La principale différence entre ITS1 et ITS2 est que ITS1 est un ADN espaceur situé entre les gènes ARNr 18S et 5,8S chez les eucaryotes, tandis que ITS2 est un ADN espaceur situé entre les gènes ARNr 5,8S et 28S chez les eucaryotes.
L'espaceur transcrit interne (ITS) est l'espaceur d'ADN généralement situé entre l'ARN ribosomique de la petite sous-unité et les gènes de l'ARN ribosomal de la grande sous-unité dans le chromosome ou dans la région transcrite correspondante dans la molécule de transcription précurseur d'ARNr polycistronique. Chez les bactéries et les archées, il n'y a qu'un seul ITS entre les gènes d'ARNr 16S et 23S. Mais chez les eucaryotes, il existe deux ADN espaceurs ITS: ITS1 (entre 18S et 5.gènes ARNr 8S) et ITS2 (entre ARNr 5,8S et 28S). Par conséquent, ITS1 et ITS2 sont deux ADN espaceurs trouvés entre les gènes d'ARNr chez les eucaryotes.
Qu'est-ce que ITS1 ?
ITS1 est un ADN espaceur situé entre les gènes ARNr 18S et 5,8S chez les eucaryotes. ITS fait référence à un morceau d'ADN espaceur non fonctionnel situé entre les gènes d'ARNr. ITS1 a une plus grande variation de longueur que ITS2. La variation de longueur de ITS1 est d'environ (200-300bp). Les marqueurs ITS tels que ITS1 ont prouvé leur efficacité pour élucider les relations phylogénétiques entre différents taxons. De plus, l'ADN espaceur ITS1 est moins conservé que l'ADN espaceur ITS2. Les structures ITS1 ne sont conservées que dans des unités taxonomiques beaucoup plus petites. Chaque amas ribosomique eucaryote contient également des régions appelées espaceurs externes transcrits (5' et 3' ETS).
Figure 01: Région ITS1
L'ADN de l'espaceur ITS1 est très proche de l'espaceur transcrit externe 5' (5' ETS). De plus, si quelqu'un veut amplifier la région ITS1 pour des études de relations phylogénétiques, il doit utiliser une paire d'amorces spécifique (amorces inverses et directes) à cette fin. Pour amplifier la région ITS1, deux jeux d'amorces sont normalement utilisés dans les protocoles PCR des laboratoires. Ce sont ITS1 avant et ITS2 arrière ou ITS1 avant et ITS4 arrière.
Qu'est-ce que ITS2 ?
ITS2 est un ADN espaceur situé entre les gènes ARNr 5.8S et 28S chez les eucaryotes. La région ITS2 a une variation de longueur plus courte que la région ITS1. La variation de longueur de ITS2 est d'environ (180-240bp). Cependant, la région ITS2 est plus conservée que la région ITS1 dans de nombreuses unités taxonomiques. Il identifie que toutes les séquences ITS2 partagent un noyau commun de la structure secondaire. De plus, 40% de la région ITS2 est conservée parmi tous les angiospermes, alors qu'il est possible d'aligner 50% de la région ITS2 à travers la famille et le niveau supérieur.
Figure 02: Région ITS2
Indépendamment de la portée de la conservation, l'utilisation de la région ITS2 est également très populaire, comme la région ITS1, dans les études de relations phylogénétiques, en particulier dans les codes-barres d'ADN fongique. Pour amplifier la région ITS2, un jeu d'amorces spécifique est généralement utilisé dans les protocoles PCR des laboratoires. C'est ITS1 vers l'avant et ITS4 vers l'arrière. Mais lorsque le protocole PCR utilise cet ensemble d'amorces, il amplifie également la région ITS1 avec la région ITS2. De plus, l'ADN de l'espaceur ITS2 est très proche de l'espaceur transcrit externe 3' (3' ETS).
Similitudes entre ITS1 et ITS2
- ITS1 et ITS2 sont deux ADN espaceurs situés entre les gènes d'ARNr.
- Ils ne sont présents que chez les eucaryotes.
- Les deux peuvent être amplifiés en utilisant des paires d'amorces spécifiques.
- Ils sont tous deux excisés lors de la maturation de l'ARNr en tant que sous-produits non fonctionnels.
- Les deux sont très importants pour les études de relations phylogénétiques, en particulier dans le codage à barres de l'ADN fongique.
Différence entre ITS1 et ITS2
ITS1 est un ADN espaceur présent entre les gènes ARNr 18S et 5,8S chez les eucaryotes, tandis que ITS2 est un ADN espaceur situé entre les gènes ARNr 5,8S et 28S chez les eucaryotes. C'est donc la principale différence entre ITS1 et ITS2. De plus, ITS1 a une plus grande variation de longueur par rapport à ITS2. D'autre part, ITS2 a une variation de longueur plus courte par rapport à ITS1. C'est une autre différence entre ITS1 et ITS2.
L'infographie ci-dessous répertorie les différences entre ITS1 et ITS2 sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - ITS1 vs ITS2
La région transcrite interne (ITS) est un morceau d'ADN espaceur non fonctionnel situé entre les gènes d'ARNr. Chez les bactéries et les archées, il n'y a qu'une seule région ITS. Mais chez les eucaryotes, il existe deux régions ITS: ITS1 et ITS2. ITS1 est un ADN espaceur situé entre les gènes ARNr 18S et 5,8S chez les eucaryotes, tandis que ITS2 est un ADN espaceur situé entre les gènes ARNr 5,8S et 28S chez les eucaryotes. Voici donc le résumé de la différence entre ITS1 et ITS2.
