Différence clé - Électrophorèse sur gel vs page SDS
L'électrophorèse sur gel est une technique qui sépare des macromolécules dans un champ électrique. C'est une méthode courante en biologie moléculaire pour séparer l'ADN, l'ARN et les protéines de mélanges en fonction de leurs tailles moléculaires. La page SDS est un type d'électrophorèse sur gel qui est utilisée pour séparer les protéines d'un mélange de protéines en fonction de leur taille. L'électrophorèse sur gel est un terme utilisé pour désigner la technique normale appliquée à la séparation de l'ADN, de l'ARN et des protéines, tandis que la page SDS est un type d'électrophorèse sur gel. C'est la principale différence entre l'électrophorèse sur gel et la page SDS.
Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel ?
L'électrophorèse sur gel est une technique couramment utilisée dans les laboratoires pour séparer les molécules chargées telles que l'ADN, l'ARN, les protéines, etc. de leurs mélanges. Un gel est utilisé dans l'électrophorèse sur gel. Il agit comme un tamis moléculaire. Il existe deux types de gels utilisés dans l'électrophorèse sur gel, à savoir l'agarose et le polyacrylamide. La sélection d'un gel et d'une préparation de gel sont des facteurs importants à prendre en compte dans les électrophorèses sur gel car la taille des pores du gel doit être soigneusement manipulée pour une bonne séparation des molécules par électrophorèse sur gel. L'électrophorèse sur gel a un champ électrique connecté aux deux extrémités du gel. Une extrémité du gel montre une charge positive tandis que l'autre extrémité est chargée négativement.
L'ADN et l'ARN sont des molécules chargées négativement. Une fois qu'ils sont chargés dans le gel à partir de l'extrémité négative du gel et appliqués au champ électrique, ils migrent à travers les pores du gel vers l'extrémité chargée positivement du gel. La vitesse de migration dépend de la charge et de la taille de la molécule. Les molécules plus petites migrent facilement à travers les pores du gel que les molécules plus grosses. Par conséquent, les molécules plus petites parcourent une longue distance à travers le gel et les molécules plus grosses parcourent une courte distance. Pour observer le déplacement des molécules sur le gel, des types spéciaux de colorants sont utilisés. Le champ électrique est appliqué pendant une certaine période de temps et arrêté pour empêcher la perte de molécules et pour maintenir les molécules à leurs positions parcourues. Différentes bandes peuvent être observées dans le gel. Ces bandes représentent les molécules de différentes tailles. Par conséquent, l'électrophorèse sur gel est utile pour différencier les molécules en fonction de leur taille.
L'électrophorèse sur gel est incorporée dans diverses techniques en tant que technique préparative en biologie moléculaire telles que la PCR, la RFLP, le clonage, le séquençage de l'ADN, le transfert Southern, la cartographie du génome, etc.
Figure 01: Électrophorèse sur gel d'agarose
Qu'est-ce que la page SDS ?
L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide dodécylsulfate de sodium (page SDS) est un type d'électrophorèse sur gel utilisé pour séparer les protéines. Lorsque l'électrophorèse sur gel est utilisée pour séparer les protéines, des traitements spéciaux sont nécessaires car les protéines ne sont pas chargées négativement comme l'ADN et l'ARN et ne migrent pas vers l'extrémité positive ou l'extrémité négative. Par conséquent, les protéines sont dénaturées et recouvertes d'une charge négative avant l'électrophorèse sur gel. Cela se fait à l'aide d'un détergent appelé dodécylsulfate de sodium (SDS). L'électrophorèse sur gel qui utilise du SDS et un gel de polyacrylamide comme support est connue sous le nom de SDS Page. Cette technique est couramment utilisée en biochimie, en génétique, en médecine légale et en biologie moléculaire.
Pendant la page SDS, les protéines sont mélangées avec le SDS. Le SDS déplie les protéines en une forme linéaire et les enrobe d'une charge négative proportionnelle à leur masse moléculaire. En raison de la charge négative, les molécules de protéines migrent vers l'extrémité de charge positive du gel et se séparent en fonction de leurs masses moléculaires. Dans la page SDS, le polyacrylamide est utilisé comme support solide pour le gel. La séparation réelle des protéines dépend principalement des propriétés du gel. Par conséquent, la préparation du gel de polyacrylamide doit être effectuée avec soin et des concentrations correctes de polyacrylamide doivent être utilisées. Les gels de polyacrylamide présentent une résolution élevée par rapport aux gels d'agarose. Par conséquent, la page SDS est considérée comme une technique à haute résolution pour la séparation des protéines.
SDS Page est un type d'électrophorèse sur gel dénaturant. Il a une limitation majeure dans l'analyse des protéines. Étant donné que le SDS dénature les protéines avant la séparation, il ne permet pas la détection de l'activité enzymatique, des interactions de liaison aux protéines, des cofacteurs protéiques, etc.
Figure 02: Page FDS
Quelle est la différence entre l'électrophorèse sur gel et la page SDS ?
Électrophorèse sur gel vs page SDS |
|
| L'électrophorèse sur gel est une méthode utilisée pour séparer les macromolécules à l'aide d'un champ électrique. | SDS Page est une technique d'électrophorèse sur gel haute résolution utilisée pour séparer les protéines en fonction de leur masse. |
| Gel Run | |
| Il peut être exécuté de manière horizontale ou verticale. | La page SDS s'exécute toujours verticalement. |
| Base pour la séparation | |
| La séparation se produit en fonction de la charge et de la taille. | La séparation des protéines se produit en fonction de la masse et de la charge. |
| Résolution | |
| L'électrophorèse sur gel d'agarose a une faible résolution et l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide a une résolution plus élevée | La page SDS a une meilleure résolution. |
| Dénaturation | |
| L'électrophorèse sur gel comprend à la fois des techniques dénaturantes et non dénaturantes. | La page SDS dénature les protéines avant la séparation. |
Résumé - Électrophorèse sur gel vs page SDS
L'électrophorèse sur gel est une technique couramment utilisée pour la séparation et l'analyse de l'ADN, de l'ARN et des protéines en fonction de leur taille et de leur charge. Il existe deux principaux types d'électrophorèse sur gel, à savoir l'électrophorèse sur gel d'agarose et l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. Les gels d'agarose sont principalement utilisés pour la séparation des acides nucléiques; lorsqu'une résolution plus élevée est requise, des gels de polyacrylamide sont utilisés. La page SDS est un type d'électrophorèse sur gel couramment utilisée pour séparer des mélanges complexes de protéines. Elle est considérée comme une technique de séparation de protéines à haute résolution. C'est la différence entre l'électrophorèse sur gel et la page SDS.
