Différence clé - Génotypage vs Séquençage
Le génotypage et le séquençage sont deux techniques utilisées pour obtenir des informations sur les acides nucléiques, principalement l'ADN d'un organisme. le différence clé entre le génotypage et le séquençage est que le génotypage est le processus de détermination de la variante génétique que l'individu possède à l'aide de marqueurs, tandis que le séquençage est la détermination de l'ordre correct de la séquence nucléotidique dans le fragment d'ADN donné.
Qu'est-ce que le génotypage ?
Le génotypage est la détermination de la constitution génétique d'un individu à l'aide d'une séquence d'ADN et de marqueurs, ainsi que la comparaison et l'identification de son héritage. Le génotypage est important dans la biologie évolutive, la biologie des populations, la taxonomie, l'écologie et la génétique des organismes. Il peut être réalisé par différentes techniques, notamment le séquençage de l'ADN, la réaction en chaîne par polymérase, le polymorphisme de longueur des fragments de restriction (RFLP), la détection polymorphe amplifiée aléatoire, le polymorphisme de longueur des fragments amplifiés (AFLP), les puces à ADN, etc.
Le génotypage implique le séquençage de petits fragments particuliers de séquences d'ADN et la découverte de la parenté de la composition génétique avec d'autres individus à l'aide de marqueurs génétiques. Il détermine les polymorphismes mononucléotidiques (SNP) parmi les individus ou les allèles spécifiques. Le génotypage est applicable à un large éventail d'organismes, y compris les humains. Il s'applique également aux micro-organismes tels que les virus, les champignons, etc. et peut être utilisé pour déterminer leurs variants génétiques avec les profils de référence. En épidémiologie moléculaire et en microbiologie médico-légale, le contrôle des agents pathogènes, en particulier des micro-organismes, se fait par les informations obtenues à partir du génotypage. Le génotypage est très important dans l'analyse généalogique. Les humains sont génotypés pour confirmer la maternité et la paternité. Le génotype révélera les allèles dominants et récessifs des gènes qui décident des traits spécifiques.
Figure_1: Génotypage RFLP
Qu'est-ce que le séquençage ?
Le séquençage est le processus de détermination de l'ordre correct du nucléotide dans un fragment donné d'ADN ou d'ARN. Pratiquement toutes les informations nécessaires à la croissance et au développement d'un organisme sont codées dans son génome. La disponibilité de techniques pour produire et séparer des fragments d'acides nucléiques de quelques centaines de nucléotides a conduit au développement de procédures de détermination de la séquence nucléotidique exacte d'un fragment donné d'ADN ou d'ARN. Différents types de méthodes de séquençage sont disponibles aujourd'hui. Ces méthodes de séquençage, associées aux technologies de construction de bibliothèques de génomes représentant l'ensemble du génome d'un organisme, facilitent le séquençage de l'ensemble du génome de cet organisme, en effectuant une analyse approfondie des structures des gènes, des fonctions des gènes, des emplacements des gènes, des expressions des gènes, cartographie des gènes, régions régulatrices des gènes, etc.
Les génomes totaux de nombreux virus, plusieurs bactéries, archaebactéries, levures et plusieurs autres organismes ont été séquencés et cartographiés. Le projet du génome humain a permis de séquencer et de cartographier l'intégralité du génome humain et de publier sa première ébauche en 2003. Il s'agit d'une étape majeure dans l'avancement de la biologie. Les séquences du génome humain sont désormais utilisées dans le secteur médical pour identifier les causes génétiques des maladies rares, dépister le risque de maladie chez les nouveau-nés, identifier les détails génétiques de différents cancers, développer de nouvelles thérapies et développer de nouveaux outils de diagnostic, etc.
Dans le monde végétal, le génome du riz et les génomes d'Arabidopsis ont été séquencés. La connaissance de ces séquences révolutionnera sans aucun doute notre compréhension du fonctionnement des cellules et des organismes.
Figure_2: Une autoradiographie du séquençage de sanger
Quelle est la différence entre le génotypage et le séquençage ?
Génotypage vs séquençage |
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| Le génotypage est le processus de détermination de la composition génétique d'un individu et de vérification du groupe ou de la taxonomie de cet organisme. | Le séquençage est le processus de détermination de l'ordre précis des nucléotides d'un fragment d'ADN ou d'ARN donné. |
| Techniques | |
| RFLP, séquençage de gènes, PCR, puces à ADN, AFLP etc. | Séquençage Sanger, séquençage Gilbert, pyroséquençage, séquençage nouvelle génération, séquençage Shotgun, etc. |
| Préoccupations majeures | |
| Il s'agit plutôt de savoir si les différences génotypiques donnent les différences phénotypiques réelles. | Ceci est plus préoccupé par l'ordre des nucléotides et ses différences et changements avec d'autres organismes. |
Résumé – Génotypage vs Séquençage
Le génotypage et le séquençage sont utiles pour étudier l'information génétique des organismes. Le génotypage est le processus de détermination des variations de génotype parmi les individus et de recherche de leurs catégories. Le séquençage est le processus de détermination de l'ordre correct des nucléotides dans le fragment intéressé ou la région d'ADN. Les deux techniques fournissent des informations importantes sur les gènes et les génomes.
