La principale différence entre la coloration au Coomassie et à l'argent est que la coloration au Coomassie est une technique de coloration des protéines qui utilise une coloration bleue brillante au Coomassie, tandis que la coloration au ruban est une technique de coloration des protéines qui utilise une coloration à l'argent.
La séparation et l'identification des protéines sont des étapes essentielles de l'analyse du protéome. Ils ont besoin d'une caractérisation des protéines à haute résolution après électrophorèse sur gel. Il existe de nombreuses techniques de coloration qui incluent différentes colorations telles que les colorants anioniques (bleu brillant de coomassie), les cations métalliques (imidazole-zinc), la coloration à l'argent et les colorants fluorescents, etc. Parfois, des sondes radioactives peuvent également être utilisées. Le choix de la technique de coloration dépend de la simplicité, de la disponibilité du matériel d'imagerie au laboratoire, etc.
Qu'est-ce que la coloration de Coomassie ?
La coloration au Coomassie est une technique de coloration des protéines qui utilise une coloration bleue brillante au Coomassie. On l'appelle généralement la technique du bleu de coomassie. Le bleu brillant de Coomassie est le colorant protéique anionique le plus populaire. Cette tache colore normalement presque toutes les protéines avec une bonne linéarité quantitative à une sensibilité moyenne. La coloration au bleu brillant de Coomassie se lie de manière non spécifique à presque toutes les protéines. Il existe deux variantes différentes de teinture bleu brillant coomassie: R-250 et G-250. Le R-250 offre des temps de coloration plus courts, tandis que le G-250 est disponible dans des formulations plus sensibles et respectueuses de l'environnement.
Figure 01: Coloration Coomassie
Les colorants de Coomassie sont très populaires dans les études de spectrométrie de masse et les études d'identification des protéines. De plus, la teinture de coomassie biosécuritaire est une formulation non dangereuse de bleu de coomassie G-250 actuellement disponible sur le marché. L'avantage de cette formulation est qu'elle ne nécessite que de l'eau pour le rinçage et la décoloration. La coloration au coomassie biosécuritaire offre une sensibilité équivalente au bleu de coomassie conventionnel G-250 mais meilleure que la coloration au coomassie R-250. De plus, il a un protocole de coloration plus simple et plus rapide que le bleu de Coomassie classique G-250. L'inconvénient de la coloration au bleu de coomassie est qu'elle est moins sensible que la coloration à l'argent. La coloration au bleu de Coomassie est environ 50 fois moins sensible que la coloration à l'argent. Cependant, en raison de sa simplicité de liaison, il est préféré dans de nombreuses études.
Qu'est-ce que la coloration à l'argent ?
La coloration à l'argent est une technique de coloration des protéines qui utilise une coloration à l'argent. La coloration à l'argent est utilisée pour colorer les gels d'agarose et de polyacrylamide. La coloration à l'argent des protéines dans les gels d'agarose a été développée pour la première fois en 1973 par Kerenyi et Gallyas. Plus tard, il a été adapté pour les protéines dans des gels de polyacrylamide qui sont utilisés en SDS-PAGE. Actuellement, la coloration à l'argent est également utilisée pour colorer l'ADN ou l'ARN. Afin de colorer les gels, les gels sont incubés avec une solution de nitrate d'argent dans cette méthode. La coloration à l'argent colore les sites où les protéines sont présentes du brun au noir.
Figure 02: coloration à l'argent
L'intensité de la coloration à l'argent dépend de la structure primaire de la protéine. De plus, la propreté des récipients utilisés et la pureté des réactifs peuvent également influencer la qualité de la coloration à l'argent. Cependant, l'inconvénient de la coloration à l'argent est qu'elle est incapable de détecter toutes les protéines, en particulier les glycoprotéines et les protéines avec de grands groupes modifiés attachés à leurs chaînes latérales.
Quelles sont les similitudes entre la coloration au Coomassie et à l'argent ?
- Coomassie et la coloration à l'argent sont deux techniques utilisées dans la coloration des protéines.
- Ils peuvent colorer à la fois les protéines et l'ADN.
- Les deux techniques de coloration ont des inconvénients.
- Ces techniques ont des étapes similaires, telles que la fixation, la coloration et la décoloration.
Quelle est la différence entre la coloration au Coomassie et à l'argent ?
La coloration de Coomassie est une technique de coloration des protéines qui utilise une coloration bleue brillante de coomassie, tandis que la coloration des rubans est une technique de coloration des protéines qui utilise une coloration à l'argent. C'est donc la principale différence entre la coloration au Coomassie et à l'argent. De plus, la coloration Coomassie est moins sensible que la coloration à l'argent.
L'infographie ci-dessous répertorie les différences entre la coloration au Coomassie et à l'argent sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Coomassie vs Silver Staining
Pour visualiser les protéines, une réaction chimique de liaison de colorant ou de production de couleur spécifique à la protéine peut être effectuée. C'est ce qu'on appelle la coloration des protéines. La coloration au Coomassie et à l'argent sont deux techniques utilisées dans la coloration des protéines. La technique de coloration au Coomassie utilise une coloration bleu brillant de Coomassie tandis que la coloration au ruban utilise une coloration à l'argent. C'est donc la principale différence entre Coomassie et la coloration à l'argent.
