La principale différence entre l'éditeur de liens et l'adaptateur est qu'un éditeur de liens n'a pas d'extrémités cohésives alors qu'un adaptateur a une extrémité cohésive.
La ligature de l'ADN est le processus de jonction de deux molécules d'ADN, formant des liaisons phosphodiester. L'enzyme appelée ADN ligase catalyse cette réaction. C'est l'une des étapes critiques dans les domaines de la biologie moléculaire moderne tels que la technologie de l'ADN recombinant et le clonage de l'ADN. L'efficacité de la ligature dépend des extrémités des molécules d'ADN à ligaturer. Il existe deux types d'extrémités d'ADN, les extrémités collantes et les extrémités franches. L'efficacité de la ligature est plus élevée avec les extrémités collantes qu'avec les extrémités franches. Si les molécules d'ADN cibles ont des extrémités franches, des molécules appelées adaptateurs ou lieurs seront utiles. Les adaptateurs et les lieurs sont des molécules oligonucléotidiques synthétisées chimiquement qui aident à la ligature de l'ADN. Ils ont également des sites de restriction internes. L'adaptateur a une extrémité collante et une extrémité émoussée, tandis que le lieur a deux extrémités émoussées.
Qu'est-ce qu'un éditeur de liens ?
Linker est une séquence oligonucléotidique synthétisée chimiquement qui est double brin. Linker a deux extrémités franches. Le lieur est utilisé pour lier les molécules d'ADN qui ont des extrémités franches aux vecteurs. Il contient un ou plusieurs sites de restriction internes. Ces sites de restriction fonctionnent comme des sites de reconnaissance pour les enzymes de restriction.
Figure 01: Lien
Après la ligature, l'ADN est à nouveau restreint avec des enzymes de restriction pour produire des extrémités cohésives. Les lieurs EcoRI et les lieurs sal-I sont des lieurs couramment utilisés.
Qu'est-ce qu'un adaptateur ?
Un adaptateur est une séquence oligonucléotidique double brin utilisée pour lier deux molécules d'ADN ensemble. C'est une courte séquence avec une extrémité émoussée et une extrémité collante ou cohésive. Par conséquent, il se compose d'une queue simple brin à une extrémité, ce qui améliore l'efficacité de la ligature de l'ADN.
Figure 02: Ligature de l'ADN par un adaptateur
De plus, l'adaptateur a des sites de restriction internes. Par conséquent, après la ligature, l'ADN peut être restreint avec des enzymes de restriction appropriées afin de créer une nouvelle extrémité saillante. Un inconvénient des adaptateurs est que deux adaptateurs peuvent former des gradateurs par appariement de base avec eux-mêmes. Cela peut être évité en les traitant avec l'enzyme appelée phosphatase alcaline.
Quelles sont les similitudes entre l'éditeur de liens et l'adaptateur ?
- Le lieur et l'adaptateur sont de courtes séquences d'oligonucléotides double brin.
- Ils portent des sites de restriction internes.
- De plus, ce sont des molécules d'ADN synthétisées chimiquement et ce sont des molécules synthétiques.
- Ils peuvent lier deux molécules d'ADN ensemble.
- Après la ligature des lieurs et des adaptateurs, l'ADN est à nouveau restreint avec des enzymes de restriction afin de produire des extrémités collantes.
Quelle est la différence entre l'éditeur de liens et l'adaptateur ?
Un lieur est un court duplex d'oligonucléotides synthétisé chimiquement avec deux extrémités franches. Un adaptateur est un court duplex d'oligonucléotides synthétisé chimiquement avec une extrémité collante et une extrémité franche. C'est donc la principale différence entre l'éditeur de liens et l'adaptateur. De plus, les adaptateurs peuvent former des dimères, tandis que les lieurs ne forment pas de dimères. C'est donc une autre différence significative entre l'éditeur de liens et l'adaptateur.
Vous trouverez ci-dessous un résumé des différences entre l'éditeur de liens et l'adaptateur sous forme de tableau.
Résumé - Linker vs Adaptor
Le lieur et l'adaptateur sont deux types d'oligonucléotides synthétisés chimiquement qui sont utiles pour ligaturer l'ADN à extrémité franche. Le lieur a deux extrémités émoussées, tandis que l'adaptateur a une extrémité émoussée et une extrémité cohésive. C'est donc la principale différence entre l'éditeur de liens et l'adaptateur. Ce sont des molécules double brin qui ont des sites de restriction internes. Ils sont largement utilisés dans la technologie de l'ADN recombinant et le clonage d'ADN.
