La principale différence entre le dNTP et le ddNTP est que le dNTP ou les désoxyribonucléotides sont les éléments constitutifs de l'ADN et possèdent un groupe 3ʹ-OH sur la structure du sucre pentose, tandis que le ddNTP ou les didésoxynucléosides triphosphates sont des nucléotides dépourvus de groupe 3ʹ-OH et ils sont utilisés dans la technique de séquençage de l'ADN didésoxy de Sanger pour produire des séquences d'ADN de différentes longueurs.
dNTP et ddNTP sont des nucléotides. dNTP fait référence aux nucléotides désoxyribose. Ce sont les éléments constitutifs de l'ADN. Les dNTP sont utilisés pour synthétiser l'ADN. Le dNTP, quant à lui, fait référence aux didésoxynucléosides triphosphates. Ils sont utilisés dans le séquençage Sanger pour terminer la synthèse d'ADN à différentes longueurs. Ils sont dépourvus de groupe OH en position 3ʹ. Un hydrogène est présent en position 3ʹ à la place du groupe OH. Par conséquent, les ddNTP sont incapables de former une liaison phosphodiester avec le nucléotide suivant. Le dNTP est capable de réaliser la synthèse de l'ADN, tandis que le ddNTP est capable de terminer la polymérisation de l'ADN.
Qu'est-ce que le dNTP ?
dNTP signifie désoxyribose nucléotide ou désoxyribonucléotide. C'est la pierre angulaire de l'ADN. Il existe quatre types de dNTP. Ce sont le dATP, le dTTP, le dCTP et le dGTP. Ils sont nommés selon les bases azotées puriques ou pyrimidiques: Adénine (A), Guanine (G), Thymine (T) et Cytosine (C).
Figure 01: dNTP
L'adénine et la guanine sont des bases puriques tandis que la thymine et la cytosine sont des bases pyrimidiques. Le sucre pentose du dNTP est le désoxyribose. Il existe également un groupe phosphate. Par conséquent, le dNTP est composé de trois composants: une base azotée, un sucre désoxyribose et un groupe phosphate. Ces dNTP se combinent entre eux via des liaisons phosphodiester. Dans les dNTP, il existe un groupe OH attaché à la position 3ʹ du sucre pentose qui est nécessaire pour former une liaison avec le groupe phosphate attaché au carbone 5ʹ du sucre du nucléotide suivant. Étant donné que tous les dNTP possèdent ce groupe 3ʹ -OH, ils sont capables de synthétiser et d'étendre des brins d'ADN. Par conséquent, le dNTP agit comme l'unité répétitive de base de l'ADN et de la matière chimique des gènes. La synthèse de l'ADN se déroule toujours de 5ʹ à 3ʹ.
Qu'est-ce que le DdNTP ?
Le séquençage Sanger est une méthode de séquençage d'ADN de première génération développée par Frederick Sanger et ses collèges en 1977. Il est également connu sous le nom de séquençage de terminaison de chaîne ou séquençage didésoxy puisque le principe de base de cette méthode est la terminaison de chaîne à l'aide de didésoxynucléoside triphosphates (ddNTP). Les ddNTP sont des nucléotides utilisés dans le séquençage Sanger. Le séquençage de Sanger est basé sur l'incorporation sélective de ddNTP et l'arrêt de la synthèse d'ADN lors de la réplication in vitro de l'ADN. La spécialité des ddNTP est qu'ils manquent de groupe 3ʹ-OH sur le sucre pentose pour continuer la formation de liaisons phosphodiester entre le groupe phosphate de 5ʹ dans le nucléotide adjacent. Par conséquent, une fois qu'un ddNTP est attaché au brin d'extension, l'allongement de la chaîne cesse et se termine à partir de ce point. Les ddNTP agissent comme des inhibiteurs d'allongement de chaîne de l'ADN polymérase au cours de la méthode de séquençage de Sanger.
Figure 02: ddNTP
Il existe quatre ddNTP: ddATP, ddCTP, ddGTP et ddTTP utilisés dans le séquençage Sanger. Ces nucléotides arrêtent le processus de réplication de l'ADN lorsqu'ils sont incorporés dans le brin d'ADN en croissance. En conséquence, le séquençage de Sanger produit des longueurs variables d'ADN court. L'électrophorèse sur gel capillaire est utilisée pour organiser ces courts brins d'ADN par leur taille sur un gel. Les ddNTP sont marqués de manière radioactive ou fluorescente avec différentes couleurs pour faciliter l'analyse de la séquence d'ADN. En analysant le gel, la séquence nucléotidique du brin d'ADN inconnu peut être déterminée.
Quelles sont les similitudes entre le dNTP et le DdNTP ?
- DNTP et ddNTP sont utilisés dans le séquençage Sanger.
- Il existe quatre types de dNTP et ddNTP.
- Ils sont composés de trois composants: une base azotée, un sucre désoxyribose et des groupements phosphate.
Quelle est la différence entre dNTP et DdNTP ?
dNTP est l'un des quatre types de désoxyribonucléotides qui sont des éléments constitutifs de l'ADN. Le ddNTP est l'un des quatre types de didésoxyribonucléosides triphosphates utilisés dans la technique de séquençage de Sanger. Le dNTP a un groupe 3ʹ-OH sur le sucre pentose tandis que le ddNTP n'a pas de groupe 3ʹ-OH sur le sucre pentose. C'est donc la principale différence entre dNTP et ddNTP. De plus, les dNTP effectuent la polymérisation de l'ADN tandis que les ddNTP terminent la polymérisation de l'ADN. Il s'agit donc d'une autre différence majeure entre dNTP et ddNTP.
L'infographie ci-dessous répertorie les différences entre dNTP et ddNTP sous forme de tableau.
Résumé - dNTP vs DdNTP
Les dNTP normaux sont des éléments constitutifs de l'ADN, tandis que les ddNTP sont des nucléotides utilisés dans la technique de séquençage de Sanger. dNTP a 3ʹ-OH tandis que ddNTP manque de 3ʹ-OH. C'est donc la principale différence entre dNTP et ddNTP. De plus, le dNTP peut synthétiser un brin d'ADN tandis que le ddNTP peut terminer la polymérisation de l'ADN. Par conséquent, les ddNTP sont utilisés dans le séquençage de Sanger afin de produire différents brins d'ADN de longueurs variables. Lors du séquençage de Sanger, dNTP et ddNTP sont inclus.
