La principale différence entre les enzymes de restriction EcoRI et HindIII est que EcoRI est une enzyme de restriction de type II isolée de E. coli, tandis que HindIII est une enzyme de restriction de type II isolée de Haemophilus influenza.
L'enzyme de restriction ou endonucléase de restriction est une enzyme qui clive l'ADN en fragments au niveau de sites de reconnaissance spécifiques (sites de restriction) au sein de la molécule d'ADN. Ces enzymes de restriction se trouvent dans les bactéries et les archées. Ils fournissent un mécanisme de défense contre les virus envahisseurs. Les enzymes de restriction sont généralement classées en cinq types différents: type I, type II, type III, IV et type V. EcoRI et HindIII sont deux enzymes de restriction appartenant au groupe des enzymes de restriction de type II.
Que sont les enzymes de restriction EcoRI ?
EcoRI est une enzyme de restriction de type II isolée des espèces d'E. coli. C'est une enzyme de restriction qui clive les doubles hélices d'ADN en fragments à des sites spécifiques. EcoRI fait également partie du système de restriction-modification. EcoRI a été la première enzyme isolée à l'origine de la souche RY13 de l'espèce E. coli. Il est utilisé comme enzyme de restriction en biologie moléculaire. EcoRI crée des extrémités collantes de 4 nucléotides avec des surplombs d'extrémité 5 'd'AATT. EcoRI coupe l'ADN au niveau de la séquence de reconnaissance spécifique G↓AATTC. Il a la séquence complémentaire palindromique de CTTAA↓G. De plus, cette enzyme de restriction appartient à la sous-classe de type II P (spécificité palindromique). Dans sa structure primaire, EcoRI contient le motif PD. D/EXK dans son site actif, comme de nombreuses autres enzymes de restriction.
Figure 01: EcoRI
L'enzyme de restriction EcoRI est un homodimère de 31 kDa. Il contient un domaine globulaire de l'architecture α/β. Chaque sous-unité contient une boucle qui sort du domaine globulaire et s'enroule autour de l'ADN lorsqu'elle est liée. Cette enzyme peut être cocristallisée avec la séquence qu'elle coupe normalement. En outre, l'enzyme de restriction EcoRI est utilisée dans une grande variété de techniques de génétique moléculaire, notamment le clonage, le criblage d'ADN et la suppression de sections d'ADN in vitro.
Que sont les enzymes de restriction HindIII ?
HindIII est une enzyme de restriction de type II isolée des espèces Haemophilus influenza. Il clive la séquence palindromique d'ADN AACCTT en présence du cofacteur Mg2+ par hydrolyse. Le clivage de cette séquence particulière entre les AA (5'A↓ACCTT3' et 3'TTCGA↓A5') entraîne des surplombs en 5' sur la molécule d'ADN appelés extrémités collantes. Cette enzyme se trouve dans les organismes procaryotes comme les bactéries. Les bactéries utilisent cette enzyme comme mécanisme de défense contre les virus tels que les bactériophages.
Figure 02: HindIII
Structurellement, HindIII est un homodimère. Il contient un noyau structurel commun comprenant quatre feuillets β et une seule hélice α, comme d'autres types d'enzymes de restriction II. La masse moléculaire de cette enzyme est de 34,9 kDa. De plus, HindIII est très utile dans les expériences scientifiques modernes de biologie moléculaire telles que le séquençage et la cartographie de l'ADN.
Quelles sont les similitudes entre les enzymes de restriction EcoRI et HindIII ?
- EcoRI et HindIII sont deux enzymes de restriction appartenant au groupe des enzymes de restriction de type II.
- EcoRI et HindIII ont été découverts au début des années 1970.
- EcoRI et HindIII contiennent tous deux le motif de séquence d'acides aminés PD.. D/EXK.
- Les deux enzymes de restriction effectuent un clivage très spécifique de l'ADN.
- Ces enzymes de restriction ont besoin de Mg2+ comme cofacteur pour leur activité spécifique.
- Ils produisent des extrémités collantes après avoir coupé l'ADN.
- Ce sont des composants très utiles dans la recherche moderne en biologie moléculaire.
Quelle est la différence entre les enzymes de restriction EcoRI et HindIII ?
EcoRI est une enzyme de restriction de type II isolée des espèces d'E. coli, tandis que HindIII est une enzyme de restriction de type II isolée des espèces d'Haemophilus influenza. C'est donc la principale différence entre EcoRI et HindIII. De plus, EcoRI coupe l'ADN au niveau de la séquence de reconnaissance spécifique G↓AATTC, tandis que HindIII coupe l'ADN au niveau de la séquence de reconnaissance spécifique A↓ACCTT.
L'infographie ci-dessous présente les différences entre EcoRI et HindIII sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Enzymes de restriction EcoRI vs HindIII
EcoRI et HindIII sont deux enzymes de restriction appartenant à la sous-classe p de type II. Ils effectuent un clivage très spécifique de l'ADN. EcoRI est une enzyme de restriction de type II qui est isolée de l'espèce E. coli, tandis que HindIII est une enzyme de restriction de type II qui est isolée de l'espèce Haemophilus influenza. Donc, cela résume la différence entre EcoRI et HindIII.
