La principale différence entre le crRNA tracrRNA et le gRNA est que le crRNA est l'un des deux types d'ARN de CRISPR, qui est complémentaire de la séquence d'ADN cible, tandis que le tracrRNA est le deuxième type d'ARN de CRISPR, qui sert de un échafaudage de liaison pour la nucléase Cas et l'ARNg est l'un des deux principaux composants du système CRISPR-Cas9 de bactéries et d'archées qui reconnaît l'ADN cible et guide les protéines Cas pour faire des cassures double brin dans l'ADN cible.
CRISPR signifie répétitions palindromiques courtes entrecoupées régulières en cluster. C'est l'un des systèmes immunitaires des bactéries et des archées. Les bactéries et les archées utilisent ce système pour se protéger des agents pathogènes viraux. C'est l'un des mécanismes les plus étonnants qui implique une modification génétique réussie. Ce mécanisme (CRISPR-Cas9) est utilisé comme nouvel outil d'édition de gènes en biotechnologie. Il a apporté de nouvelles avancées à la biotechnologie, en particulier dans le domaine du génie génétique.
Il y a deux composants principaux du système CRISPR-Cas9. Ce sont des ARN guides (ARNg) et des nucléases associées à CRISPR (Cas). L'ARN guide est une séquence d'ARN spécifique qui guide les protéines Cas pour cliver l'ADN cible. L'ARN guide se compose de deux types d'ARN. Ce sont l'ARN crispr (ARNcr) et l'ARNtracr. Les nucléases associées à CRISPR (Cas) sont des endonucléases non spécifiques qui créent des cassures double brin dans l'ADN cible. En créant des cassures double brin dans l'ADN cible, les bactéries et les archées dirigent leurs mécanismes de réparation endogènes pour inactiver l'ADN viral.
Qu'est-ce que l'ARNc ?
crRNA ou Crispr RNA est l'un des deux types d'ARN guide. Structurellement, c'est une séquence de 17-20 nucléotides. La caractéristique la plus précieuse de l'ARNc est qu'il est complémentaire de l'ADN cible. Par conséquent, le crRNA correspond à la séquence d'ADN viral. La spécificité du système CRISPR-Cas 9 dépend de l'ARNc. Chez les bactéries, le crRNA existe fusionné à la séquence tracrRNA, qui est le deuxième type d'ARN CRISPR. La production de crARN est déclenchée par la réexposition des bactéries à un virus. Lorsqu'il est exposé, la transcription du gène qui code pour l'ARNc a lieu. Ensuite, le mécanisme de défense commence contre le virus.
Figure 01: Système CRISPR-Cas9
Qu'est-ce que le tracrARN ?
Trans-activating crRNA ou tracrRNA est la deuxième partie de guideRNA ou CRISPR RNA. Il se prononce comme ARN traceur. le tracrARN sert d'échafaudage de liaison pour la protéine endonucléase Cas 9. En d'autres termes, le tracrRNA fonctionne comme la poignée pour guider Cas9 vers l'ADN cible. Structurellement, le tracrRNA a 42 nucléotides. Il existe combiné avec crRNA.
Qu'est-ce que l'ARNg ?
Guide RNA ou gRNA est l'un des deux principaux composants du système immunitaire CRISPR-Cas9. Il s'agit d'une séquence d'ARN spécifique composée de deux éléments: le crRNA et le tracrRNA. L'ARNg reconnaît l'ADN cible et dirige les protéines Cas pour faire des cassures double brin dans l'ADN cible. Pour ce faire, le crRNA consiste en une séquence complémentaire d'ADN cible tandis que le tracrRNA guide les protéines Cas fonctionnant comme une poignée.
Figure 02: ARNg
La conception de l'ARNg correct est une étape critique de l'outil d'édition de gènes CRISPR-Cas9. Par conséquent, le succès et l'efficacité de l'édition du système CRISPR dépendent de la séquence correcte d'ARNg. L'ARNg peut être exprimé dans des cellules à partir d'un plasmide transfecté. Lorsque des plasmides clonés sont introduits dans des cellules, les cellules hôtes génèrent de l'ARNg. L'ARNg le plus couramment généré comprend 100 paires de bases.
Quelles sont les similitudes entre le crRNA tracrRNA et le gRNA ?
- crRNA, tracrRNA et gRNA sont des séquences d'ARN trouvées dans les bactéries et les archées.
- Ils appartiennent tous au système CRISPR.
- gRNA est fabriqué à partir de crRNA et de tracrRNA.
- Ils sont impliqués dans la reconnaissance de l'ADN du bactériophage et dans le guidage des endonucléases vers l'ADN cible.
- Par conséquent, les trois types d'ARN sont impliqués dans la direction de la nucléase Cas9 pour faire des cassures double brin dans le matériel génétique étranger envahissant.
- Le succès de l'expérience CRISPR dépend des trois types d'ARN.
Quelle est la différence entre le crARN, le tracrRNA et le gRNA ?
crRNA est une partie de l'ARNg de CRISPR qui est complémentaire de l'ADN cible, tandis que le tracrRNA est la deuxième partie de l'ARNg, qui sert d'échafaudage de liaison pour la nucléase Cas. L'ARNg est la combinaison d'ARNcr et de tracrARN, et c'est l'un des deux composants du système CRISPR-Cas9, qui reconnaît l'ADN cible et guide les nucléases pour faire des cassures double brin dans l'ADN cible. C'est donc la principale différence entre le crRNA tracrRNA et le gRNA.
Le tableau suivant résume la différence entre le crRNA tracrRNA et le gRNA.
Résumé - crRNA vs tracrRNA vs gRNA
Le système CRISPR-Cas9 est un système immunitaire de bactéries et d'archées. Ce système est utilisé comme outil d'édition de gènes en biotechnologie. CRISPR se compose de deux types d'ARN, à savoir l'ARN CRISPR (ARNcr) et l'ARN CRISPR transactivant (ARNrtrac). Ils sont collectivement connus sous le nom d'ARN guide ou d'ARNg. Cet ARN reconnaît les séquences cibles des agents pathogènes envahisseurs et guide les endonucléases pour créer des cassures double brin dans l'ADN cible. Une fois que des cassures double brin sont faites dans le matériel génétique étranger, le mécanisme de réparation endogène (jointure d'extrémité non homologue; NHEJ) inactive l'ADN étranger en introduisant des mutations. Ainsi, cela résume la différence entre le crRNA tracrRNA et le gRNA.
