La principale différence entre les LINE et les SINE est que les LINE (éléments nucléaires intercalés longs) sont un type de rétrotransposons non LTR plus longs, tandis que les SINE (éléments nucléaires intercalés courts) sont un type de rétrotransposons non LTR beaucoup plus courts.
Les rétrotransposons non-LTR ne contiennent pas de longues répétitions terminales (LTR). Cependant, ils contiennent des gènes pour la transcriptase inverse, la protéine de liaison à l'ARN, la nucléase et le domaine H de la ribonucléase. Les rétrotransposons non LTR ont de courtes répétitions. Ces répétitions ont un ordre inversé de bases les unes à côté des autres. En dehors de cela, les rétrotransposons non LTR ont également des répétitions directes trouvées dans les transposons LRT. Les rétrotransposons non LTR se répartissent en deux catégories, les LINE et les SINE.
Que sont les LINE ?
LINEs (longs éléments nucléaires intercalés) sont des rétrotransposons non-LTR plus longs. Ils sont répandus dans les génomes des eucaryotes. Ils représentent généralement 21,1% du génome humain. Chaque LIGNE est longue d'environ 7000 paires de bases. Les LINE peuvent se transcrire en ARNm et se traduire en une protéine qui peut fonctionner comme une enzyme transcriptase inverse. Cette transcriptase inverse produit des copies d'ADN de l'ARN des LINE. Ces copies d'ADN peuvent être intégrées dans le génome sur un nouveau site.
Figure 01: LIGNES et SINE
Le génome humain n'a qu'une seule LIGNE abondante appelée LIGNE-1. L'élément LINE-1 a une longueur d'environ 6000 paires de bases. Il y a environ 100 000 éléments tronqués de LINE-1 dans le génome humain. Une mutation aléatoire peut se produire dans les LINE. En raison de mutations aléatoires, les LINE peuvent dégénérer. Ils ne sont plus transcrits ni traduits. Par ailleurs, les LINE sont regroupées en cinq groupes principaux tels que L1, RTE, R2, I et jockey. Ces cinq groupes se subdivisent en 28 autres clades.
LINEs sont normalement propagées par un mécanisme appelé mécanisme de transcription inverse amorcé cible (TPRT). L'insertion de LINE provoque des maladies humaines telles que l'hémophilie A, le cancer, les troubles mendéliens, etc. L'hypométhylation des LINE déclenche également certains types de cancer.
Que sont les SINE ?
SINE (éléments nucléaires intercalés courts) sont un type de rétrotransposons non-LTR beaucoup plus courts. Ils ont une longueur d'environ 100 à 700 paires de bases. Les SINE sont également des éléments d'ADN qui s'amplifient dans les génomes eucaryotes via des intermédiaires d'ARN. Les SINE représentent environ 13 % du génome des mammifères. Les régions internes des SINE proviennent de l'ARNt. Il reste très conservé. Ils sont souvent présents dans de nombreuses espèces de vertébrés et d'invertébrés. La variation du nombre de copies et les mutations dans les SINE peuvent être incorporées pour construire la classification des espèces basée sur la phylogénie.
Les SINE peuvent être regroupés en trois types principaux: CORE-SINE, V-SINE et AmnSINE. L'élément Alu est le SINE le plus courant chez les primates. De plus, il existe plus de 50 maladies humaines associées à l'insertion de SINE. Lorsqu'ils s'insèrent à l'intérieur ou à proximité d'exons, ils peuvent provoquer un épissage incorrect ou modifier le cadre de lecture. Cela conduit à des phénotypes de maladies tels que le cancer du sein, le cancer du côlon, la leucémie, l'hémophilie, la fibrose kystique, le cancer du côlon, la maladie de Dent, la neurofibromatose, etc.
Quelles sont les similarités entre les LIGNES et les SINE ?
- LINEs et SINEsont deux types de rétrotransposons non-LTR.
- Les deux n'ont pas de longues régions terminales (LTR).
- Les deux ne se trouvent principalement que chez les eucaryotes.
- Ils sont tous les deux non autonomes.
Quelle est la différence entre les LIGNES et les SINE ?
LINEs sont des rétrotransposons non-LTR plus longs, tandis que les SINE sont des rétrotransposons non-LTR beaucoup plus courts. C'est donc la principale différence entre les LIGNES et les SINE. De plus, LINES code pour l'enzyme transcriptase inverse, tandis que SINE ne code pas pour l'enzyme transcriptase inverse. C'est donc une autre différence entre les LIGNES et les SINE.
D'autres différences entre les LIGNES et les SINE sont répertoriées ci-dessous sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - LIGNES vs SINE
Les rétrotransposons se trouvent principalement chez tous les eucaryotes mais sont absents chez les procaryotes. Environ 37% du génome humain contient des rétrotransposons. Les rétrotransposons sont principalement de deux types: les rétrotransposons LTR et non LTR. Les rétrotransposons non-LTR ne contiennent pas de longues répétitions terminales (LTR), qui sont présentes dans les rétrotransposons LTR. Les rétrotransposons non-LTR sont en outre divisés en deux catégories: les lignes et les sinus. Les LINE sont des rétrotransposons non LTR plus longs, tandis que les SINE sont des rétrotransposons non LTR beaucoup plus courts. Voici donc le résumé de la différence entre les LIGNES et les SINE.
