hélice régule l'expression des gènes par la liaison à l'ADN. HLH est un motif structurel protéique qui définit l'une des plus grandes familles de facteurs de transcription dimérisants. Le motif structurel de la protéine contient deux hélices α, et elles sont reliées par une boucle. HTH est un motif structurel protéique capable de se lier à l'ADN. Chaque monomère est organisé avec deux hélices α et est relié par un court brin d'acides aminés et se lie à un sillon dans l'hélice d'ADN. Donc, cela résume la différence entre helix-loop-helix et helix-turn-helix.
