La principale différence entre les isoschizomères et les néoschizomères est que les isoschizomères sont des enzymes de restriction qui ont la même séquence de reconnaissance et clivent l'ADN aux mêmes positions, tandis que les néoschizomères sont des enzymes de restriction qui ont la même séquence de reconnaissance mais clivent l'ADN à des positions différentes.
Les enzymes de restriction ou les endonucléases de restriction sont des enzymes qui clivent l'ADN en fragments au niveau ou à proximité de sites de reconnaissance spécifiques. Ils coupent l'ADN aux sites de restriction. Les enzymes de restriction sont généralement classées en cinq groupes en fonction de leur structure, si elles coupent leur substrat d'ADN au niveau de leur site de reconnaissance et si les sites de reconnaissance et de clivage sont séparés les uns des autres. Plus de 3600 endonucléases de restriction ont déjà été identifiées. Environ 800 enzymes de restriction sont disponibles dans le commerce. Les isoschizomères et les néoschizomères sont deux types d'enzymes de restriction basés sur le site de reconnaissance et la spécificité de clivage.
Que sont les isoschizomères ?
Les isoschizomères sont des enzymes de restriction qui ont la même séquence de reconnaissance et clivent l'ADN aux mêmes positions. Ces enzymes de restriction ont la même spécificité. La première enzyme de restriction découverte qui reconnaît une séquence donnée est connue sous le nom de prototype, tandis que toutes les enzymes de restriction identifiées ultérieurement qui reconnaissent cette même séquence sont appelées isoschizomères. Cependant, les isoschizomères peuvent différer dans les préférences de site, les conditions de réaction, la sensibilité à la méthylation et l'activité en étoile. Les isoschizomères sont isolés de différentes souches de bactéries. Par conséquent, ils peuvent nécessiter des conditions de réaction différentes. Dans certains cas, seul un isoschizomère sur une paire peut reconnaître à la fois les formes méthylées et non méthylées des sites de restriction. En revanche, l'autre enzyme de restriction ne peut reconnaître que la forme non méthylée du site de restriction. Cette particularité des isoschizomères permet d'identifier l'état de méthylation du site de restriction tout en l'isolant d'un état bactérien.
Par exemple, AgeI et BshT1 reconnaissent et clivent 5'-A↓CCGGT dans le même schéma. HpaII et MSPI sont d'autres paires d'isoschizomères. Ils reconnaissent tous les deux la séquence 5'-C↓CGG-3' lorsqu'elle est non méthylée. Mais lorsque le deuxième C de la séquence est méthylé, seul MSPI peut reconnaître cette séquence tandis que HpaII ne peut pas la reconnaître.
Que sont les néoschizomères ?
Les néoschizomères sont des enzymes de restriction qui ont la même séquence de reconnaissance mais clivent l'ADN à différentes positions. Dans certaines applications spéciales de biologie moléculaire, il s'agit d'une caractéristique très utile. Les néoschizomères sont un sous-ensemble des isoschizomères. Des exemples bien connus de néoschizomères sont SmaI (5'-CCC↓GGG-3') et XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); les deux reconnaissent la séquence 5'-CCCGGG-3' mais les clivent à une position différente. Ainsi, ces deux enzymes de restriction génèrent des types d'extrémités différents. Dans ce cas, SmaI produit des extrémités franches et XmaI produit des extrémités saillantes en 5'.
Figure 01: Néoschizomères
Un autre exemple est la paire d'enzymes de restriction MaeII et Tail. Le prototype MaeII (A↓CGT) produit des fragments d'ADN avec une extension de 2 bases en 5', et le néoschizomère Tail (ACGT↓) produit des fragments d'ADN avec une extension de 4 bases en 3'.
Quelles sont les similitudes entre les isoschizomères et les néoschizomères ?
- Les isoschizomères et les néoschizomères sont deux types d'enzymes de restriction.
- On les trouve principalement chez les procaryotes.
- Ils font partie du système de restriction-modification (RM) trouvé dans les bactéries et les archées.
- Les deux sont des molécules de protéines.
- Les deux clivent l'ADN en fragments.
Quelle est la différence entre les isoschizomères et les néoschizomères ?
Les isoschizomères sont des enzymes de restriction qui ont la même séquence de reconnaissance et clivent l'ADN aux mêmes positions, tandis que les néoschizomères sont des enzymes de restriction qui ont la même séquence de reconnaissance mais clivent l'ADN à des positions différentes. C'est donc la principale différence entre les isoschizomères et les néoschizomères. De plus, les isoschizomères ont les mêmes spécificités alors que les néoschizomères ont des spécificités différentes.
L'infographie suivante répertorie les différences entre les isoschizomères et les néoschizomères sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé – Isoschizomères vs Néoschizomères
Les enzymes de restriction sont des enzymes coupant l'ADN. Ils sont aussi appelés ciseaux moléculaires. Il existe différents types d'enzymes de restriction. Sur la base du site de reconnaissance et de la spécificité de clivage, les enzymes de restriction sont de deux types, les isoschizomères et les néoschizomères. Les isoschizomères ont la même séquence de reconnaissance et clivent l'ADN aux mêmes positions tandis que les néoschizomères ont la même séquence de reconnaissance mais clivent l'ADN à des positions différentes. C'est donc la principale différence entre les isoschizomères et les néoschizomères.
