La principale différence entre la synténie et la colinéarité est que la synténie est la co-localisation physique de loci génétiques sur le même chromosome chez une espèce, tandis que la colinéarité est la co-localisation physique de loci génétiques sur le même chromosome chez différentes espèces en conservant la même commande.
Synténie et colinéarité sont deux termes utilisés de manière interchangeable en génomique. Les deux termes décrivent les schémas de localisation des gènes sur les chromosomes de différentes espèces. Ces arrangements de gènes apparentés entre les taxons sont des informations précieuses pour déduire l'ascendance partagée des gènes. La synténie fait référence à la co-localisation physique de locus génétiques sur le même chromosome chez une espèce. La colinéarité fait référence à la co-localisation physique de locus génétiques sur le même chromosome chez différentes espèces conservant le même ordre. C'est donc une forme de synténie.
Qu'est-ce que Syntény ?
Dans différentes espèces, il existe un ensemble de gènes situés sur le même chromosome. Et cette co-localisation physique de gènes sur le même chromosome chez différentes espèces est connue sous le nom de synténie. De plus, ces gènes se trouvent très proches les uns des autres sur un seul chromosome. L'ordre des gènes n'est pas nécessairement le même. Or, la localisation de gènes proches les uns des autres sur un même chromosome se fait en synténie. Par conséquent, la synténie décrit principalement le schéma de distribution des gènes sur un chromosome. Ces schémas de co-localisation des gènes indiquent des relations entre différentes espèces et leur évolution. Cependant, la synténie peut être perturbée en raison de réarrangements chromosomiques tels que translocations, inversion et fusion chromosomique, etc., duplications, perte et recombinaison homologue inégale.
Figure 01: Synténie
On pense que tous les gènes liés sont synténiques. Cependant, tous les gènes synténiques ne sont pas nécessairement liés. Ils possèdent des séquences chromosomiques communes. Les humains ont de nombreux gènes synténiques avec d'autres mammifères. De plus, de nombreuses céréales possèdent des gènes synténiques.
Qu'est-ce que la colinéarité ?
La colinéarité est une forme plus spécifique de synténie dans laquelle un ensemble de gènes sont situés sur le même chromosome d'espèces différentes dans le même ordre que dans l'espèce ancestrale. Par conséquent, s'il y a un écart par rapport à la colinéarité, ce sera un caractère phylogénétique plus fiable puisque la colinéarité explique l'ascendance commune des gènes.
Figure 02: Colinéarité
L'analyse de colinéarité multivoie fournit des informations beaucoup plus fiables sur les espèces apparentées et leur phylogénie.
Quelles sont les similitudes entre la synténie et la colinéarité ?
- A la fois en synténie et en colinéarité, un ensemble de locus de deux espèces différentes est situé sur le même chromosome.
- Ces termes décrivent la co-localisation physique des locus génétiques sur le même chromosome.
- La colinéarité est une forme plus spécifique de synténie.
- Parfois, les deux termes sont utilisés de manière interchangeable en génomique.
- Si deux régions ont une colinéarité, elles sont évidemment synténiques.
- Ils sont utiles pour déduire la phylogénie.
Quelle est la différence entre la synténie et la colinéarité ?
Synténie et colinéarité sont deux termes utilisés de manière interchangeable en génomique. La synténie fait référence à la co-localisation physique d'un ensemble de gènes dans le même chromosome chez différentes espèces. La colinéarité est une forme de synténie dans laquelle l'ensemble des gènes est co-localisé dans le même ordre parmi les différentes espèces. C'est donc la principale différence entre la synténie et la colinéarité.
Résumé - Synténie vs Colinéarité
Les termes synténie et colinéarité font référence à un ensemble de gènes situés sur le même chromosome chez différentes espèces. En fait, ces gènes sont co-localisés dans le même chromosome chez différentes espèces. La synténie décrit la co-localisation physique de gènes définis sur le même chromosome chez différentes espèces, tandis que la colinéarité est une forme plus spécifique de synténie dans laquelle l'ensemble de gènes est co-localisé dans le même ordre. Ainsi, cela résume la différence entre synténie et colinéarité.
