La principale différence entre la séquence Shine Dalgarno et la séquence Kozak est que la séquence Shine Dalgarno est un site de liaison ribosomique dans l'ARN messager bactérien et archéen, tandis que la séquence Kozak est un site d'initiation de la traduction des protéines dans la plupart des ARN messagers eucaryotes.
Shine Dalgarno et les séquences de Kozak sont deux séquences consensus très importantes pour l'initiation de la traduction. En biologie moléculaire, la traduction est le processus par lequel les ribosomes du cytoplasme synthétisent des protéines après le processus de transcription. En traduction, un ARNm (ARN messager) est décodé dans un ribosome pour produire une chaîne d'acides aminés spécifique à l'extérieur du noyau. Typiquement, un ribosome induit le processus de décodage en facilitant la liaison de séquences d'anticodon d'ARNt complémentaires aux codons d'ARNm. La traduction se déroule en trois étapes: initiation, allongement et terminaison.
Qu'est-ce que la séquence Shine Dalgarno ?
La séquence Shine Dalgarno est un site de liaison ribosomique dans l'ARN messager bactérien et archéen. Il est généralement situé autour de 8 bases en amont du codon start AUG. Cette séquence d'ARN aide à recruter des ribosomes pour l'ARN messager en alignant le ribosome avec un codon d'initiation d'ARNm. Ainsi, il initie la synthèse des protéines. Une fois après le recrutement, l'ARNt peut ajouter des acides aminés dans l'ordre dicté par les codons de l'ARNm. Cette séquence spéciale est courante chez les bactéries mais plus rare chez les archées. De plus, il est également présent dans les transcrits des chloroplastes et des mitochondries. La séquence Shine Dalgarno a été proposée pour la première fois par les scientifiques australiens John Shine et Lynn Dalgarno. La séquence consensus de six bases est AGGAGG. Par exemple, chez Escherichia coli, la séquence est AGGAGGU.
Figure 01: Séquence Shine Dalgarno
La sélection du site d'initiation (AUG) dépend de l'interaction entre la sous-unité 30S du ribosome et la matrice d'ARNm. La région riche en pyrimidine sur le composant 16srRNA de la sous-unité 30S se lie à la région riche en purine connue sous le nom de séquence Shine Dalgarno en amont du codon d'initiation AUG dans l'ARNm. De plus, lors de la formation du complexe d'initiation, ces séquences nucléotidiques complémentaires s'apparient pour former une structure d'ARN double brin. Cela facilite la liaison de l'ARNm à un ribosome de telle manière que le codon d'initiation est placé sur le site P du ribosome.
Qu'est-ce que la séquence Kozak ?
La séquence Kozak est un site d'initiation de la traduction des protéines dans la plupart des ARNm eucaryotes. Cette séquence est également appelée séquence consensus de Kozak. La séquence Kozak est la séquence optimale pour initier la traduction chez les eucaryotes. Cette séquence fait partie intégrante de la régulation des protéines. Il est également très important pour la santé cellulaire globale. Il aide à corriger la traduction des protéines à partir des messages génétiques en assurant la médiation de l'assemblage des ribosomes et de l'initiation de la traduction.
Figure 02: Séquence de Kozak
Cette séquence porte le nom de la scientifique qui l'a découverte, Marilyn Kozak. Elle l'a découvert grâce à une analyse détaillée des séquences génomiques d'ADN. La séquence de Kozak est 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Les lettres majuscules indiquent des bases conservées, tandis que les lettres minuscules indiquent des bases variables communes. R indique une purine (adénine ou guanine) toujours positionnée à cet endroit.
Quelles sont les similitudes entre Shine Dalgarno et Kozak Sequence ?
- Les séquences Shine Dalgarno et Kozak sont deux séquences consensus très importantes dans l'initiation de la traduction.
- Les deux sont des séquences d'ARN.
- La plus petite sous-unité du ribosome se lie aux deux séquences.
- Les deux séquences interviennent dans l'assemblage approprié des ribosomes et l'initiation de la traduction.
- Ils font partie intégrante de la régulation des protéines et de la santé cellulaire globale.
Quelle est la différence entre la séquence Shine Dalgarno et Kozak ?
La séquence Shine Dalgarno est un site de liaison ribosomique présent dans l'ARN messager bactérien et archéen, tandis que la séquence Kozak est un site d'initiation de la traduction protéique présent dans la plupart des ARN messagers eucaryotes. C'est donc la principale différence entre Shine Dalgarno et la séquence Kozak. De plus, la séquence Shine Dalgarno est 5'AGGAGGU3' tandis que la séquence Kozak est 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
L'infographie suivante répertorie les différences entre les séquences Shine Dalgarno et Kozak sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé – Séquence Shine Dalgarno vs Kozak
Les séquences Shine Dalgarno et Kozak sont deux séquences d'ARN consensus qui sont très importantes pour l'assemblage des ribosomes et l'initiation de la traduction. La séquence Shine Dalgarno est un site de liaison ribosomique dans l'ARN messager bactérien et archéen, tandis que la séquence Kozak est un site d'initiation de la traduction des protéines dans la plupart des ARN messagers eucaryotes. Ainsi, cela résume la différence entre la séquence Shine Dalgarno et Kozak.
