La principale différence entre le xylène cyanol et le bleu de bromophénol est que, dans le gel d'agarose à 1 %, le xylène cyanol migre plus lentement, tandis que le bleu de bromophénol migre plus rapidement.
Le xylène cyanol et le bleu de bromophénol sont importants en tant que marqueurs de couleur qui peuvent être utilisés pour surveiller le processus d'électrophorèse sur gel d'agarose et d'électrophorèse sur gel de polyacrylamide.
Qu'est-ce que le xylène cyanol ?
Xylène cyanol est un marqueur de couleur électrophorétique ou un colorant de suivi. Il est utile pour surveiller le processus d'électrophorèse sur gel d'agarose et d'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. Lorsque cette substance est mélangée à l'échantillon, la concentration de cette substance devient typiquement d'environ 0.005% à 0,03%. Certains synonymes que nous pouvons utiliser pour le xylène cyanol incluent Acid Blue 147, xylène cyanole, xylène cyanol FF, xylène cyanole FF, etc.
La formule chimique de ce composé est C25H27N2NaO 6S2 La masse molaire du xylène cyanol est de 538,61 g/mol. Cette substance peut migrer à une vitesse d'environ 4 à 5 fragments d'ADN de paires de kilobases dans des gels d'agarose à 1 %. Cependant, cela dépend du tampon que nous utilisons. Typiquement, le xylène cyanol sur un gel de polyacrylamide à 6 % peut migrer à une vitesse d'environ 140 fragments d'ADN de paires de bases. En revanche, il peut migrer en électrophorèse sur gel de polyacrylamide dénaturant à 20% à raison d'oligonucléotide de 25 bases.
Le nombre de donneurs de liaisons hydrogène du xylène cyanol est de 2 m et le nombre d'accepteurs de liaisons hydrogène est de 8. Le nombre de liaisons rotatives de ce composé peut être donné à 7. La complexité du xylène cyanol peut être décrite comme 1120 degrés. Il a un nombre défini de stéréocentres de liaison de 1.
Qu'est-ce que le bleu de bromophénol ?
Le bleu de bromophénol est un indicateur de pH utile qui sert de marqueur de couleur électrophorétique et de colorant. Il a le nom chimique 3', 3", 5', 5"-tétrabromophénolsulfonphtaléine, BPB. La formule chimique de ce composé est C19H10Br4O5 S. La masse molaire de ce composé est de 669,96 g/mol. Il est inodore et sa densité peut être donnée à 2,2 g/mL. Son point de fusion est de 273 degrés Celsius et son point d'ébullition est de 279 degrés Celsius. Nous pouvons le préparer en ajoutant lentement un excès de brome à une solution chaude de phénolsulfonphtaléine dans de l'acide acétique glacial.
Le bleu de bromophénol est utile comme indicateur acido-basique dans la plage de pH comprise entre 3,0 et 4,6. Il est capable de passer du jaune à pH 3,0 à pH 4,6. De plus, c'est une réaction réversible. Structurellement, le bleu de bromophénol est similaire à la phénolphtaléine.
De plus, nous pouvons l'utiliser comme marqueur de couleur pour surveiller le processus d'électrophorèse sur gel d'agarose et d'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. Cette substance peut porter une charge négative à pH modéré, où elle peut migrer dans la même direction que l'ADN ou la protéine dans un gel. Le taux de migration peut varier en fonction de la densité du gel et de la composition du tampon. Cependant, dans un gel d'agarose typique à 1 % dans un tampon TAE ou TBE 1 fois, cette substance migre au même rythme qu'un fragment d'ADN d'environ 300 paires de bases.
Quelle est la différence entre le xylène cyanol et le bleu de bromophénol ?
Le xylène cyanol et le bleu de bromophénol sont des marqueurs de couleur importants. La principale différence entre le xylène cyanol et le bleu de bromophénol est que dans le gel d'agarose à 1 %, le xylène cyanol migre plus lentement, tandis que le bleu de bromophénol migre plus rapidement.
Vous trouverez ci-dessous un résumé de la différence entre le xylène cyanol et le bleu de bromophénol sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Xylène Cyanol vs Bromophénol Bleu
Le xylène cyanol et le bleu de bromophénol sont importants en tant que marqueurs de couleur utilisés pour surveiller le processus d'électrophorèse sur gel d'agarose et d'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. La principale différence entre le xylène cyanol et le bleu de bromophénol est que, dans le gel d'agarose à 1 %, le xylène cyanol migre plus lentement, tandis que le bleu de bromophénol migre plus rapidement.
