La principale différence entre les rétrotransposons LTR et non LTR est que les rétrotransposons LTR sont un type de rétrotransposons qui ont de longues répétitions terminales dans leur structure, tandis que les rétrotransposons non LTR sont un type de rétrotransposons qui n'ont pas de longues répétitions terminales dans leur structure.
Les rétrotransposons (éléments transposables de classe I ou transposons via des intermédiaires d'ARN) sont un type de composant génétique qui peut se copier et se coller dans différents emplacements génomiques. Pour ce faire, ils reconvertissent l'ARN en ADN par un processus appelé transcription inverse à l'aide d'un intermédiaire de transposition d'ARN. Il existe deux principaux types de rétrotransposons, les rétrotransposons LTR et non LTR
Que sont les rétrotransposons LTR ?
LTR Les rétrotransposons sont un type de rétrotransposons qui ont de longues répétitions terminales dans leur structure. De longs brins d'ADN répétitif peuvent être trouvés à chaque extrémité d'un rétrotransposon LTR. Celles-ci sont appelées longues répétitions terminales (LTR). Chaque LTR est long de quelques centaines de paires de bases. Les rétrotransposons LTR mesurent généralement plus de 5 kilobases. De plus, entre les longues répétitions terminales, il existe des gènes qui peuvent être transcrits équivalents aux gènes de rétrovirus gag et pol. Ces gènes se chevauchent de sorte qu'ils codent pour une protéase qui transforme normalement le transcrit résultant en produits géniques fonctionnels.
Figure 01: Rétrotransposons LTR
Le gène gag des rétrotransposons forme un produit qui s'associe à d'autres transcrits de rétrotransposons pour former des particules de type viral. Le gène Pol fabrique des produits qui incluent des enzymes telles que les domaines de la transcriptase inverse, de l'intégrase et de la ribonucléase H. L'enzyme transcriptase inverse effectue la transcription inverse de l'ADN rétrotransposon. L'enzyme intégrase intègre l'ADN du rétrotransposon dans l'ADN du génome eucaryote. Les domaines de la ribonucléase H sont utiles pour cliver les liaisons phosphodiester entre les intermédiaires d'ARN. Les rétrotransposons LTR codent également des transcrits avec des sites de liaison à l'ARNt afin qu'ils puissent subir une transcription inverse assez facilement. De plus, comme le rétrotransposon contient des informations sur le génome eucaryote, il peut insérer des copies de lui-même dans d'autres emplacements génomiques au sein d'une cellule eucaryote.
Que sont les rétrotransposons non LTR ?
Les rétrotransposons non-LTR sont un type de rétrotransposons qui n'ont pas de longues répétitions terminales dans leur structure. Comme les rétrotransposons LTR, les rétrotransposons non LTR contiennent également des gènes pour la transcriptase inverse, la protéine de liaison à l'ARN, la nucléase et parfois les domaines H de la ribonucléase. Mais il leur manque les longues répétitions terminales; au lieu de cela, ils ont de courtes répétitions qui peuvent avoir un ordre inversé de bases les unes à côté des autres. Les protéines de liaison à l'ARN se lient à l'intermédiaire de transposition de l'ARN et les nucléases rompent les liaisons phosphodiester entre les nucléotides dans les acides nucléiques.
Figure 02: Rétrotransposons LTR et non-LTR
Bien qu'il s'agisse de rétrotransposons, ils ne peuvent pas effectuer de transcription inverse en utilisant un ARN intermédiaire de la même manière que les rétrotransposons LTR. En effet, les rétrotransposons non LTR ne contiennent pas de séquences qui se lient à l'ARNt. Par conséquent, un rétrotransposon non LTR transcrit en ARNm et traduit en protéines agit comme une transcriptase inverse. La transcriptase inverse crée une copie ADN de l'ARN du rétrotransposon non LTR qui peut être intégré dans le génome sur un nouveau site. De plus, les rétrotransposons non-LTR se divisent en deux types: les LINE (éléments nucléaires intercalés longs) et les SINE (éléments nucléaires intercalés courts).
Quelles sont les similitudes entre les rétrotransposons LTR et non-LTR ?
- Les rétrotransposons LTR et non-LTR sont les deux principaux types de rétrotransposons.
- Les deux types contiennent des gènes pour des enzymes telles que la transcriptase inverse, la protéine de liaison à l'ARN, la nucléase et les domaines H de la ribonucléase.
- On les trouve dans le génome humain.
- Les deux types sont importants pour l'évolution.
Quelle est la différence entre les rétrotransposons LTR et non LTR ?
Les rétrotransposons LTR ont de longues répétitions terminales dans leur structure, tandis que les rétrotransposons non-LTR manquent de longues répétitions terminales dans leur structure. C'est donc la principale différence entre les rétrotransposons LTR et non LTR. De plus, les rétrotransposons LTR ont de longues répétitions directes qui ne sont qu'une séquence de bases se répétant. D'autre part, les rétrotransposons non-LTR ont de courtes répétitions qui peuvent avoir un ordre inversé de bases les unes à côté des autres.
L'infographie ci-dessous présente les différences entre les rétrotransposons LTR et non-LTR sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Rétrotransposons LTR vs Non-LTR
Les rétrotransposons LTR et non-LTR sont les deux principaux types de rétrotransposons. Les rétrotransposons LTR ont de longues répétitions terminales dans leur structure, tandis que les rétrotransposons non LTR n'ont pas de longues répétitions terminales dans leur structure. C'est donc la principale différence entre les rétrotransposons LTR et non LTR.
