La principale différence entre MLVA et MLST est que MLVA utilise le polymorphisme de séquences d'ADN répétées en tandem pour caractériser les espèces microbiennes, tandis que MLST utilise le polymorphisme de séquences d'ADN de fragments internes de plusieurs gènes domestiques pour caractériser les espèces microbiennes.
Le typage microbien est normalement utilisé pour déterminer la source et les voies d'infection. Il confirme ou exclut les épidémies. Le typage microbien retrace également la transmission croisée des agents pathogènes associés aux soins de santé et reconnaît les souches virulentes. De plus, le typage microbien évalue l'efficacité des mesures de contrôle des espèces microbiennes pathogènes. MLVA et MLST sont deux techniques de biologie moléculaire utilisées dans le typage microbien.
Qu'est-ce que la MLVA ?
L'analyse multiloci VNTR (MLVA) est une méthode de biologie moléculaire qui utilise le polymorphisme de séquences d'ADN répétées en tandem pour caractériser les espèces microbiennes. C'est une méthode utilisée pour l'analyse génétique d'espèces microbiennes particulières.
Au cours de la première étape de la MLVA, chaque locus VNTR ciblé est amplifié par PCR avec des amorces flanquantes spécifiques à la région. Puis les fragments obtenus sont séparés par taille par électrophorèse sur un séquenceur capillaire. Le génotypage de chaque locus et les résultats compilés à partir de chaque échantillon permettent de caractériser un microorganisme dont l'espèce est connue. Il permet également d'identifier les sous-espèces grâce au typage des allèles et à la comparaison avec les bases de données MLVA.
Figure 01: MLVA
Cette méthode MLVA est plus sélective que la méthode MLST. De plus, la méthode MLVA ne nécessite pas d'étape de séquençage de l'ADN. Ainsi, il permet de différencier des sous-espèces proches ou des espèces clonales.
Qu'est-ce que le MLST ?
Le typage de séquences multilocus (MLST) est une technique qui utilise le polymorphisme des séquences d'ADN de fragments internes de plusieurs gènes domestiques pour caractériser les espèces microbiennes. MLST est une technique d'analyse génétique pour le typage de plusieurs loci.
Figure 02: MLST
Il s'agit d'un type de typage par séquençage utilisé comme technique de référence pour distinguer différentes souches d'espèces microbiennes. Cette méthode est basée sur le séquençage des gènes domestiques. Les gènes domestiques codent normalement pour des protéines essentielles d'agents microbiens tels qu'une bactérie. Ces séquences de gènes domestiques ont la particularité de présenter un polymorphisme stable dans le temps. Par conséquent, les différences dans les séquences des gènes domestiques sont suffisantes pour distinguer les souches les unes des autres. En outre, le premier schéma MLST à être développé était Neisseria meningitidis, l'agent causal de la méningite et de la septicémie à méningocoque. Depuis son introduction, le MLST a été utilisé non seulement pour les agents pathogènes humains, mais également pour les agents pathogènes des plantes.
Quelles sont les similitudes entre MLVA et MLST ?
- MLVA et MLST sont deux techniques de biologie moléculaire utilisées dans le typage microbien.
- Les deux techniques peuvent être utilisées pour l'analyse phylogénétique microbienne.
- Les deux techniques sont basées sur le polymorphisme génétique.
- Ils peuvent être utilisés pour la détection de maladies humaines provoquant des pathogènes microbiens.
- Les deux techniques doivent être réalisées par des biologistes moléculaires qualifiés.
Quelle est la différence entre MLVA et MLST ?
MLVA est une technique qui utilise le polymorphisme de séquences d'ADN répétées en tandem pour caractériser les espèces microbiennes. Pendant ce temps, MLST est une technique qui utilise le polymorphisme des séquences d'ADN de fragments internes de plusieurs gènes domestiques pour caractériser les espèces microbiennes. C'est donc la principale différence entre MLVA et MLST. De plus, la méthode MLVA est plus sélective que la méthode MLST.
L'infographie ci-dessous présente les différences entre MLVA et MLST sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé – MLVA vs MLST
MLVA et MLST sont deux techniques de biologie moléculaire utilisées dans le typage microbien. MLVA utilise le polymorphisme de séquences d'ADN répétées en tandem pour caractériser les espèces microbiennes, tandis que MLST utilise le polymorphisme de séquences d'ADN de fragments internes de plusieurs gènes domestiques pour caractériser les espèces microbiennes. C'est donc la principale différence entre MLVA et MLST.
