Différence clé - ADN en amont et en aval
Il est important d'avoir une connaissance générale de la composition et de la structure de l'ADN afin de comprendre la différence entre l'ADN en amont et en aval. L'ADN est composé de chaînes polynucléotidiques. Les nucléotides sont les blocs de construction qui créent les chaînes polynucléotidiques et chaque nucléotide est composé de trois composants: un sucre à cinq carbones, une base azotée et un groupe phosphate. Un groupe phosphate et un groupe OH sont attachés respectivement au carbone en position 5 'et au carbone en position 3' de la molécule de sucre dans un nucléotide. Les nucléotides sont reliés entre eux par des liaisons phosphodiester formées entre le groupe phosphate 5' d'un nucléotide et le groupe OH 3' du nucléotide adjacent. Si une chaîne polynucléotidique a un groupe phosphate 5' libre, il est attribué comme extrémité 5'; s'il a un groupe OH 3' libre, il est affecté comme extrémité 3'. Par conséquent, les brins d'ADN ont généralement des extrémités 5 'et 3' selon les positions finales des chaînes polynucléotidiques. L'ADN existe également sous forme double brin. Deux brins sont antiparallèles l'un à l'autre. Par conséquent, l'ADN a deux brins qui vont dans la direction 5 'à 3' et dans la direction 3' à 5'. L'ADN en amont et en aval est référencé en référence à la transcription et à la synthèse du brin d'ARNm de 5 'à 3'. Si l'ADN est considéré vers l'extrémité 5 du brin codant à partir du site d'initiation de la transcription, il est appelé ADN en amont. Si l'ADN est considéré vers l'extrémité 3 'du brin codant du site d'initiation de la transcription, on parle d'ADN en aval. C'est la principale différence entre l'ADN en amont et en aval.
Qu'est-ce que l'ADN en amont ?
Un gène est une unité structurelle et fonctionnelle héréditaire qui se trouve sur l'ADN d'un organisme. Il est stocké avec des instructions pour construire une protéine. Le gène a une région spécifique d'une molécule d'ADN. Au besoin, il se transcrit et se traduit en une protéine via la synthèse d'un brin d'ARNm. Normalement, un brin codant du gène va de 5 'à 3'. Lorsqu'il est transcrit, il produit un brin d'ARNm dans la même direction 5 'vers 3'. Au cours de la transcription, le brin antisens 3 'à 5' sert de brin matrice et initie la synthèse d'ARNm. Il existe un site d'initiation de la transcription dans le gène. En référence au site d'initiation de la transcription, la région d'ADN vers l'extrémité 5' du brin codant est appelée ADN en amont. Un promoteur du gène est normalement situé dans la région en amont de l'ADN. Dans les gènes eucaryotes, il existe des boîtes TATA, des éléments proximaux promoteurs et des activateurs dans la zone en amont du gène. La région en amont du gène est désignée par des nombres négatifs. L'ADN en amont d'un gène est de la plus haute importance pour la transcription.
Qu'est-ce que l'ADN en aval ?
Le site d'initiation de la transcription est connu comme le point +1 d'un gène. La région d'ADN de +1 point vers l'extrémité 3 'du brin codant est appelée ADN en aval. En d'autres termes, en aval du gène se trouve du site d'initiation de la transcription vers l'extrémité 5' du brin matrice. Par conséquent, l'ADN en aval d'une région de gène comprend une unité de transcription et d'autres séquences telles qu'une séquence de terminaison. Le promoteur peut influencer la séquence en aval d'un gène. La partie en aval d'un gène est désignée par des nombres positifs. L'ADN en aval d'un gène est la région réelle qui donne le produit protéique.
Figure 01: ADN en amont et en aval
Quelle est la différence entre l'ADN en amont et en aval ?
ADN en amont vs en aval |
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| La région d'ADN vers l'extrémité 5' de la séquence codante du site d'initiation de la transcription est connue sous le nom d'ADN en amont. | La région d'ADN vers l'extrémité 3' du brin codant du site d'initiation de la transcription est connue sous le nom d'ADN en aval. |
| Éléments | |
| Les promoteurs et les amplificateurs sont situés sur l'ADN en amont | L'unité de transcription et les séquences de terminaison sont situées dans l'ADN en aval. |
| Numérotation | |
| Les nucléotides de la région en amont sont désignés par des nombres négatifs | Les nucléotides sont désignés par des nombres positifs. |
| Fonction | |
| Cette région contient les éléments nécessaires pour réguler et initier la transcription | Cette région contient des instructions pour produire une protéine et terminer la transcription |
Résumé - ADN en amont vs en aval
Il est facile d'identifier l'amont et l'aval d'un brin d'ARN. En ce qui concerne le site de référence, la région vers l'extrémité 5 'du brin d'ARN est appelée ARN en amont tandis que la région vers l'extrémité 3' est appelée ARN en aval. Cependant, dans l'ADN, il y a deux brins qui vont dans les deux sens 5' à 3' et 3' à 5'. Par conséquent, la différence entre l'ADN en amont et en aval est compliquée. Par conséquent, il est différencié en référence à la transcription d'un gène. Du site d'initiation de la transcription vers l'extrémité 5 du brin sens, la région d'ADN est appelée ADN en amont tandis que du site d'initiation de la transcription vers l'extrémité 3 'du brin sens est appelée ADN en aval. C'est la différence entre l'amont et l'aval de l'ADN.
