La principale différence entre le facteur sigma et le facteur rho est que le facteur sigma est une protéine nécessaire à l'initiation de la transcription chez les bactéries, tandis que le facteur rho est une protéine nécessaire à l'arrêt de la transcription chez les bactéries.
Le facteur sigma et le facteur rho sont deux facteurs importants pour la transcription bactérienne. La transcription bactérienne est un processus dans lequel un morceau d'ADN bactérien est copié dans un nouveau brin d'ARNm (ARN messager). Ce processus est catalysé par une enzyme appelée ARN polymérase. Les bactéries dépendent fortement de la transcription et de la traduction pour répondre correctement à leur environnement. L'ARN polymérase bactérienne est constituée d'un noyau et d'une structure holoenzymatique. Le noyau contient les sous-unités β, β′, α et 2ω tandis que l'holoenzyme contient le facteur sigma. De plus, un facteur auxiliaire de l'ARN polymérase connu sous le nom de facteur rho est également très important pour la transcription bactérienne.
Qu'est-ce que le facteur Sigma ?
Le facteur Sigma ou facteur de spécificité est une protéine nécessaire à l'initiation de la transcription chez les bactéries. C'est un facteur bactérien d'initiation de la transcription. Ce facteur permet la liaison de l'enzyme ARN polymérase à une région spécifique de l'ADN appelée région promotrice lors de la transcription. Le facteur sigma est normalement homologue au facteur de transcription archéen B et au facteur de transcription eucaryote TF11B. De plus, le facteur sigma spécifique d'un gène donné varie en fonction du gène et des signaux environnementaux. Les promoteurs sont sélectionnés par l'ARN polymérase en fonction du facteur sigma qui lui est associé.
Figure 01: Facteur Sigma
Le facteur sigma peut également être trouvé dans le chloroplaste des plantes en tant que partie de la polymérase codée par les plastes (PEP). Le facteur sigma et l'ARN polymérase sont connus sous le nom d'holoenzyme ARN polymérase. Le poids moléculaire du facteur sigma est d'environ 70 kDa. Après l'initiation de la transcription, le facteur sigma se dissocie du complexe. Ensuite, l'ARN polymérase continue son élongation jusqu'à la fin de la transcription.
Qu'est-ce que le facteur Rho ?
Rho factor est une protéine procaryote impliquée dans la terminaison de la transcription. Le facteur Rho se lie généralement au site de pause du terminateur de transcription. Ce site est une région exposée de l'ARN simple brin près du cadre de lecture ouvert au niveau des séquences pauvres en guanine riche en cytosine. C'est une protéine de transcription essentielle chez les procaryotes. Chez Escherichia coli, le facteur rho est d'environ 274,6 kDa hexamère de sous-unités identiques. Chaque sous-unité possède un domaine de liaison à l'ARN et un domaine d'hydrolyse de l'ATP. De plus, la fonction du facteur rho est l'activité de l'hélicase.
Figure 02: Facteur Rho
Le facteur Rho se lie à la molécule d'ARN et utilise ensuite son activité ATPase pour fournir de l'énergie pour transloquer les molécules d'ARN. Le facteur Rho effectue la translocation jusqu'à ce qu'il atteigne la région hélicoïdale ARN-ADN, où il déroule la structure duplex hybride (ARN-ADN). Ce processus met en pause l'ARN polymérase au site de terminaison, mettant fin au processus de transcription.
Quelles sont les similitudes entre le facteur Sigma et le facteur Rho ?
- Le facteur sigma et le facteur rho sont deux facteurs importants pour la transcription bactérienne.
- Les deux ne sont présents que chez les procaryotes.
- Ce sont des protéines composées d'acides aminés.
- Les deux sont des protéines de liaison aux acides nucléiques.
- Les procaryotes dépendent fortement de ces facteurs pour générer de l'ARNm qui peut fabriquer des protéines particulières et les aider à réagir spécifiquement à leur environnement.
Quelle est la différence entre le facteur Sigma et le facteur Rho ?
Le facteur sigma est une protéine nécessaire à l'initiation de la transcription chez les bactéries, tandis que le facteur rho est une protéine nécessaire à l'arrêt de la transcription chez les bactéries. C'est donc la principale différence entre le facteur sigma et le facteur rho. De plus, le facteur sigma est une protéine de liaison à l'ADN, tandis que le facteur rho est une protéine de liaison à l'ARN.
L'infographie ci-dessous présente les différences entre le facteur sigma et le facteur rho sous forme de tableau pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Facteur Sigma vs Facteur Rho
La transcription est le processus par lequel les informations contenues dans l'ADN sont copiées dans une nouvelle molécule appelée ARNm (ARN messager). Cet ARNm est finalement impliqué dans la production d'une protéine spécifique. Le facteur sigma et le facteur rho sont deux facteurs importants pour la transcription bactérienne. Ce sont des protéines. Le facteur sigma participe à l'initiation de la transcription chez les bactéries. Le facteur Rho est responsable de la terminaison de la transcription chez les bactéries. Ainsi, ceci est le résumé de la différence entre le facteur sigma et le facteur rho.
