Différence clé - Exome vs Transcriptome
Un gène contient des régions codantes et non codantes. Les séquences codantes sont appelées exons et les séquences non codantes sont appelées introns. La séquence nucléotidique des exons d'un gène représente le code génétique du gène pour synthétiser la protéine spécifique. Par conséquent, les exons restent dans la molécule d'ARNm. La région totale de l'exon du génome est connue sous le nom d'exome et constitue une partie importante du génome. Le code génétique des gènes est converti en code génétique de la molécule d'ARNm, nécessaire à la production de protéines. L'ensemble des molécules d'ARNm transcrites dans une cellule ou une population cellulaire à la fois est appelée transcriptome.le différence clé entre l'exome et le transcriptome est que l'exome représente les séquences des régions d'exon du génome tandis que le transcriptome représente l'ARNm total d'une cellule ou d'un tissu à un moment donné.
Qu'est-ce que l'Exome ?
Les gènes sont composés d'exons, d'introns et de séquences régulatrices. Les exons sont les régions géniques qui sont transcrites en séquence d'ARNm lors de la transcription. Les introns et autres régions non codantes sont éliminés lors de la transcription. La séquence nucléotidique des exons détermine le code génétique du gène qui synthétise la protéine spécifique qu'il code. Seuls les exons restent dans l'ARNm d'une protéine. La collection d'exons dans le génome est connue sous le nom d'exome d'un organisme. Il représente une partie du génome qui s'exprime dans les gènes. Chez l'homme, l'exome représente 1% du génome. C'est la partie codant pour les protéines du génome humain.
Figure 01: Exome
Qu'est-ce que le Transcriptome ?
Le transcriptome est la collection de tous les transcrits (ARN) codant et non codant pour les protéines dans un tissu donné. Le transcriptome représente l'ensemble des molécules d'ARNm totales exprimées par les gènes dans une cellule ou un tissu. Le transcriptome d'une cellule peut varier avec le transcriptome d'un autre type cellulaire. Le transcriptome est également dynamique - il change avec le temps en réponse à des stimuli internes et externes. Même au sein d'un même tissu ou d'un même type de cellule, le transcriptome peut changer après quelques minutes.
Le transcriptome diffère de l'exome d'un organisme. Le transcriptome ne comprend que les séquences d'exome exprimées. Bien que l'exome d'une cellule reste le même, le transcriptome diffère d'une cellule à l'autre car l'expression des gènes n'est pas la même pour toutes les cellules ou tous les tissus. Seuls les gènes essentiels sont exprimés dans les différentes cellules et tissus. L'expression génique est un processus spécifique à un type de tissu ou de cellule. Elle est régulée par divers facteurs dont des facteurs environnementaux. Par conséquent, le transcriptome peut varier en fonction des conditions environnementales externes.
Le transcriptome est utilisé comme précurseur pour les études de protéomique. Toutes les protéines sont dérivées de séquences d'ARNm. Des modifications de traduction peuvent entraîner des changements dans les protéines. Cependant, le transcriptome fournit des informations de base importantes pour les études protéomiques.
Figure 02: Transcriptome des cellules souches embryonnaires
Quelle est la différence entre Exome et Transcriptome ?
Exome vs Transcriptome |
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| Exome est la collection de régions codant pour les protéines des gènes. | Transcriptome est la collection de tous les ARN transcrits, y compris l'ARNm. |
| Échantillon | |
| Exome est étudié à l'aide d'un échantillon d'ADN. | Le transcriptome est étudié à l'aide d'un échantillon d'ARN. |
| Méthode d'étude | |
| Le séquençage complet de l'exome est la méthode d'étude de l'exome. | Le séquençage de l'ARN est la méthode d'étude du transcriptome. |
Résumé – Exome vs Transcriptome
Les exons sont les séquences codantes des gènes et déterminent les séquences d'ARNm des protéines. La collection de ces séquences codantes (exons) est connue sous le nom d'exome d'un organisme. Les gènes sont transcrits en molécules d'ARNm avant de fabriquer des protéines. Les molécules d'ARNm totales d'une cellule ou d'un tissu à un moment donné sont appelées transcriptome. Le transcriptome représente les gènes qui sont activement exprimés en ARNm à un moment donné. Le transcriptome est spécifique aux cellules et aux tissus et affecte les conditions environnementales. C'est la différence entre l'exome et le transcriptome.
