La principale différence entre la dénaturation et la dégradation des protéines est que, dans la dénaturation des protéines, les structures quaternaires, tertiaires et secondaires sont perturbées, mais la structure primaire reste intacte tandis que, dans la dégradation des protéines, la structure primaire de la protéine est détruit, mais la structure secondaire et tertiaire reste intacte.
La dénaturation et la dégradation des protéines sont des étapes clés du traitement des protéines dans la cellule. Ce sont des processus cellulaires extrêmement importants. Lors de la dénaturation d'une protéine, la protéine perd son activité biologique car la fonction biologique dépend directement de sa structure. Cependant, les protéines dégradées peuvent toujours avoir une structure secondaire ou tertiaire.
Qu'est-ce que la dénaturation des protéines ?
La dénaturation est le processus par lequel la protéine perd sa structure quaternaire, sa structure tertiaire et sa structure secondaire présentes à l'état natif. Mais la structure primaire des protéines reste intacte. Elle peut être obtenue par l'application de contraintes externes, de composés tels qu'un acide ou une base forte, un sel inorganique concentré, un solvant organique (alcool, chloroforme) et un rayonnement ou de la chaleur. Si les protéines de la cellule sont dénaturées, cela entraîne une perturbation de l'activité cellulaire, voire la mort cellulaire. Lors de la dénaturation des protéines, la protéine perd sa fonction biologique. Les protéines dénaturées peuvent avoir un large éventail de caractéristiques telles que des changements de conformation, une perte de solubilité et une agrégation due à l'exposition à des groupes hydrophobes. Les protéines dénaturées perdent leur structure 3D; par conséquent, ils ne peuvent pas fonctionner, comme mentionné précédemment.
Figure 01: Dénaturation des protéines
Le repliement correct des protéines aide les protéines globulaires ou membranaires à faire leur travail correctement. Ils doivent être pliés dans une bonne forme pour obtenir la fonction correcte. Cependant, les liaisons H qui jouent un rôle central dans le repliement sont plutôt faibles et sont donc facilement affectées par la chaleur, l'acidité, la variation de la concentration en sel et d'autres stress qui peuvent dénaturer la protéine. C'est pourquoi l'homéostasie est extrêmement importante dans de nombreuses formes de vie. Des exemples courants peuvent être observés dans la cuisson d'une variété d'aliments, tels que les œufs durs qui deviennent durs et la viande cuite qui devient ferme.
Qu'est-ce que la dégradation des protéines ?
La dégradation des protéines peut avoir lieu de manière intracellulaire ou extracellulaire. Dans la dégradation des protéines, la structure primaire de la protéine est détruite, mais la structure secondaire et tertiaire reste intacte. Dans la digestion des aliments, l'enzyme digestive est libérée dans l'environnement pour la digestion extracellulaire. Le clivage protéolytique décompose les protéines en peptides et acides aminés plus petits afin qu'ils puissent être facilement absorbés. Chez les animaux, les aliments peuvent être transformés de manière extracellulaire dans des organes ou des intestins spécialisés. Mais chez de nombreuses bactéries, les aliments peuvent être transformés par internalisation par phagocytose.
Figure 02: Dégradation des protéines
La dégradation des protéines microbiennes dans l'environnement peut être régulée par la disponibilité des nutriments. La dégradation intracellulaire des protéines peut être obtenue de deux manières: la protéolyse dans les lysosomes ou un processus dépendant de l'ubiquitine qui cible les protéines indésirables vers les protéosomes. Cependant, dans la dégradation des protéines, la protéine peut toujours avoir sa fonction biologique dans certains cas.
Quelles sont les similitudes entre la dénaturation et la dégradation des protéines ?
- Les deux termes sont associés à des protéines.
- Les liaisons dans les protéines sont rompues dans les deux processus.
- Ils sont tous les deux extrêmement importants pour le fonctionnement cellulaire.
- La structure des protéines natives change dans les deux processus.
Quelle est la différence entre la dénaturation et la dégradation des protéines ?
La dénaturation est le déploiement de la structure protéique. Cela signifie; la perte de sa structure secondaire, tertiaire ou quaternaire due à l'exposition à un facteur physique ou chimique. Mais la structure primaire reste intacte car les liaisons covalentes entre les acides aminés sont beaucoup plus fortes. Cependant, lors de la dégradation des protéines, la structure primaire est détruite. Cela signifie; les liaisons covalentes entre les différents acides aminés sont rompues. C'est donc la principale différence entre la dénaturation et la dégradation des protéines. De plus, lors de la dénaturation d'une protéine, la protéine perd son activité biologique car la fonction dépend directement de sa structure alors que les protéines dégradées peuvent encore avoir une structure secondaire ou tertiaire, elles peuvent donc encore avoir leur fonction biologique dans certains cas.
Vous trouverez ci-dessous un résumé de la différence entre la dénaturation et la dégradation des protéines sous forme de tableau.
Résumé - Dénaturation vs Dégradation des Protéines
La dénaturation des protéines implique la destruction des structures secondaires et tertiaires. Mais la structure primaire reste intacte. Cependant, lors de la dégradation des protéines, la structure primaire est détruite. Lors de la dénaturation de la protéine, la protéine perd son activité biologique. En revanche, dans la dégradation, les protéines ont encore leur fonction biologique dans certains cas. Ainsi, cela résume la différence entre la dénaturation et la dégradation des protéines.
