La principale différence entre les sondes d'ADN et d'ARN est que les sondes d'ADN sont des fragments d'ADN complémentaires aux séquences de nucléotides cibles, tandis que les sondes d'ARN sont des segments d'ARN simple brin qui sont des séquences d'acide nucléique complémentaires des séquences cibles.
Une sonde est une courte séquence d'ADN ou d'ARN synthétisée artificiellement qui peut être marquée radioactivement ou avec des molécules non radioactives. Il peut avoir une longueur de 100 à 1000 bases. Les sondes sont utiles pour détecter des séquences nucléotidiques cibles qui sont complémentaires de la séquence de la sonde. Une fois ajoutées, les sondes s'hybrident avec les séquences complémentaires ou les séquences cibles et les rendent visibles pour identifier les séquences cibles car elles sont porteuses de radioactivité. Les sondes sont des outils moléculaires importants dans de nombreux domaines microbiens et moléculaires tels que la détection de maladies génétiques, la virologie, la médecine légale, les tests de paternité, les empreintes génétiques, le RFLP, la cytogénétique moléculaire, l'hybridation in situ, etc.
Que sont les sondes ADN ?
Les sondes d'ADN sont des segments d'ADN simple brin. Ils peuvent être utilisés pour détecter la présence de séquences d'acides nucléiques complémentaires (séquences cibles) par hybridation. Une fois qu'une sonde d'ADN s'est hybridée avec sa séquence complémentaire, elle forme un hybride double brin. Pour les détecter, les sondes d'ADN sont généralement marquées avec des radio-isotopes, de la biotine, des épitopes ou des fluorophores. Les sondes d'ADN marquées à la biotine peuvent être détectées avec de la phosphatase alcaline marquée à la streptavidine par un certain nombre de méthodes enzymatiques et chimiques.
Figure 01: Sonde ADN
La séquence nucléotidique de la sonde ADN est connue. Ce sont des séquences courtes d'une longueur de 100 à 1000 paires de bases. De longues sondes d'ADN peuvent être générées par la technologie de l'ADN recombinant. Ils peuvent également être générés par PCR et clonage. Dans les laboratoires de microbiologie clinique, les sondes ADN sont facilement disponibles pour le diagnostic rapide des maladies infectieuses.
Que sont les sondes ARN ?
Les sondes d'ARN sont des segments d'ARN simple brin. Ce sont des séquences complémentaires aux séquences cibles dans l'échantillon. Elles sont couramment synthétisées avec les ARN polymérases des bactériophages SP6, T7 ou T3 par transcription in vitro de l'ADN. De longues sondes d'ARN peuvent être générées par transcription in vitro à partir d'ADN plasmidique linéarisé. Généralement, les sondes d'ARN se lient fortement et plus étroitement à leurs séquences complémentaires que les sondes d'ADN. Semblables aux sondes d'ADN, les sondes d'ARN peuvent également être marquées pendant leur transcription.
Quelles sont les similitudes entre les sondes ADN et ARN ?
- Les sondes d'ADN et d'ARN sont des séquences de nucléotides simple brin.
- Les deux sont artificiellement conçus et synthétisés.
- De plus, ils peuvent être marqués avec des radio-isotopes, des épitopes, de la biotine ou des fluorophores.
- Ils ont une forte affinité avec une séquence cible spécifique d'ADN ou d'ARN.
- Ils sont utilisés dans diverses techniques de transfert et d'hybridation in situ pour la détection de séquences d'acides nucléiques cibles.
- Les deux types de sondes peuvent être hybridées avec leurs séquences complémentaires.
- Ils sont également utilisés pour l'identification de micro-organismes et le diagnostic de maladies infectieuses, héréditaires et autres.
Quelle est la différence entre les sondes ADN et ARN ?
La sonde d'ADN est une courte séquence d'ADN complémentaire de la séquence cible. D'autre part, la sonde d'ARN est une courte séquence d'ARN simple brin complémentaire de la séquence cible. C'est donc la principale différence entre les sondes d'ADN et d'ARN. De plus, les sondes ADN contiennent A, T, C et G tandis que les sondes ARN contiennent A, U, C et G.
De plus, une autre différence entre les sondes ADN et ARN est leur stabilité thermodynamique. Les sondes ARN présentent une plus grande stabilité thermodynamique par rapport aux sondes ADN.
L'infographie ci-dessous présente les différences importantes entre les sondes d'ADN et d'ARN.
Résumé - Sondes ADN vs ARN
Une sonde est un petit fragment d'ADN ou d'ARN utilisé pour détecter la présence d'une séquence spécifique dans l'échantillon d'ADN ou d'ARN par hybridation moléculaire. Les sondes d'ADN sont de courts fragments d'ADN simple brin tandis que les sondes d'ARN sont de courtes séquences d'ARN simple brin. Ce sont des séquences connues. La stabilité thermodynamique est plus grande dans les sondes ARN que dans les sondes ADN. Les sondes d'ARN se lient étroitement à leurs séquences complémentaires que les sondes d'ADN ne se lient. Ainsi, cela résume la différence entre les sondes d'ADN et d'ARN.
