Différence clé - Réparation par excision de base vs réparation par excision de nucléotide
L'ADN est fréquemment soumis à des dommages dus à divers facteurs internes et externes. Cependant, les systèmes de réparation cellulaire corrigent immédiatement et constamment les dommages avant qu'ils ne deviennent des mutations ou avant qu'ils ne soient transférés aux générations suivantes. Il existe trois types de systèmes de réparation par excision dans les cellules: la réparation par excision des nucléotides (NER), la réparation par excision des bases (BER) et la réparation des mésappariements d'ADN (MMR) pour réparer les dommages à l'ADN simple brin. le différence clé entre la réparation par excision de base et la réparation par excision de nucléotide est que la réparation par excision de base est un système de réparation simple qui fonctionne dans les cellules pour réparer les dommages à un seul nucléotide causés de manière endogène, tandis que la réparation par excision de nucléotide est un système de réparation complexe qui fonctionne dans les cellules pour réparer comparativement. des régions plus grandes et endommagées causées de manière exogène.
Qu'est-ce que la réparation par excision de base ?
La réparation par excision de base est la version la plus simple du système de réparation de l'ADN dont disposent les cellules. Il est utilisé pour réparer les dommages mineurs dans l'ADN. Les bases de l'ADN sont modifiées par désamination ou alkylation. Lorsqu'il y a des dommages à la base, l'ADN glycosylase reconnaît et active le système de réparation par excision de base et le récupère à l'aide des enzymes AP endonucléase, ADN polymérase et ADN ligase. Les étapes suivantes sont impliquées dans le système BER.
- Reconnaissance et élimination d'une base incorrecte ou endommagée par une ADN glycosylase pour créer un site abasique (sites de perte de base -sites apiuriniques ou apyrimidiniques).
- Incision du site abasique par une endonucléase apurinique/apyrimidique
- Élimination du fragment de sucre restant par une lyase ou une phosphodiestérase
- Remplissage des lacunes par une ADN polymérase
- Scellement du pseudo par une ADN ligase
Figure 01: Voie de réparation par excision de la base
Qu'est-ce que la réparation par excision de nucléotide ?
La réparation par excision des nucléotides (NER) est un important système de réparation par excision de l'ADN dans les cellules. Il est capable de réparer et de remplacer les régions endommagées jusqu'à 30 bases de longueur et il est dirigé par le brin de gabarit non endommagé. Les dommages courants à l'ADN sont dus au rayonnement ultraviolet et le NER protège l'ADN en réparant ces dommages immédiatement avant de devenir des mutations et de passer aux générations futures ou de provoquer des maladies. Le NER fournit spécifiquement une protection contre les mutations causées indirectement par des facteurs exogènes tels que les carcinogènes environnementaux et chimiques. Le NER est observé dans presque tous les organismes et reconnaît les dommages qui provoquent une distorsion importante de l'hélice d'ADN.
Le processus NER implique l'action de nombreuses protéines telles que XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, etc. et procède via plusieurs mécanismes de type couper-coller. Ces protéines sont essentielles pour l'achèvement du processus de réparation, et un défaut dans l'une des protéines NER est vital et peut provoquer des syndromes récessifs rares: xeroderma pigmentosum (XP), syndrome de Cockayne (CS) et la forme photosensible du trouble des cheveux cassants. trichothiodystrophie (TTD).
Figure 02: Réparation par excision de nucléotide
Quelle est la différence entre la réparation par excision de base et la réparation par excision de nucléotide ?
Base Excision Repair vs Nucleotide Excision Repair |
|
| Base excision repair (BER) est un système de réparation de l'ADN qui se produit dans les cellules. | La réparation par excision de nucléotide (NER) est un autre type de système de réparation de l'ADN présent dans les cellules. |
| Reconnaître les adduits à l'ADN | |
| BER répare les dommages causés aux petits adduits d'ADN. | NER répare les gros adduits à l'ADN. |
| Dommages à l'ADN | |
| BER reconnaît les dommages qui ne causent pas de distorsions significatives de l'hélice d'ADN. | NER reconnaît les dommages qui causent des distorsions importantes de l'hélice d'ADN. |
| Causes des dommages à l'ADN | |
| BER répare les dommages causés par les mutagènes endogènes. | NER répare les dommages causés par les mutagènes exogènes. |
| Complexité | |
| BER est le système de réparation le moins complexe | C'est plus complexe que le BER. |
| Besoin de protéines | |
| BER ne nécessite pas d'autres protéines. | NER nécessite plusieurs produits géniques, en particulier des protéines, pour distinguer les régions endommagées et non endommagées. |
| Performance | |
| BER convient à la correction des dommages sur une seule base. | NER convient au remplacement des régions endommagées. |
Résumé - Réparation par excision de base vs réparation par excision de nucléotide
NER et BER sont deux types de processus de réparation par excision d'ADN présents dans les cellules. BER est capable de réparer de petits dommages causés de manière endogène tandis que NER est capable de réparer des régions de dommages jusqu'à 30 paires de bases de longueur causées principalement par des facteurs exogènes. Le BER diffère du NER dans les types de substrats reconnus et dans l'événement de clivage initial. Le BER peut également reconnaître les dommages qui n'ont pas été causés par des distorsions importantes de l'hélice d'ADN, tandis que le NER reconnaît les distorsions importantes de l'hélice d'ADN. C'est la différence entre la réparation par excision de base et l'excision de nucléotide.
