La principale différence entre le gène candidat et le GWAS est que l'approche du gène candidat étudie la variation génétique au sein d'un petit nombre de gènes d'intérêt prédéfinis, tandis que le GWAS étudie l'ensemble du génome à la recherche d'une variation génétique commune à l'origine d'une maladie particulière.
L'approche des gènes candidats et les études d'association à l'échelle du génome (GWAS) sont deux méthodes importantes pour détecter la susceptibilité génétique aux maladies. L'approche des gènes candidats est basée sur un petit nombre de gènes pré-spécifiés tandis que GWAS est basée sur le test du génome entier. Par conséquent, l'approche des gènes candidats nécessite une connaissance préalable des gènes pertinents pour la maladie, contrairement à GWAS.
Qu'est-ce que le gène candidat ?
L'approche des gènes candidats est l'une des techniques qui étudient l'association entre la variation génétique au sein de gènes d'intérêt prédéfinis et les phénotypes ou les états pathologiques. Dans cette approche, il est nécessaire d'avoir une connaissance préalable de l'impact fonctionnel biologique du gène sur le trait ou la maladie en question. Sur la base de ces connaissances, un petit nombre de gènes sont sélectionnés et analysés pour la variation génétique.
Figure 01: Approche du gène candidat
La sélection des gènes est basée sur la pertinence biologique, physiologique et fonctionnelle de la maladie en question dans cette approche. Cette approche est souvent conçue comme une étude cas-témoins.
Qu'est-ce que GWAS ?
GWAS est synonyme d'étude d'association à l'échelle du génome. Il fait également référence aux études d'association du génome entier. Ces études portent principalement sur des études observationnelles. Ils analysent les variantes génétiques de différents individus généralement associées à un trait spécifique. L'ensemble du génome est important pour l'analyse GWAS.
GWAS est un outil important dans l'analyse des polymorphismes mononucléotidiques associés à diverses maladies. Il s'agit d'une étude comparative des différents polymorphismes d'un seul nucléotide dans une large population. L'échantillon d'étude de GWAS est très élevé; par conséquent, il prend également le format d'une étude de cohorte transversale.
Figure 02: GWAS
La première étude GWAS a eu lieu en ce qui concerne l'infarctus du myocarde et l'analyse des gènes associés à l'infarctus du myocarde. À l'heure actuelle, GWAS joue un rôle important dans la détermination du fond génétique de maladies complexes d'étiologie inconnue.
Quelles sont les similitudes entre le gène candidat et le GWAS ?
- L'approche du gène candidat et la GWAS sont des techniques qui analysent l'association génétique entre le génotype et le phénotype de la maladie.
- Les deux approches aident à comprendre la base génétique de la susceptibilité à la maladie.
Quelle est la différence entre le gène candidat et le GWAS ?
L'approche des gènes candidats est basée sur les gènes candidats ou les gènes pré-spécifiés, tandis que GWAS est basée sur l'ensemble du génome. C'est donc la principale différence entre le gène candidat et le GWAS. De plus, dans l'approche des gènes candidats, la sélection des gènes est nécessaire alors qu'elle n'est pas nécessaire dans GWAS.
De plus, l'approche des gènes candidats nécessite une connaissance préalable des gènes pertinents pour la maladie, alors qu'elle n'est pas nécessaire pour le GWAS.
L'infographie ci-dessous fournit une comparaison plus détaillée liée à la différence entre le gène candidat et GWAS.
Résumé – Gène Candidat vs GWAS
Le gène candidat et le GWAS sont deux études d'association de gènes. L'approche des gènes candidats se concentre sur la variation génétique associée à la maladie au sein d'un petit nombre de gènes pré-spécifiés. En revanche, GWAS étudie la variation génétique associée à la maladie dans l'ensemble du génome. C'est donc la principale différence entre le gène candidat et le GWAS. Les deux méthodes sont importantes pour comprendre la base génétique de la susceptibilité à la maladie.
