La principale différence entre la FISH et la CGH est que la FISH est une technique moléculaire qui détecte une séquence d'ADN spécifique sur un chromosome à l'aide de sondes marquées par fluorescence, tandis que la CGH est une autre technique de cytogénétique moléculaire qui détecte les altérations de l'ADN génomique.
L'analyse cytogénétique joue un rôle important en médecine lors de la détection d'anomalies chromosomiques telles que les aneuploïdies, les délétions, les duplications et les réarrangements, etc. Les anomalies chromosomiques conduisent éventuellement à des maladies génétiques telles que le cancer, l'infertilité, le syndrome de Down, le syndrome de Klinefelter, Turner syndrome, leucémie, etc. Il existe différentes méthodes de cytogénétique moléculaire pour détecter les défauts et maladies mentionnés ci-dessus. Parmi elles, la FISH (hybridation fluorescente in situ) et la CGH (hybridation génomique comparative) sont deux techniques d'hybridation puissantes. Cependant, les deux méthodes ont des avantages et des inconvénients.
Qu'est-ce que le POISSON ?
FISH est une technique d'hybridation d'acides nucléiques effectuée sur une portion ou une section de tissu, dans l'ensemble du tissu ou des cellules. C'est une méthode basée sur la sonde. La technique repose sur la théorie de l'appariement de bases complémentaires de Watson Crick, aboutissant soit à des hybrides ADN – ADN, soit à des hybrides ADN – ARN, qui peuvent ainsi détecter des gènes mutés ou identifier le gène d'intérêt. En outre, cette technique utilise des séquences d'ADN simple brin, des séquences d'ADN double brin, des séquences d'ARN simple brin ou un oligonucléotide synthétique préparé en utilisant la traduction de coupure comme sondes qui sont complémentaires aux séquences de gènes d'intérêt. En outre, la caractéristique la plus importante de cette technique est le marquage des sondes avec des colorants fluorescents. Ainsi, les sondes se lient aux parties complémentaires du chromosome et facilitent la détection.
De plus, FISH est une méthode très sensible et spécifique. Par conséquent, il s'agit d'une technique courante à la fois dans la recherche et le diagnostic des hémopathies malignes et des tumeurs solides. Mais, FISH montre une faible résolution. Cela nécessite également une connaissance préalable de l'anomalie cible pour concevoir des séquences de sonde.
Figure 01: POISSON
Il existe de nombreuses applications de FISH, principalement dans le diagnostic moléculaire des maladies infectieuses pour identifier la présence d'agents pathogènes et pour confirmer l'agent pathogène via des diagnostics moléculaires. De plus, FISH est une technique couramment utilisée dans les domaines de la biologie du développement, du caryotypage et de l'analyse phylogénétique et de la cartographie physique des chromosomes.
Qu'est-ce que CGH ?
L'hybridation génomique comparative (CGH) est une autre technique de cytogénétique moléculaire basée sur l'ADN qui peut détecter les altérations des séquences d'ADN génomique. La méthode est une méthode avancée qui peut analyser les modifications chromosomiques et génétiques pour détecter les changements ou les altérations dans les séquences d'ADN génomique. De plus, CGH nécessite l'isolement et la fragmentation de l'ADN de l'échantillon expérimental et de l'échantillon de référence. Ensuite, les échantillons doivent être étiquetés à l'aide de deux colorants fluorescents différents (généralement rouge et vert). Plus tard, les deux échantillons sont mélangés et autorisés pour une hybridation compétitive. La dernière étape est l'analyse des échantillons pour les altérations de l'ADN telles que la duplication de gènes, la perte de gènes, etc. En particulier, elle mesure les différences de nombre de copies d'ADN entre l'échantillon de test et l'échantillon de contrôle.
Figure 02: CGH
Une autre version de CGH est maintenant disponible; c'est une méthode plus avancée que la CGH normale. Il s'agit d'une technique appelée CGH basée sur un réseau ou aCGH. aCGH permet l'identification précise de délétions de gènes ou de séquences dans plusieurs milliers de séquences en une seule expérience.
Quelles sont les similitudes entre FISH et CGH ?
- FISH et CGH sont deux techniques moléculaires.
- FISH et CGH reposent sur l'hybridation des acides nucléiques.
- En outre, les deux techniques nécessitent des sondes conçues pour détecter des cibles ADN spécifiques.
- Nous les utilisons pour le diagnostic pré‐natal et post‐natal des maladies génétiques.
- De plus, FISH et CGH sont des outils très puissants pour étudier les altérations génomiques.
- Ils utilisent des colorants fluorescents pour marquer les sondes.
Quelle est la différence entre FISH et CGH ?
FISH est une procédure d'hybridation in situ qui utilise des sondes fluorescentes pour détecter des séquences d'ADN spécifiques, tandis que CGH est une technique d'hybridation moléculaire qui détecte les altérations des séquences d'ADN génomique. C'est donc la principale différence entre FISH et CGH.
De plus, FISH nécessite une connaissance préalable de l'anomalie cible pour concevoir des séquences de sonde, tandis que CGH ne nécessite aucune connaissance préalable. En outre, une autre différence entre FISH et CGH est que FISH affiche une résolution limitée tandis que aCGH affiche une résolution élevée.
L'infographie ci-dessous résume la différence entre FISH et CGH.
Résumé – FISH vs CGH
FISH et CGH sont deux techniques de cytogénétique moléculaire qui facilitent la détection de séquences de gènes d'intérêt. FISH facilite la détection d'une séquence d'ADN spécifique sur un chromosome à l'aide de sondes marquées par fluorescence tandis que CGH facilite la détection d' altérations dans l'ADN génomique. C'est donc la principale différence entre FISH et CGH.
