La principale différence entre la séquence conservée et la séquence consensus est que la séquence conservée fait référence à des séquences similaires d'acides nucléiques ou d'acides aminés qui se produisent dans des espèces différentes ou identiques au fil des générations, tandis que la séquence consensus est une séquence de nucléotides ou une séquence d'acides aminés couramment rencontrée. dans une région hautement conservée d'ADN ou d'ARN ou de protéine.
Les organismes partagent des caractéristiques similaires et différentes. Lors de l'étude des relations entre les organismes et de leur classification, le génome ou la constitution génétique des organismes est très important. Certaines séquences de nucléotides ou d'acides aminés sont communes à différents organismes. Une séquence conservée est une séquence d'acides nucléiques ou d'acides aminés qui est cohérente parmi les espèces. Par conséquent, ils sont phylogénétiquement importants lors de la génération d'arbres phylogénétiques. Dans les séquences conservées, il existe des séquences nucléotidiques spécifiques que l'on trouve plus couramment. Elles sont connues sous le nom de séquences consensus.
Qu'est-ce qu'une séquence conservée ?
Une séquence conservée est une séquence d'acide nucléique ou une séquence d'acides aminés qui est similaire parmi les espèces. Par conséquent, il est cohérent à travers les espèces tout au long de l'évolution. Généralement, ces séquences sont maintenues par sélection naturelle. Ils restent inchangés jusqu'en haut de l'arbre phylogénétique. Par conséquent, les séquences conservées sont importantes dans la construction d'arbres phylogénétiques. On pense que les séquences hautement conservées ont souvent une valeur fonctionnelle importante. Ils sont également utiles pour identifier les maladies génétiques. Cependant, les séquences conservées peuvent être des séquences d'acide nucléique codantes ou non codantes. De plus, les séquences conservées montrent des taux de mutation plus lents. Par conséquent, ils montrent des changements très minimes dans leur composition; parfois, ils ne montrent pas de changements au fil des générations.
Figure 01: Séquence conservée
Les composants ARN des ribosomes sont présents dans tous les domaines de la vie, les séquences homéobox chez les eucaryotes et l'ARNtm chez les bactéries sont plusieurs exemples de séquences hautement conservées. L'identification des séquences conservées est facile lorsque des approches bioinformatiques, en particulier l'outil d'alignement de séquences, sont utilisées. De plus, l'alignement de séquences multiples facilite la visualisation des séquences conservées.
Qu'est-ce que la séquence de consensus ?
Une séquence consensus est une séquence que l'on trouve couramment dans une région conservée donnée de l'ADN ou de l'ARN. C'est une séquence nucléotidique très spécifique. A titre d'exemple, il existe une séquence consensus en -10 comme TATAAT (boîte de Pribnow) dans les promoteurs d'E. coli, qui sont des séquences hautement conservées. De même, il existe une autre séquence consensus: TTGACA dans les promoteurs d'E. coli au -35 également. Les séquences de consensus sont également appelées "boîtes".
Figure 02: Séquence de consensus
En plus de l'ADN et de l'ARN, les protéines ont également des séquences consensus d'acides aminés. Les sites de liaison aux protéines sont souvent représentés par des séquences consensus. Les enzymes de restriction ont également des séquences consensus. De plus, les sites d'épissage sont également des séquences consensus. Semblables aux séquences conservées, les séquences consensus peuvent être calculées et visualisées par des outils bioinformatiques.
Quelles sont les similitudes entre la séquence conservée et la séquence consensus ?
- Les séquences conservées et consensus sont des séquences d'acides nucléiques ou d'acides aminés communes à toutes les espèces.
- Les séquences conservées et consensus peuvent être visualisées par des outils bioinformatiques.
- Ils sont largement utilisés en biologie moléculaire.
Quelle est la différence entre une séquence conservée et une séquence consensus ?
La séquence conservée est une séquence d'acides nucléiques ou d'acides aminés qui est cohérente entre les espèces, tandis que les séquences consensus sont des bases ou des acides aminés très spécifiques et couramment trouvés dans une région conservée donnée. C'est donc la principale différence entre la séquence conservée et la séquence consensus. De plus, une autre différence entre la séquence conservée et la séquence consensus est que les séquences conservées sont phylogénétiquement importantes alors que les séquences consensus sont souvent des sites de liaison de protéines, des sites d'épissage, des sites de coupure d'enzymes de restriction, etc.
Résumé – Séquence Conservée vs Consensuelle
Les séquences conservées sont les séquences d'acides nucléiques ou de protéines qui sont similaires parmi les espèces vivantes. Un promoteur, un site de liaison au ribosome, une origine de réplication et une séquence d'acides aminés de la protéine histone sont plusieurs exemples de séquences conservées. En revanche, les séquences consensus sont des bases ou des acides aminés spécifiques qui se trouvent plus couramment dans une séquence conservée donnée. La boîte -10, la boîte -35 du promoteur d'E. coli, les sites de liaison aux protéines, les sites d'épissage et les sites de reconnaissance des enzymes de restriction sont plusieurs exemples de séquences consensus. Voici donc le résumé de la différence entre la séquence conservée et la séquence consensus.
