La principale différence entre les introns du groupe I et du groupe II est que dans les introns du groupe I, la réaction d'épissage est initiée par un cofacteur de la guanosine, tandis que dans les introns du groupe II, la réaction d'épissage est initiée par l'adénosine interne.
Le pré-ARNm est le transcrit primaire qui contient à la fois des introns et des exons. Le pré-ARNm doit se convertir en ARNm avant la traduction. L'épissage d'ARN ou l'épissage de pré-ARNm est l'une de ces modifications post-transcriptionnelles. Dans l'épissage d'ARN, les introns sont retirés de la molécule de pré-ARNm et les exons sont réunis. Les introns du groupe I et du groupe II sont des introns auto-épissants. Ils se séparent de la molécule de pré-ARNm sans l'aide d'aucune autre enzyme. Par conséquent, ce sont des enzymes d'ARN ou des ribozymes qui catalysent leur propre épissage à partir du pré-ARNm. De plus, ils ont la capacité de fonctionner comme des éléments mobiles. Lors de l'épissage, une série de réactions de trans-estérification a lieu afin d'exciser l'intron et de ligaturer les exons. Ces ribozymes sont présents dans les trois domaines, y compris les bactéries, les archées et les eucaryotes.
Que sont les introns du groupe I ?
Les introns du groupe I sont un type de ribozymes auto-épissants trouvés dans les bactéries, les bactériophages et les eucaryotes (génomes organites et nucléaires). On les trouve dans les gènes essentiels. Ils sont capables de catalyser leur propre épissage à partir de la molécule de pré-ARNm. Les introns du groupe I peuvent avoir quelques centaines à trois mille nucléotides. De plus, ils présentent peu de similitude de séquence entre les organismes.
Figure 01: Introns du groupe I
Les structures secondaires sont hautement conservées dans quatre courtes régions. Il existe deux étapes de réaction de transestérification de l'épissage. Les introns du groupe I initient le mécanisme d'épissage par l'attaque nucléophile de l'hydroxyle 3' d'un cofacteur de la guanosine au site d'épissage 5P.
Que sont les introns du groupe II ?
Les introns du groupe II sont un type d'introns auto-épissants trouvés dans les organismes appartenant aux trois domaines. Ce sont des ribozymes qui catalysent leurs propres réactions d'épissage à partir du pré-ARNm. On les trouve dans l'ARNr, l'ARNt et les gènes codant pour les protéines. Mais ils ne se trouvent pas dans les génomes nucléaires, contrairement aux introns du groupe I.
Figure 02: Introns du groupe II
Les introns du groupe II catalysent l'épissage via deux étapes de transestérification similaires aux introns du groupe I. Ces enzymes initient la réaction d'épissage par l'attaque nucléophile du 2' OH de l'adénosine du site de ramification sur la jonction d'épissage 5'. Au cours des réactions d'épissage, les introns du groupe II forment une structure de type lariat. De plus, l'épissage des introns a lieu en l'absence de GTP.
Quelles sont les similitudes entre les introns du groupe I et du groupe II ?
- Les introns des groupes I et II sont deux types d'enzymes ARN, des ribozymes qui catalysent leur propre épissage par des mécanismes différents.
- Ce sont de gros ribozymes.
- Les deux se trouvent dans les trois domaines.
- Ce sont des éléments mobiles.
- De plus, on les trouve dans l'ARNr, l'ARNt et les gènes codant pour les protéines.
- Les deux enzymes sont utilisées comme outils en biotechnologie et en médecine moléculaire pour les systèmes de knock-out/knock-down de gènes ciblés, de délivrance de gènes ou de thérapie génique.
Quelle est la différence entre les introns du groupe I et du groupe II ?
Les introns du groupe I sont des ribozymes présents dans les bactéries, les bactériophages et les génomes organites et nucléaires eucaryotes. Les introns du groupe II sont des ribozymes trouvés dans les bactéries, les archées et les organites eucaryotes. De plus, les introns du groupe I initient une réaction d'épissage par l'attaque nucléophile du 3 'hydroxyle d'un cofacteur de la guanosine au site d'épissage 5P tandis que les introns du groupe II initient une réaction d'épissage par l'attaque nucléophile du 2' OH du site de ramification adénosine sur le Jonction d'épissure 5 '. C'est donc la principale différence entre les introns du groupe I et du groupe II.
De plus, les introns du groupe II forment une structure semblable à un lariat pendant l'épissage, tandis que les introns du groupe I ne se forment pas. Il s'agit donc d'une autre différence significative entre les introns du groupe I et du groupe II. En outre, les introns du groupe I se trouvent dans les génomes nucléaires eucaryotes, tandis que les introns du groupe II ne se trouvent pas dans les génomes nucléaires eucaryotes.
L'infographie ci-dessous répertorie les différences entre les introns du groupe I et du groupe II sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Groupe I vs Groupe II Introns
Les introns des groupes I et II sont de gros ribozymes qui catalysent une réaction de transestérification pour séparer les introns du transcrit primaire. On les retrouve dans les trois domaines. Ce sont tous deux des éléments génétiques mobiles. De plus, ils sont utilisés comme outils en biotechnologie et en médecine moléculaire. Cependant, les introns du groupe I initient une réaction d'épissage par l'attaque nucléophile du 3 'OH d'un cofacteur de la guanosine au site d'épissage 5P. Mais, les introns du groupe II initient la réaction d'épissage par l'attaque nucléophile du 2' OH de l'adénosine du site de ramification sur la jonction d'épissage 5'. De plus, les introns du groupe II forment une structure de type lariat lors de l'épissage, tandis que les introns du groupe I ne forment pas une structure de type lariat. Ainsi, ceci est le résumé de la différence entre les introns du groupe I et du groupe II.
