La principale différence entre l'isolement de l'ADN génomique et de l'ADN plasmidique est que l'isolement de l'ADN génomique cible l'extraction de l'ADN génomique tandis que l'isolement de l'ADN plasmidique cible l'extraction de l'ADN plasmidique de la bactérie.
L'isolement de l'ADN est un processus chimique utilisé pour isoler l'ADN de différentes espèces ou de différents échantillons. L'isolement de l'ADN est important dans les techniques de biologie moléculaire en aval, telles que l'électrophorèse sur gel, la réaction en chaîne par polymérase et les techniques de séquençage de l'ADN. Par conséquent, l'isolement de l'ADN est un processus chimique essentiel dans les études de biologie moléculaire. Selon le but de la recherche, il est parfois nécessaire d'isoler l'ADN génomique. De plus, certaines études se concentrent sur l'isolement de l'ADN plasmidique des bactéries. L'isolement de l'ADN génomique est le processus d'isolement de l'ADN génomique à partir d'un échantillon procaryote ou eucaryote. Les étapes d'isolement diffèrent selon le type de cellule dans laquelle l'ADN s'isole. L'isolement de l'ADN plasmidique est le processus d'isolement de l'ADN plasmidique d'une cellule bactérienne. Par rapport à l'isolement de l'ADN génomique, le processus global est complexe dans l'isolement de l'ADN plasmidique.
Qu'est-ce que l'isolement de l'ADN génomique ?
L'isolement de l'ADN génomique est le processus d'extraction de l'ADN génomique entier d'un organisme. Ce processus particulier implique trois événements principaux. Ce sont la lyse cellulaire ou la lyse nucléaire, la dégradation des protéines ou la protéolyse et la précipitation de l'ADN génomique. L'étape de lyse peut différer selon le type de cellule. Chez les procaryotes, puisqu'il existe une paroi cellulaire peptidoglycane, la première étape devrait être la dégradation de la paroi cellulaire. D'autre part, chez les eucaryotes, l'étape de lyse implique la rupture de la membrane plasmique et de la membrane nucléaire pour évacuer l'ADN vers l'extérieur. En revanche, des étapes spéciales sont essentielles pour lyser les parois cellulaires des plantes et des champignons.
Figure 01: Isolement de l'ADN génomique
Par conséquent, une fois l'étape de lyse terminée, l'ADN finira par arriver dans le surnageant. Simultanément, la dégradation des protéines a également lieu dans la solution en raison de l'ajout de protéinase K. La prochaine étape consiste à séparer l'ADN génomique et les protéines dégradées les unes des autres. Ainsi, les protéines dégradées se séparent par précipitation permettant à l'ADN génomique de rester dans le surnageant. Après précipitation des protéines, l'ADN génomique peut être précipité et remis en suspension dans un tampon approprié jusqu'à ce qu'il soit nécessaire pour l'expérience.
L'ADN génomique, qui est un ADN linéaire, contient toutes les informations génétiques d'un organisme. En d'autres termes, le génome est le matériel héréditaire d'un organisme vivant qui est responsable de toutes les activités structurelles et fonctionnelles de la cellule. Il se compose de séquences d'ADN codantes et non codantes. Lors de l'isolement de l'ADN génomique, il inclut l'ensemble du génome de l'organisme.
Qu'est-ce que l'isolement d'ADN plasmidique ?
L'isolement de l'ADN plasmidique est un processus spécial et plus compliqué d'isolement de l'ADN. Les plasmides sont de l'ADN extrachromosomique présent dans la plupart des cellules bactériennes. Ce sont des ADN circulaires dormants qui permettent aux bactéries de survivre dans des conditions environnementales difficiles. L'ADN plasmidique est constitué de gènes résistants spéciaux qui offrent des avantages supplémentaires aux bactéries, tels que la résistance aux antibiotiques, les propriétés de virulence et les propriétés toxiques.
Figure 02: Isolement de l'ADN plasmidique
L'isolement de l'ADN plasmidique implique également trois processus principaux; lyse cellulaire, protéinolyse et précipitation de l'ADN. Bien que le mécanisme biochimique de l'isolement soit similaire à celui de l'isolement de l'ADN génomique, le processus est plus complexe que cela. Le processus de lyse cellulaire est le processus le plus important de cette procédure. Plus important encore, l'ADN génomique et l'ADN plasmidique ne doivent pas être mélangés. Par conséquent, un processus de lyse beaucoup plus doux s'intègre dans la procédure d'isolement de l'ADN plasmidique. Par conséquent, dans la plupart des procédures d'isolement d'ADN plasmidique, utilisez le détergent; dodécylsulfate de sodium pour la lyse cellulaire.
Quelles sont les similitudes entre l'isolement de l'ADN génomique et de l'ADN plasmidique ?
- L'isolement de l'ADN génomique et de l'ADN plasmidique se concentre sur l'extraction de l'ADN d'un organisme.
- En outre, les deux suivent le même processus global qui comprend la lyse cellulaire, la dégradation des protéines et la précipitation de l'ADN.
- De plus, l'ADN résultant des deux processus est important pour les processus en aval.
- De plus, les deux processus d'isolement incluent les étapes de purification et de stockage de l'ADN dans des conditions de stockage spécifiées.
- De plus, la protéinase K est utilisée dans les deux méthodes pour dégrader les protéines.
Quelle est la différence entre l'isolement de l'ADN génomique et de l'ADN plasmidique ?
L'isolement de l'ADN génomique se concentre sur l'extraction de l'ADN génomique entier de l'organisme cible, tandis que l'isolement de l'ADN plasmidique se concentre sur l'isolement de l'ADN plasmidique de l'espèce bactérienne particulière. C'est donc la principale différence entre l'isolement de l'ADN génomique et de l'ADN plasmidique. De plus, une autre différence entre l'isolement de l'ADN génomique et de l'ADN plasmidique réside dans la procédure. L'isolement de l'ADN génomique est une procédure moins complexe que l'isolement de l'ADN plasmidique. Par conséquent, lors de l'isolement de l'ADN plasmidique, il est nécessaire de prendre des précautions pour empêcher le mélange d'ADN génomique et plasmidique.
L'infographie ci-dessous fournit plus de détails sur la différence entre l'isolement de l'ADN génomique et de l'ADN plasmidique.
Résumé - Isolation de l'ADN génomique contre l'ADN plasmidique
L'isolement de l'ADN est un processus important dans les techniques de biologie moléculaire. Il existe deux types d'ADN, à savoir l'ADN génomique et l'ADN plasmidique (ADN extra-chromosomique). Sur la base de l'exigence, certaines procédures sont effectuées pour isoler l'ADN génomique tandis que certaines procédures se concentrent sur l'isolement uniquement de l'ADN plasmidique des bactéries. Par conséquent, les étapes impliquées dans les deux processus diffèrent légèrement les unes des autres. Cependant, le processus global est le même dans les deux isolements. L'ADN isolé des deux processus a une immense utilité dans les processus en aval tels que le clonage, l'électrophorèse sur gel et les réactions en chaîne par polymérase. À la fin du protocole d'isolement de l'ADN génomique, l'ensemble de l'ADN génomique de l'organisme peut être isolé en tant que produit final tandis qu'à la fin du protocole d'isolement de l'ADN plasmidique, l'ADN plasmidique de la bactérie respective peut être isolé en tant que produit final. C'est donc la différence entre l'isolement de l'ADN génomique et de l'ADN plasmidique.
